286 ENERGY = 0 T.syrichta RNase P RNA
    1 C       0    2   37    1
    2 C       1    3    0    2
    3 A       2    4    0    3
    4 C       3    5    0    4
    5 A       4    6    0    5
    6 A       5    7    0    6
    7 G       6    8    0    7
    8 C       7    9    0    8
    9 U       8   10    0    9
   10 G       9   11   27   10
   11 C      10   12   26   11
   12 A      11   13   25   12
   13 U      12   14   24   13
   14 G      13   15   23   14
   15 C      14   16    0   15
   16 C      15   17    0   16
   17 A      16   18    0   17
   18 C      17   19    0   18
   19 A      18   20    0   19
   20 U      19   21    0   20
   21 G      20   22    0   21
   22 U      21   23    0   22
   23 C      22   24   14   23
   24 A      23   25   13   24
   25 U      24   26   12   25
   26 C      25   27   11   26
   27 C      26   28   10   27
   28 C      27   29    0   28
   29 A      28   30    0   29
   30 C      29   31    0   30
   31 C      30   32    0   31
   32 C      31   33    0   32
   33 C      32   34    0   33
   34 C      33   35    0   34
   35 A      34   36    0   35
   36 U      35   37    0   36
   37 G      36   38    1   37
   38 U      37   39    0   38
   39 C      38   40    0   39
   40 C      39   41    0   40
   41 C      40   42    0   41
   42 U      41   43    0   42
   43 U      42   44    0   43
   44 G      43   45    0   44
   45 G      44   46    0   45
   46 G      45   47    0   46
   47 A      46   48    0   47
   48 A      47   49    0   48
   49 G      48   50    0   49
   50 G      49   51    0   50
   51 U      50   52    0   51
   52 C      51   53    0   52
   53 U      52   54    0   53
   54 G      53   55    0   54
   55 A      54   56    0   55
   56 G      55   57    0   56
   57 U      56   58    0   57
   58 C      57   59    0   58
   59 A      58   60    0   59
   60 A      59   61    0   60
   61 G      60   62    0   61
   62 G      61   63  227   62
   63 G      62   64  226   63
   64 C      63   65  225   64
   65 C      64   66  224   65
   66 A      65   67    0   66
   67 G      66   68    0   67
   68 A      67   69    0   68
   69 G      68   70    0   69
   70 C      69   71   84   70
   71 A      70   72   83   71
   72 C      71   73   82   72
   73 C      72   74   81   73
   74 C      73   75   80   74
   75 U      74   76    0   75
   76 A      75   77    0   76
   77 A      76   78    0   77
   78 C      77   79    0   78
   79 A      78   80    0   79
   80 G      79   81   74   80
   81 G      80   82   73   81
   82 A      81   83   72   82
   83 C      82   84   71   83
   84 U      83   85   70   84
   85 U      84   86  103   85
   86 U      85   87  102   86
   87 C      86   88  101   87
   88 C      87   89  100   88
   89 C      88   90   99   89
   90 U      89   91   98   90
   91 G      90   92   97   91
   92 A      91   93    0   92
   93 G      92   94    0   93
   94 U      93   95    0   94
   95 U      94   96    0   95
   96 U      95   97    0   96
   97 U      96   98   91   97
   98 G      97   99   90   98
   99 G      98  100   89   99
  100 G      99  101   88  100
  101 G     100  102   87  101
  102 A     101  103   86  102
  103 G     102  104   85  103
  104 G     103  105  223  104
  105 U     104  106  222  105
  106 G     105  107  221  106
  107 A     106  108  220  107
  108 A     107  109  219  108
  109 U     108  110  218  109
  110 U     109  111  217  110
  111 C     110  112    0  111
  112 C     111  113    0  112
  113 C     112  114    0  113
  114 A     113  115    0  114
  115 G     114  116    0  115
  116 A     115  117    0  116
  117 G     116  118    0  117
  118 A     117  119    0  118
  119 A     118  120    0  119
  120 C     119  121    0  120
  121 U     120  122    0  121
  122 C     121  123  209  122
  123 A     122  124  208  123
  124 G     123  125  207  124
  125 C     124  126    0  125
  126 U     125  127    0  126
  127 C     126  128    0  127
  128 C     127  129    0  128
  129 C     128  130    0  129
  130 U     129  131    0  130
  131 G     130  132    0  131
  132 C     131  133    0  132
  133 G     132  134    0  133
  134 A     133  135    0  134
  135 G     134  136    0  135
  136 G     135  137    0  136
  137 U     136  138    0  137
  138 C     137  139    0  138
  139 A     138  140    0  139
  140 G     139  141    0  140
  141 A     140  142    0  141
  142 C     141  143    0  142
  143 U     142  144    0  143
  144 G     143  145    0  144
  145 G     144  146    0  145
  146 G     145  147    0  146
  147 C     146  148    0  147
  148 U     147  149    0  148
  149 G     148  150    0  149
  150 G     149  151    0  150
  151 A     150  152    0  151
  152 C     151  153    0  152
  153 A     152  154    0  153
  154 U     153  155    0  154
  155 G     154  156    0  155
  156 C     155  157    0  156
  157 C     156  158    0  157
  158 A     157  159    0  158
  159 C     158  160    0  159
  160 G     159  161    0  160
  161 G     160  162    0  161
  162 A     161  163    0  162
  163 C     162  164    0  163
  164 C     163  165    0  164
  165 C     164  166    0  165
  166 A     165  167    0  166
  167 C     166  168    0  167
  168 C     167  169    0  168
  169 C     168  170    0  169
  170 U     169  171    0  170
  171 U     170  172    0  171
  172 C     171  173    0  172
  173 U     172  174    0  173
  174 G     173  175    0  174
  175 G     174  176    0  175
  176 G     175  177    0  176
  177 A     176  178    0  177
  178 A     177  179    0  178
  179 G     178  180    0  179
  180 G     179  181    0  180
  181 G     180  182    0  181
  182 C     181  183    0  182
  183 C     182  184    0  183
  184 A     183  185    0  184
  185 G     184  186    0  185
  186 G     185  187    0  186
  187 U     186  188    0  187
  188 G     187  189    0  188
  189 G     188  190    0  189
  190 A     189  191    0  190
  191 U     190  192    0  191
  192 G     191  193    0  192
  193 C     192  194    0  193
  194 C     193  195    0  194
  195 U     194  196    0  195
  196 C     195  197    0  196
  197 C     196  198    0  197
  198 U     197  199    0  198
  199 C     198  200    0  199
  200 A     199  201    0  200
  201 G     200  202    0  201
  202 C     201  203    0  202
  203 C     202  204    0  203
  204 A     203  205    0  204
  205 G     204  206    0  205
  206 A     205  207    0  206
  207 A     206  208  124  207
  208 C     207  209  123  208
  209 U     208  210  122  209
  210 U     209  211    0  210
  211 G     210  212    0  211
  212 G     211  213    0  212
  213 A     212  214    0  213
  214 A     213  215    0  214
  215 C     214  216    0  215
  216 A     215  217    0  216
  217 G     216  218  110  217
  218 A     217  219  109  218
  219 C     218  220  108  219
  220 U     219  221  107  220
  221 C     220  222  106  221
  222 A     221  223  105  222
  223 U     222  224  104  223
  224 G     223  225   65  224
  225 G     224  226   64  225
  226 C     225  227   63  226
  227 C     226  228   62  227
  228 A     227  229    0  228
  229 A     228  230    0  229
  230 C     229  231    0  230
  231 C     230  232    0  231
  232 A     231  233    0  232
  233 A     232  234    0  233
  234 G     233  235    0  234
  235 U     234  236    0  235
  236 G     235  237    0  236
  237 A     236  238    0  237
  238 G     237  239    0  238
  239 U     238  240    0  239
  240 U     239  241    0  240
  241 C     240  242    0  241
  242 A     241  243    0  242
  243 A     242  244    0  243
  244 U     243  245    0  244
  245 G     244  246    0  245
  246 A     245  247    0  246
  247 G     246  248    0  247
  248 G     247  249  275  248
  249 U     248  250  274  249
  250 G     249  251  273  250
  251 A     250  252  272  251
  252 G     251  253  271  252
  253 G     252  254  270  253
  254 C     253  255  269  254
  255 A     254  256  268  255
  256 C     255  257    0  256
  257 C     256  258  267  257
  258 C     257  259  266  258
  259 C     258  260    0  259
  260 A     259  261    0  260
  261 C     260  262    0  261
  262 C     261  263    0  262
  263 C     262  264    0  263
  264 A     263  265    0  264
  265 A     264  266    0  265
  266 G     265  267  258  266
  267 G     266  268  257  267
  268 G     267  269  255  268
  269 G     268  270  254  269
  270 C     269  271  253  270
  271 C     270  272  252  271
  272 U     271  273  251  272
  273 C     272  274  250  273
  274 A     273  275  249  274
  275 U     274  276  248  275
  276 A     275  277    0  276
  277 A     276  278    0  277
  278 C     277  279    0  278
  279 C     278  280    0  279
  280 C     279  281    0  280
  281 A     280  282    0  281
  282 A     281  283    0  282
  283 U     282  284    0  283
  284 U     283  285    0  284
  285 C     284  286    0  285
  286 A     285    0    0  286