273 ENERGY = 0 D.rerio RNase P RNA
    1 C       0    2    0    1
    2 G       1    3    0    2
    3 G       2    4    0    3
    4 A       3    5    0    4
    5 A       4    6    0    5
    6 G       5    7    0    6
    7 G       6    8    0    7
    8 A       7    9    0    8
    9 A       8   10    0    9
   10 G       9   11    0   10
   11 C      10   12  255   11
   12 U      11   13  254   12
   13 C      12   14  253   13
   14 A      13   15  252   14
   15 C      14   16    0   15
   16 U      15   17   60   16
   17 G      16   18   59   17
   18 U      17   19    0   18
   19 A      18   20    0   19
   20 G      19   21   58   20
   21 A      20   22   57   21
   22 G      21   23   56   22
   23 G      22   24   55   23
   24 U      23   25    0   24
   25 U      24   26    0   25
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   27 C      26   28    0   27
   28 C      27   29    0   28
   29 C      28   30    0   29
   30 A      29   31    0   30
   31 C      30   32    0   31
   32 U      31   33    0   32
   33 G      32   34   47   33
   34 A      33   35   46   34
   35 G      34   36   45   35
   36 U      35   37   44   36
   37 G      36   38   43   37
   38 C      37   39    0   38
   39 U      38   40    0   39
   40 C      39   41    0   40
   41 G      40   42    0   41
   42 U      41   43    0   42
   43 C      42   44   37   43
   44 A      43   45   36   44
   45 C      44   46   35   45
   46 U      45   47   34   46
   47 C      46   48   33   47
   48 G      47   49    0   48
   49 C      48   50    0   49
   50 C      49   51    0   50
   51 A      50   52    0   51
   52 A      51   53    0   52
   53 C      52   54    0   53
   54 A      53   55    0   54
   55 C      54   56   23   55
   56 C      55   57   22   56
   57 U      56   58   21   57
   58 C      57   59   20   58
   59 G      58   60   17   59
   60 G      59   61   16   60
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   62 G      61   63    0   62
   63 A      62   64    0   63
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   79 G      78   80  231   79
   80 C      79   81  230   80
   81 C      80   82  229   81
   82 A      81   83    0   82
   83 C      82   84    0   83
   84 U      83   85    0   84
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   86 G      85   87    0   86
   87 C      86   88    0   87
   88 U      87   89  102   88
   89 G      88   90  101   89
   90 U      89   91  100   90
   91 C      90   92   99   91
   92 C      91   93   98   92
   93 U      92   94    0   93
   94 A      93   95    0   94
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   98 G      97   99   92   98
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  100 A      99  101   90  100
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  102 A     101  103   88  102
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  104 C     103  105  116  104
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  107 C     106  108  113  107
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  109 G     108  110    0  109
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  113 G     112  114  107  113
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  115 U     114  116  105  115
  116 G     115  117  104  116
  117 A     116  118  103  117
  118 G     117  119  228  118
  119 C     118  120  227  119
  120 G     119  121  226  120
  121 A     120  122  225  121
  122 G     121  123  224  122
  123 U     122  124  223  123
  124 G     123  125  222  124
  125 C     124  126    0  125
  126 A     125  127    0  126
  127 C     126  128    0  127
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  137 G     136  138  214  137
  138 G     137  139  213  138
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  144 C     143  145    0  144
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  222 C     221  223  124  222
  223 A     222  224  123  223
  224 C     223  225  122  224
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  227 G     226  228  119  227
  228 C     227  229  118  228
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  230 G     229  231   80  230
  231 C     230  232   79  231
  232 U     231  233   78  232
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  257 U     256  258  270  257
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  262 U     261  263    0  262
  263 A     262  264    0  263
  264 A     263  265    0  264
  265 C     264  266    0  265
  266 U     265  267  261  266
  267 G     266  268  260  267
  268 C     267  269  259  268
  269 U     268  270  258  269
  270 A     269  271  257  270
  271 N     270  272  256  271
  272 a     271  273    0  272
  273 a     272    0    0  273