354 ENERGY = 0 S.castellii RNase P RNA
    1 A       0    2    0    1
    2 G       1    3    0    2
    3 U       2    4    0    3
    4 U       3    5  348    4
    5 G       4    6  347    5
    6 G       5    7  346    6
    7 A       6    8  345    7
    8 A       7    9  344    8
    9 C       8   10  343    9
   10 A       9   11  342   10
   11 G      10   12  341   11
   12 C      11   13  340   12
   13 G      12   14  339   13
   14 A      13   15  338   14
   15 C      14   16  337   15
   16 G      15   17  336   16
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   19 U      18   20  302   19
   20 C      19   21  301   20
   21 C      20   22  300   21
   22 U      21   23  299   22
   23 A      22   24  298   23
   24 C      23   25  297   24
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   34 A      33   35   75   34
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  262 U     261  263  271  262
  263 G     262  264  270  263
  264 U     263  265  269  264
  265 U     264  266    0  265
  266 U     265  267    0  266
  267 A     266  268    0  267
  268 C     267  269    0  268
  269 A     268  270  264  269
  270 C     269  271  263  270
  271 A     270  272  262  271
  272 G     271  273  261  272
  273 U     272  274  260  273
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  275 G     274  276  258  275
  276 U     275  277  257  276
  277 C     276  278  256  277
  278 C     277  279  255  278
  279 A     278  280    0  279
  280 G     279  281  254  280
  281 U     280  282  253  281
  282 C     281  283  252  282
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  292 C     291  293    0  292
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  296 C     295  297   25  296
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  300 G     299  301   21  300
  301 G     300  302   20  301
  302 A     301  303   19  302
  303 C     302  304  318  303
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  305 U     304  306  316  305
  306 G     305  307  315  306
  307 C     306  308  314  307
  308 C     307  309  313  308
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  313 G     312  314  308  313
  314 G     313  315  307  314
  315 C     314  316  306  315
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  323 C     322  324    0  323
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  325 A     324  326    0  325
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  331 A     330  332   82  331
  332 U     331  333   81  332
  333 U     332  334   80  333
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  342 U     341  343   10  342
  343 G     342  344    9  343
  344 U     343  345    8  344
  345 C     344  346    7  345
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  347 C     346  348    5  347
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  354 C     353    0    0  354