333 ENERGY = 0 P.canadensis RNase P RNA
    1 U       0    2    0    1
    2 U       1    3    0    2
    3 C       2    4    0    3
    4 C       3    5    0    4
    5 C       4    6    0    5
    6 U       5    7    0    6
    7 C       6    8    0    7
    8 C       7    9    0    8
    9 A       8   10    0    9
   10 A       9   11    0   10
   11 A      10   12    0   11
   12 G      11   13    0   12
   13 U      12   14  301   13
   14 C      13   15  300   14
   15 U      14   16  299   15
   16 G      15   17  298   16
   17 U      16   18  297   17
   18 A      17   19  296   18
   19 U      18   20  295   19
   20 U      19   21    0   20
   21 U      20   22    0   21
   22 U      21   23    0   22
   23 A      22   24   74   23
   24 C      23   25   73   24
   25 C      24   26   72   25
   26 U      25   27   71   26
   27 G      26   28   70   27
   28 C      27   29    0   28
   29 C      28   30    0   29
   30 U      29   31    0   30
   31 A      30   32    0   31
   32 C      31   33    0   32
   33 A      32   34    0   33
   34 A      33   35    0   34
   35 A      34   36    0   35
   36 A      35   37    0   36
   37 G      36   38    0   37
   38 G      37   39   61   38
   39 A      38   40   60   39
   40 G      39   41   59   40
   41 G      40   42   57   41
   42 A      41   43   56   42
   43 G      42   44   55   43
   44 U      43   45   54   44
   45 C      44   46   53   45
   46 C      45   47   52   46
   47 C      46   48    0   47
   48 C      47   49    0   48
   49 G      48   50    0   49
   50 G      49   51    0   50
   51 C      50   52    0   51
   52 G      51   53   46   52
   53 G      52   54   45   53
   54 A      53   55   44   54
   55 C      54   56   43   55
   56 U      55   57   42   56
   57 U      56   58   41   57
   58 C      57   59    0   58
   59 C      58   60   40   59
   60 U      59   61   39   60
   61 C      60   62   38   61
   62 A      61   63    0   62
   63 G      62   64    0   63
   64 U      63   65    0   64
   65 A      64   66    0   65
   66 U      65   67    0   66
   67 U      66   68    0   67
   68 C      67   69    0   68
   69 G      68   70    0   69
   70 C      69   71   27   70
   71 A      70   72   26   71
   72 G      71   73   25   72
   73 G      72   74   24   73
   74 U      73   75   23   74
   75 G      74   76    0   75
   76 G      75   77    0   76
   77 G      76   78    0   77
   78 A      77   79    0   78
   79 A      78   80    0   79
   80 A      79   81    0   80
   81 U      80   82    0   81
   82 U      81   83    0   82
   83 C      82   84    0   83
   84 G      83   85    0   84
   85 G      84   86    0   85
   86 U      85   87    0   86
   87 G      86   88    0   87
   88 A      87   89    0   88
   89 A      88   90    0   89
   90 A      89   91    0   90
   91 U      90   92    0   91
   92 C      91   93    0   92
   93 G      92   94    0   93
   94 C      93   95    0   94
   95 U      94   96    0   95
   96 C      95   97  246   96
   97 U      96   98  245   97
   98 G      97   99  244   98
   99 C      98  100  243   99
  100 C      99  101  242  100
  101 C     100  102  241  101
  102 A     101  103    0  102
  103 C     102  104    0  103
  104 C     103  105    0  104
  105 A     104  106    0  105
  106 G     105  107    0  106
  107 G     106  108    0  107
  108 G     107  109    0  108
  109 A     108  110    0  109
  110 A     109  111    0  110
  111 A     110  112    0  111
  112 A     111  113    0  112
  113 G     112  114    0  113
  114 G     113  115    0  114
  115 U     114  116    0  115
  116 A     115  117    0  116
  117 A     116  118    0  117
  118 A     117  119    0  118
  119 A     118  120    0  119
  120 C     119  121    0  120
  121 U     120  122    0  121
  122 C     121  123    0  122
  123 U     122  124    0  123
  124 C     123  125    0  124
  125 C     124  126    0  125
  126 C     125  127    0  126
  127 U     126  128    0  127
  128 G     127  129    0  128
  129 G     128  130    0  129
  130 U     129  131    0  130
  131 C     130  132    0  131
  132 C     131  133    0  132
  133 U     132  134    0  133
  134 U     133  135    0  134
  135 G     134  136    0  135
  136 G     135  137    0  136
  137 A     136  138    0  137
  138 A     137  139    0  138
  139 G     138  140    0  139
  140 G     139  141    0  140
  141 A     140  142    0  141
  142 C     141  143    0  142
  143 U     142  144    0  143
  144 U     143  145    0  144
  145 G     144  146    0  145
  146 U     145  147    0  146
  147 C     146  148    0  147
  148 C     147  149    0  148
  149 U     148  150    0  149
  150 U     149  151    0  150
  151 C     150  152    0  151
  152 U     151  153    0  152
  153 G     152  154    0  153
  154 A     153  155    0  154
  155 G     154  156    0  155
  156 U     155  157  167  156
  157 C     156  158  166  157
  158 U     157  159  165  158
  159 C     158  160  164  159
  160 G     159  161    0  160
  161 U     160  162    0  161
  162 G     161  163    0  162
  163 A     162  164    0  163
  164 G     163  165  159  164
  165 A     164  166  158  165
  166 G     165  167  157  166
  167 A     166  168  156  167
  168 U     167  169    0  168
  169 G     168  170    0  169
  170 C     169  171  189  170
  171 C     170  172  188  171
  172 A     171  173  187  172
  173 A     172  174  186  173
  174 G     173  175  185  174
  175 C     174  176  184  175
  176 G     175  177  183  176
  177 U     176  178  182  177
  178 G     177  179    0  178
  179 G     178  180    0  179
  180 A     179  181    0  180
  181 G     180  182    0  181
  182 A     181  183  177  182
  183 C     182  184  176  183
  184 G     183  185  175  184
  185 C     184  186  174  185
  186 U     185  187  173  186
  187 A     186  188  172  187
  188 G     187  189  171  188
  189 G     188  190  170  189
  190 G     189  191    0  190
  191 U     190  192    0  191
  192 G     191  193  239  192
  193 G     192  194  238  193
  194 U     193  195  237  194
  195 C     194  196  236  195
  196 G     195  197  235  196
  197 C     196  198  234  197
  198 C     197  199  233  198
  199 A     198  200    0  199
  200 U     199  201    0  200
  201 A     200  202    0  201
  202 A     201  203    0  202
  203 G     202  204    0  203
  204 A     203  205    0  204
  205 A     204  206    0  205
  206 A     205  207    0  206
  207 C     206  208    0  207
  208 U     207  209    0  208
  209 U     208  210    0  209
  210 C     209  211    0  210
  211 A     210  212  226  211
  212 A     211  213  225  212
  213 C     212  214  224  213
  214 A     213  215  223  214
  215 G     214  216  222  215
  216 G     215  217    0  216
  217 U     216  218    0  217
  218 C     217  219    0  218
  219 A     218  220    0  219
  220 C     219  221    0  220
  221 A     220  222    0  221
  222 C     221  223  215  222
  223 U     222  224  214  223
  224 G     223  225  213  224
  225 U     224  226  212  225
  226 U     225  227  211  226
  227 A     226  228    0  227
  228 U     227  229    0  228
  229 G     228  230    0  229
  230 G     229  231    0  230
  231 G     230  232    0  231
  232 A     231  233    0  232
  233 G     232  234  198  233
  234 G     233  235  197  234
  235 C     234  236  196  235
  236 G     235  237  195  236
  237 C     236  238  194  237
  238 C     237  239  193  238
  239 A     238  240  192  239
  240 C     239  241    0  240
  241 G     240  242  101  241
  242 G     241  243  100  242
  243 G     242  244   99  243
  244 C     243  245   98  244
  245 A     244  246   97  245
  246 G     245  247   96  246
  247 U     246  248    0  247
  248 U     247  249    0  248
  249 G     248  250    0  249
  250 G     249  251  281  250
  251 U     250  252  280  251
  252 C     251  253  279  252
  253 C     252  254  278  253
  254 C     253  255  277  254
  255 U     254  256  276  255
  256 U     255  257  275  256
  257 U     256  258  274  257
  258 G     257  259  273  258
  259 C     258  260  272  259
  260 A     259  261  271  260
  261 U     260  262  270  261
  262 C     261  263  269  262
  263 C     262  264  268  263
  264 A     263  265    0  264
  265 G     264  266    0  265
  266 A     265  267    0  266
  267 A     266  268    0  267
  268 G     267  269  263  268
  269 G     268  270  262  269
  270 A     269  271  261  270
  271 A     270  272  260  271
  272 G     271  273  259  272
  273 C     272  274  258  273
  274 U     273  275  257  274
  275 U     274  276  256  275
  276 U     275  277  255  276
  277 G     276  278  254  277
  278 G     277  279  253  278
  279 G     278  280  252  279
  280 G     279  281  251  280
  281 C     280  282  250  281
  282 U     281  283    0  282
  283 G     282  284    0  283
  284 U     283  285    0  284
  285 U     284  286    0  285
  286 G     285  287    0  286
  287 A     286  288    0  287
  288 G     287  289    0  288
  289 U     288  290    0  289
  290 G     289  291    0  290
  291 C     290  292    0  291
  292 A     291  293    0  292
  293 A     292  294    0  293
  294 U     293  295    0  294
  295 A     294  296   19  295
  296 U     295  297   18  296
  297 A     296  298   17  297
  298 C     297  299   16  298
  299 A     298  300   15  299
  300 G     299  301   14  300
  301 A     300  302   13  301
  302 G     301  303  331  302
  303 C     302  304  330  303
  304 G     303  305  329  304
  305 C     304  306  328  305
  306 U     305  307  326  306
  307 A     306  308  325  307
  308 G     307  309  324  308
  309 A     308  310  323  309
  310 A     309  311  322  310
  311 G     310  312  321  311
  312 G     311  313  320  312
  313 A     312  314  319  313
  314 G     313  315  318  314
  315 U     314  316    0  315
  316 C     315  317    0  316
  317 C     316  318    0  317
  318 U     317  319  314  318
  319 U     318  320  313  319
  320 C     319  321  312  320
  321 C     320  322  311  321
  322 U     321  323  310  322
  323 U     322  324  309  323
  324 C     323  325  308  324
  325 U     324  326  307  325
  326 A     325  327  306  326
  327 C     326  328    0  327
  328 G     327  329  305  328
  329 C     328  330  304  329
  330 G     329  331  303  330
  331 U     330  332  302  331
  332 A     331  333    0  332
  333 A     332    0    0  333