219 ENERGY = 0 K.thermotolerans RNase P RNA
    1 G       0    2    0    1
    2 A       1    3    0    2
    3 A       2    4    0    3
    4 C       3    5    0    4
    5 A       4    6    0    5
    6 C       5    7    0    6
    7 A       6    8    0    7
    8 G       7    9    0    8
    9 C       8   10    0    9
   10 G       9   11  152   10
   11 A      10   12  151   11
   12 G      11   13  150   12
   13 A      12   14  149   13
   14 C      13   15  148   14
   15 A      14   16  147   15
   16 A      15   17    0   16
   17 C      16   18    0   17
   18 A      17   19    0   18
   19 A      18   20    0   19
   20 U      19   21    0   20
   21 C      20   22    0   21
   22 G      21   23    0   22
   23 C      22   24    0   23
   24 C      23   25    0   24
   25 A      24   26    0   25
   26 G      25   27    0   26
   27 G      26   28    0   27
   28 G      27   29    0   28
   29 G      28   30    0   29
   30 C      29   31    0   30
   31 U      30   32    0   31
   32 U      31   33    0   32
   33 C      32   34    0   33
   34 G      33   35    0   34
   35 G      34   36    0   35
   36 C      35   37    0   36
   37 C      36   38    0   37
   38 C      37   39    0   38
   39 U      38   40    0   39
   40 G      39   41    0   40
   41 A      40   42    0   41
   42 U      41   43   55   42
   43 U      42   44   54   43
   44 C      43   45   53   44
   45 U      44   46   52   45
   46 C      45   47   51   46
   47 G      46   48    0   47
   48 U      47   49    0   48
   49 G      48   50    0   49
   50 A      49   51    0   50
   51 G      50   52   46   51
   52 A      51   53   45   52
   53 G      52   54   44   53
   54 A      53   55   43   54
   55 A      54   56   42   55
   56 G      55   57   71   56
   57 C      56   58   70   57
   58 C      57   59   69   58
   59 G      58   60   68   59
   60 C      59   61   67   60
   61 U      60   62   66   61
   62 G      61   63    0   62
   63 G      62   64    0   63
   64 A      63   65    0   64
   65 A      64   66    0   65
   66 A      65   67   61   66
   67 G      66   68   60   67
   68 C      67   69   59   68
   69 G      68   70   58   69
   70 G      69   71   57   70
   71 U      70   72   56   71
   72 U      71   73    0   72
   73 G      72   74    0   73
   74 U      73   75    0   74
   75 G      74   76    0   75
   76 G      75   77    0   76
   77 G      76   78    0   77
   78 C      77   79  144   78
   79 G      78   80  143   79
   80 C      79   81  142   80
   81 U      80   82  141   81
   82 G      81   83  140   82
   83 U      82   84  139   83
   84 C      83   85  138   84
   85 A      84   86    0   85
   86 U      85   87    0   86
   87 C      86   88    0   87
   88 A      87   89    0   88
   89 G      88   90    0   89
   90 A      89   91    0   90
   91 A      90   92    0   91
   92 A      91   93    0   92
   93 U      92   94    0   93
   94 A      93   95    0   94
   95 C      94   96    0   95
   96 A      95   97    0   96
   97 C      96   98    0   97
   98 A      97   99    0   98
   99 U      98  100    0   99
  100 G      99  101  126  100
  101 U     100  102  125  101
  102 U     101  103  124  102
  103 G     102  104  123  103
  104 G     103  105  121  104
  105 C     104  106  120  105
  106 C     105  107  119  106
  107 G     106  108  118  107
  108 G     107  109  117  108
  109 C     108  110  116  109
  110 G     109  111  115  110
  111 C     110  112    0  111
  112 U     111  113    0  112
  113 A     112  114    0  113
  114 U     113  115    0  114
  115 C     114  116  110  115
  116 G     115  117  109  116
  117 C     116  118  108  117
  118 C     117  119  107  118
  119 G     118  120  106  119
  120 C     119  121  105  120
  121 A     120  122  104  121
  122 C     121  123    0  122
  123 C     122  124  103  123
  124 A     123  125  102  124
  125 A     124  126  101  125
  126 U     125  127  100  126
  127 G     126  128    0  127
  128 U     127  129    0  128
  129 G     128  130    0  129
  130 A     129  131    0  130
  131 U     130  132    0  131
  132 G     131  133    0  132
  133 G     132  134    0  133
  134 G     133  135    0  134
  135 A     134  136    0  135
  136 A     135  137    0  136
  137 A     136  138    0  137
  138 G     137  139   84  138
  139 G     138  140   83  139
  140 C     139  141   82  140
  141 A     140  142   81  141
  142 G     141  143   80  142
  143 C     142  144   79  143
  144 G     143  145   78  144
  145 G     144  146    0  145
  146 A     145  147    0  146
  147 U     146  148   15  147
  148 G     147  149   14  148
  149 U     148  150   13  149
  150 C     149  151   12  150
  151 U     150  152   11  151
  152 C     151  153   10  152
  153 G     152  154    0  153
  154 U     153  155    0  154
  155 U     154  156    0  155
  156 U     155  157    0  156
  157 G     156  158  179  157
  158 A     157  159  178  158
  159 C     158  160  177  159
  160 U     159  161  175  160
  161 U     160  162  174  161
  162 U     161  163  173  162
  163 G     162  164  171  163
  164 C     163  165  170  164
  165 C     164  166    0  165
  166 U     165  167    0  166
  167 U     166  168    0  167
  168 A     167  169    0  168
  169 G     168  170    0  169
  170 G     169  171  164  170
  171 G     170  172  163  171
  172 U     171  173    0  172
  173 A     172  174  162  173
  174 A     173  175  161  174
  175 A     174  176  160  175
  176 G     175  177    0  176
  177 G     176  178  159  177
  178 U     177  179  158  178
  179 C     178  180  157  179
  180 U     179  181    0  180
  181 G     180  182    0  181
  182 U     181  183    0  182
  183 U     182  184    0  183
  184 G     183  185    0  184
  185 A     184  186    0  185
  186 G     185  187    0  186
  187 U     186  188    0  187
  188 G     187  189    0  188
  189 C     188  190    0  189
  190 A     189  191    0  190
  191 A     190  192    0  191
  192 U     191  193    0  192
  193 G     192  194    0  193
  194 G     193  195    0  194
  195 U     194  196    0  195
  196 A     195  197    0  196
  197 G     196  198    0  197
  198 G     197  199    0  198
  199 A     198  200    0  199
  200 G     199  201  217  200
  201 G     200  202  216  201
  202 C     201  203  215  202
  203 C     202  204  214  203
  204 G     203  205  213  204
  205 C     204  206  212  205
  206 U     205  207  211  206
  207 U     206  208    0  207
  208 U     207  209    0  208
  209 A     208  210    0  209
  210 U     209  211    0  210
  211 G     210  212  206  211
  212 G     211  213  205  212
  213 U     212  214  204  213
  214 G     213  215  203  214
  215 G     214  216  202  215
  216 C     215  217  201  216
  217 C     216  218  200  217
  218 A     217  219    0  218
  219 A     218    0    0  219