317 ENERGY = 0 E.eschsholtzii RNase P RNA
    1 g       0    2    0    1
    2 c       1    3    0    2
    3 g       2    4    0    3
    4 g       3    5    0    4
    5 a       4    6    0    5
    6 a       5    7  317    6
    7 g       6    8  316    7
    8 g       7    9  315    8
    9 a       8   10    0    9
   10 a       9   11    0   10
   11 g      10   12    0   11
   12 c      11   13  275   12
   13 u      12   14  274   13
   14 c      13   15  273   14
   15 a      14   16  272   15
   16 c      15   17    0   16
   17 u      16   18    0   17
   18 g      17   19    0   18
   19 u      18   20    0   19
   20 a      19   21    0   20
   21 g      20   22   59   21
   22 a      21   23   58   22
   23 g      22   24   57   23
   24 g      23   25   56   24
   25 U      24   26    0   25
   26 C      25   27    0   26
   27 A      26   28    0   27
   28 U      27   29    0   28
   29 G      28   30    0   29
   30 U      29   31    0   30
   31 G      30   32    0   31
   32 C      31   33    0   32
   33 C      32   34    0   33
   34 G      33   35   50   34
   35 A      34   36   49   35
   36 G      35   37   48   36
   37 U      36   38   47   37
   38 A      37   39   46   38
   39 C      38   40    0   39
   40 A      39   41    0   40
   41 U      40   42    0   41
   42 U      41   43    0   42
   43 U      42   44    0   43
   44 G      43   45    0   44
   45 U      44   46    0   45
   46 U      45   47   38   46
   47 A      46   48   37   47
   48 C      47   49   36   48
   49 U      48   50   35   49
   50 C      49   51   34   50
   51 U      50   52    0   51
   52 C      51   53    0   52
   53 U      52   54    0   53
   54 C      53   55    0   54
   55 A      54   56    0   55
   56 C      55   57   24   56
   57 C      56   58   23   57
   58 U      57   59   22   58
   59 U      58   60   21   59
   60 G      59   61    0   60
   61 G      60   62    0   61
   62 G      61   63    0   62
   63 G      62   64    0   63
   64 A      63   65    0   64
   65 A      64   66    0   65
   66 G      65   67    0   66
   67 G      66   68    0   67
   68 U      67   69    0   68
   69 C      68   70    0   69
   70 U      69   71    0   70
   71 G      70   72    0   71
   72 A      71   73    0   72
   73 G      72   74    0   73
   74 A      73   75    0   74
   75 C      74   76    0   75
   76 A      75   77    0   76
   77 A      76   78    0   77
   78 G      77   79    0   78
   79 A      78   80  248   79
   80 G      79   81  247   80
   81 C      80   82  246   81
   82 C      81   83  245   82
   83 G      82   84    0   83
   84 U      83   85    0   84
   85 U      84   86    0   85
   86 U      85   87    0   86
   87 C      86   88    0   87
   88 U      87   89  102   88
   89 G      88   90  101   89
   90 U      89   91  100   90
   91 C      90   92   99   91
   92 C      91   93   98   92
   93 U      92   94    0   93
   94 U      93   95    0   94
   95 G      94   96    0   95
   96 C      95   97    0   96
   97 A      96   98    0   97
   98 G      97   99   92   98
   99 G      98  100   91   99
  100 A      99  101   90  100
  101 C     100  102   89  101
  102 A     101  103   88  102
  103 U     102  104  119  103
  104 C     103  105  118  104
  105 U     104  106  117  105
  106 U     105  107  116  106
  107 C     106  108  115  107
  108 C     107  109  114  108
  109 G     108  110  113  109
  110 A     109  111    0  110
  111 G     110  112    0  111
  112 C     111  113    0  112
  113 C     112  114  109  113
  114 G     113  115  108  114
  115 G     114  116  107  115
  116 G     115  117  106  116
  117 A     116  118  105  117
  118 G     117  119  104  118
  119 A     118  120  103  119
  120 G     119  121  244  120
  121 C     120  122  243  121
  122 G     121  123  242  122
  123 A     122  124  241  123
  124 G     123  125  240  124
  125 C     124  126  239  125
  126 U     125  127  238  126
  127 C     126  128    0  127
  128 C     127  129    0  128
  129 C     128  130    0  129
  130 A     129  131    0  130
  131 G     130  132    0  131
  132 A     131  133    0  132
  133 C     132  134    0  133
  134 A     133  135    0  134
  135 C     134  136    0  135
  136 U     135  137    0  136
  137 C     136  138    0  137
  138 G     137  139    0  138
  139 G     138  140    0  139
  140 U     139  141  229  140
  141 G     140  142  228  141
  142 C     141  143  227  142
  143 A     142  144    0  143
  144 U     143  145    0  144
  145 G     144  146    0  145
  146 G     145  147    0  146
  147 A     146  148    0  147
  148 G     147  149    0  148
  149 G     148  150    0  149
  150 G     149  151    0  150
  151 G     150  152    0  151
  152 U     151  153    0  152
  153 U     152  154    0  153
  154 U     153  155    0  154
  155 G     154  156    0  155
  156 C     155  157    0  156
  157 A     156  158    0  157
  158 C     157  159    0  158
  159 A     158  160    0  159
  160 A     159  161    0  160
  161 G     160  162    0  161
  162 A     161  163    0  162
  163 U     162  164    0  163
  164 G     163  165    0  164
  165 C     164  166    0  165
  166 U     165  167    0  166
  167 A     166  168    0  167
  168 G     167  169    0  168
  169 U     168  170    0  169
  170 U     169  171    0  170
  171 A     170  172    0  171
  172 G     171  173    0  172
  173 U     172  174    0  173
  174 A     173  175    0  174
  175 G     174  176    0  175
  176 U     175  177    0  176
  177 U     176  178    0  177
  178 G     177  179    0  178
  179 G     178  180    0  179
  180 U     179  181    0  180
  181 G     180  182    0  181
  182 G     181  183    0  182
  183 C     182  184    0  183
  184 U     183  185    0  184
  185 U     184  186    0  185
  186 G     185  187    0  186
  187 A     186  188    0  187
  188 U     187  189    0  188
  189 A     188  190    0  189
  190 C     189  191    0  190
  191 U     190  192    0  191
  192 G     191  193    0  192
  193 C     192  194    0  193
  194 C     193  195    0  194
  195 U     194  196    0  195
  196 U     195  197    0  196
  197 C     196  198    0  197
  198 C     197  199    0  198
  199 C     198  200    0  199
  200 U     199  201    0  200
  201 G     200  202    0  201
  202 G     201  203    0  202
  203 A     202  204    0  203
  204 C     203  205    0  204
  205 U     204  206    0  205
  206 A     205  207    0  206
  207 G     206  208    0  207
  208 U     207  209    0  208
  209 U     208  210    0  209
  210 G     209  211    0  210
  211 A     210  212    0  211
  212 U     211  213    0  212
  213 G     212  214    0  213
  214 C     213  215    0  214
  215 C     214  216    0  215
  216 U     215  217    0  216
  217 A     216  218    0  217
  218 U     217  219    0  218
  219 U     218  220    0  219
  220 C     219  221    0  220
  221 A     220  222    0  221
  222 U     221  223    0  222
  223 C     222  224    0  223
  224 U     223  225    0  224
  225 G     224  226    0  225
  226 G     225  227    0  226
  227 G     226  228  142  227
  228 C     227  229  141  228
  229 A     228  230  140  229
  230 U     229  231    0  230
  231 U     230  232    0  231
  232 G     231  233    0  232
  233 G     232  234    0  233
  234 A     233  235    0  234
  235 A     234  236    0  235
  236 G     235  237    0  236
  237 U     236  238    0  237
  238 G     237  239  126  238
  239 G     238  240  125  239
  240 C     239  241  124  240
  241 U     240  242  123  241
  242 U     241  243  122  242
  243 G     242  244  121  243
  244 U     243  245  120  244
  245 G     244  246   82  245
  246 G     245  247   81  246
  247 C     246  248   80  247
  248 U     247  249   79  248
  249 A     248  250    0  249
  250 G     249  251    0  250
  251 C     250  252    0  251
  252 A     251  253    0  252
  253 U     252  254    0  253
  254 G     253  255    0  254
  255 G     254  256    0  255
  256 C     255  257    0  256
  257 A     256  258    0  257
  258 C     257  259    0  258
  259 U     258  260    0  259
  260 G     259  261    0  260
  261 A     260  262    0  261
  262 G     261  263    0  262
  263 U     262  264    0  263
  264 C     263  265    0  264
  265 C     264  266    0  265
  266 A     265  267    0  266
  267 A     266  268    0  267
  268 U     267  269    0  268
  269 G     268  270    0  269
  270 G     269  271    0  270
  271 A     270  272    0  271
  272 U     271  273   15  272
  273 G     272  274   14  273
  274 A     273  275   13  274
  275 G     274  276   12  275
  276 G     275  277  295  276
  277 U     276  278  294  277
  278 G     277  279  293  278
  279 A     278  280  292  279
  280 G     279  281  291  280
  281 G     280  282  290  281
  282 C     281  283  289  282
  283 A     282  284    0  283
  284 A     283  285    0  284
  285 C     284  286    0  285
  286 U     285  287    0  286
  287 G     286  288    0  287
  288 U     287  289    0  288
  289 G     288  290  282  289
  290 C     289  291  281  290
  291 C     290  292  280  291
  292 U     291  293  279  292
  293 C     292  294  278  293
  294 A     293  295  277  294
  295 U     294  296  276  295
  296 a     295  297    0  296
  297 a     296  298    0  297
  298 c     297  299    0  298
  299 c     298  300    0  299
  300 c     299  301    0  300
  301 a     300  302    0  301
  302 a     301  303    0  302
  303 u     302  304    0  303
  304 u     303  305    0  304
  305 c     304  306    0  305
  306 a     305  307    0  306
  307 g     306  308    0  307
  308 a     307  309    0  308
  309 c     308  310    0  309
  310 c     309  311    0  310
  311 a     310  312    0  311
  312 c     311  313    0  312
  313 u     312  314    0  313
  314 c     313  315    0  314
  315 u     314  316    8  315
  316 c     315  317    7  316
  317 c     316    0    6  317