LOCUS helices 1570 bp DEFINITION helices 1570 bp, 1570 bases, 1ACF45C4 checksum. ORIGIN 1 -----AAAAA A-AAA--AAB BBBBBB--CC ---CCCC-C- -C-C---CCC 51 C-CCCCCC-C CCC------- --CCCCCCCC C-CCCC-C-- --CC-CC-C- 101 CCCC----DD D-DDDDDEEE EE---FFFFF FFF--GGG-G GHHHHHH--- 151 ---------- ---------- ---------- ------HHHH -HHIII-II- 201 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 251 ---------- ---------- -----IIII- I-JJ------ KKKKK----- 301 ---------- LLLLL----- ---------- ---------- ---------- 351 -LL------- ---------- ---------L -----LL--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --LL------ ---------- 451 ---LLL--LL LL-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------L LLLLLLL--- LL-------- -LL-LLLLL- 551 L-LL-LLLLL L--------- ---------- ---------- ---------- 601 ---------- ---------- --LLLLLLLL -LLLLLLLLL L--------- 651 -----LLL-L LLL-L-LL-L -------L-- LL-------- -----L---- 701 --------L- ---L---L-L ---L-L-L-- -LLL--L--- L--------- 751 MMMM------ ---------- ---------- ---------M M-------MM 801 -MMMMNN--- NNN---NNN- NNNN------ ---------- ---------- 851 ----NNN-NN --NNN----N N--------- ---------- ---------- 901 ---------K K-K---KKJJ GGGGG---EE EEE---OOOO ---------- 951 ---------- ---------- ---------- -------PPP PP-PPP---- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- --QQQQ-QQQ ---------- ---------- 1101 ---------- ---------F F-FFFFFF-- ---QQ-Q-QQ QQ-------- 1151 ---------- ---------- -------PPP -PPPPP---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- -------O-O 1251 OO-------- ---------- ---------- ---------- -----RRR-R 1301 R-RRR----- ---------- ----RRR-RR R--R-R---- -------BBB 1351 BBBB------ -SSSS-s--- SS--S---S- sSSS--SsSS SSsS--SSS- 1401 sSSS------ ---------- ---------- ---SSSsSSS SsSSS--Ss- 1451 -S-SS----- S-sS-S-S-- ----Ss-S-- S--S-S---- ----DDDDDD 1501 DD-A--A-AA AA----AAAA A--------- ---TTTTTT- TTTTTTTT-- 1551 ------TTTT TTTTTTTTTT // LOCUS helices 1570 bp DEFINITION helices 1570 bp, 1570 bases, C4F9DF5F checksum. ORIGIN 1 .....<---- -Pi----->< -Pii->--<- ---------- -P-iii---- 51 ---------- -->--Liii- --<------- ------Piii ---------- 101 --->-CRI<- -Piv--><-P v>---<--Pv i->--<------Pv 151 iii------- >--Lviii-- -<-------P viii------ --><------ 201 --------Pv ix-------- ----->---- ----Lvix-- ------<--- 251 ---------- -Pvix----- ---------- >-Px------ --CRI 301 I--------- <--Pxii--- ---------- ---------- ---------- 351 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---->----L xii-----<- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---------- Pxii------ >-CRIII--- 751 <--------- ------Pxii i--------- ---------- >-Lxiii-<---- -Pxiv----- ->-------- -------Lxi v--------- 851 ----<----- -Pxiv----- >--------- ---------- ---------- 901 ---------< --Pxi-->Px ---<- Pv>--- ---------- 951 ---------- ---------- ---------- -------<-P xvi-->---- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- --<-Pxvii> ---------- ---------- 1101 ---------- ---------< --Pvi-->-- ---<-Pxvii ->-------- 1151 ---------- ---------- -------<-P xvi-->---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- ACCR----------- ---------- ---------- ---------- -----<---- 1301 Pxviii---> Lxviii<--- ---Pxviii- ----->---C RIV----<-P 1351 ii->------ -<-------- ---------- -----Pxix- ---------- 1401 ---------- --->---Lxi x---<----- ---------- ---------- 1451 --Pxix---- ---------- ---------- ----->--CR V---<--Piv 1501 ->-<------ Pi-------- >--------- ---<-----P xx----->-- 1551 Lxx---<--- -Pxx-----> // LOCUS pairing_mask 1570 bp DEFINITION pairing_mask 1570 bp, 1570 bases, AFBCB530 checksum. ORIGIN 1 -----((((( (-(((--((( ((((((--(( ---((((-(- -(-(---((( 51 (-((((((-( (((------- --)))))))) )-))))-)-- --))-))-)- 101 ))))----[[ [-[[[[[((( ((---[[[[[ [[[--(((-( (((((((--( 151 (((((((((( (--------- -))-)))))) ))))--)))) -))(((-((- 201 --(((----- (-(((-(((( ((((((---- ---------- ------)))) 251 -))))))--- -))--)))-- -)-)-))))- )-((------ (((((----- 301 ---------- (((((---(( (-(((((((- -----))))) )))))----- 351 -((-(((((( (((---)))) )))))----( -----((((( (((((---)) 401 ))))))(((( ((((------ ))))))))-- --((------ (((((---)) 451 )))(((--(( ((-((((((- ---))))))- --(((((((( (((((----) 501 )))))))))) ))-------( (((((((--- ((-------- -((-(((((- 551 (-((-((((( (((((((((( -((((((((( (((((----- --------)) 601 )))))))))) )))))))))) )-)))))))) -))))))))) )--------- 651 -----)))-) )))-)-))-) -------)-- ))-------- -----)(((( 701 ----)))))- ---)---)-) ---)-)-)-- -)))--)--- )--------- 751 (((((-(((( ----)))))( (((((((--- -))))))))( (-------)) 801 -))))((--- (((---(((- ((---(((-- (((((----- ---))))))) 851 )---)))-)) --)))----) )-(((-(--( ((((((---- --)))))))- 901 -)-)))---) )-)---)))) )))))---)) )))---(((( -----((((- 951 -((((--((( ------)))- --)))))))) -------((( ((-(((---- 1001 -----((((( --(((((((( ((((((---- ------)))) )))-))))-- 1051 )-))------ )))))----- --((((-((( ---((((((( ((----)))) 1101 (((------- )))-)))))] ]-]]]]]]-- ---))-)-)) ))--(((((( 1151 ((((----)) ))-))))))- -------))) -)))))---- -((((((((( 1201 (((((--((( ((----)))) )--))))))) )))))))--- -------)-) 1251 ))---((((( ((-------- ---------- --)))))))- -----(((-( 1301 (-(((((((( ------)))) )---)))-)) )--)-)---- -------))) 1351 ))))------ -((((-(--- ((--(---(- ((((--(((( ((((--(((- 1401 ((((--(((( ((((------ ----))))-) )))))))))) )))))--))- 1451 -)-))----- )-))-)-)-- ----))-)-- )--)-)---- ----]]]]]] 1501 ]]-)--)-)) ))----)))) )--------- ---((((((- ((((((((-- 1551 ------)))) )))))))))) // LOCUS EP2 1570 bp DEFINITION EP2, 1570 bases, D77ACC4C checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcAA -CACA----G GGC-AACC-U GCU-UUC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GAA- -AGGUC-UC- 201 --G------- ---------- ---------- ---UUUAUU- ---------- 251 ---------- ---------- ---C-GGGAA C-AGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUA--A CUACU----- ---------- ---------- ---------- 351 -UC------- ---------- ---------G -----A---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------U ---C-G-G-- -AGAAAA--- G-GUGAAAA- 751 CGUG------ ---------- ---------- ---------A GGUAAGAGCU 801 -CACGAU--- AUU---GUU- UAGU------ ---------- ---------- 851 --GAUAG-GC --GAU----A G--------- ---------- ---------- 901 --------GG G-AAA-ACCU CAGGU---G- UUGAAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AAAUC UC-AGUA--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GA-AGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-U-UC ----UGUG-- 1151 -----CCG-- -----CAUA- ----GCCGCU -GAGAA---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGAU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-UUC-G 1301 U-CGA----- --GCAA---- ----UUG-CC G--A-ACU-A GAUAAAUGAU 1351 AGAACA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CAac agaacucggu 1501 uuac...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS EP27 1570 bp DEFINITION EP27, 1570 bases, 1B8073A3 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ggggaggaaa guccgggcUC -CAUA----G GGC-AGCG-U GCU-CGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCG- -AGGCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGA C-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAACAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CA------- ---------- ---------U -----UG--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------C-A ---A-U-G-- -GGUAAG--- G-GCGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCGG--- CGG---UGU- G-GC------ ---------- ---------- 851 --GA-CA-UG --CCG---GC C--------- ---------- ---------- 901 --------UG G-CAA-ACCC CACGC---G- GAGCAAGGAA CAGU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UG----C--- 1001 -----CCCCG --GU------ ---------U UCG------- ---------- 1051 --AC------ CGGGG----- -A--GC-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-GC ---------- 1151 ---------- ---------- ----AGA--C -AUCC----- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--GU-U 1251 CCGCA----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-G 1301 G-ACA----- --GCAA---- ----UGU-CC G--U-CCA-A GAUAGAUAAU 1351 CACUCG---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uuac...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS EP4 1570 bp DEFINITION EP4, 1570 bases, 7ACE3D16 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ..CGAGGAAA GUCCGAGCAC -CACA----G GGC-AGAG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------CCC- -GGCGA-UG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CAUCA G-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAGAA--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -C-------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUC------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- -------G-- -GGCAAG--- G-AUGGAAU- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------A GGCAAGAGCU 801 -CACCGG--- CGA---UCC- G-GC------ ---------- ---------- 851 --GAC-G-GA --CCG---GC C--------- ---------- ---------- 901 --------AU G-UAA-ACCC CACUC---G- GUGCAAGAUU GGA------- 951 ---------- ---------- ---------- -----AUGGG AG-C--AUU- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------C AA---C-AGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-Cc------ ---GC-U-G- ---------- 1151 ---------- ---------- ------C--G -CUCCU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- --UA--UA-A 1251 UCGCA----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-G 1301 U-UUG----- --GCAA---- ----CAG-GC G--G-CCUUA GAUAGAUAAU 1351 CGUC------ -CGCA-G--- G--------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCG A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ----CC-U-- G--C-G--ac agaacucggc 1501 uuac...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS EP1 1570 bp DEFINITION EP1, 1570 bases, 57CA7D28 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAAC----G GGC-GCAG-U GCU-GGU--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------ACC- -AGGGG-UC- 201 --ACU----- C-UC------ ---------- ----GAAA-- ---------- 251 ---------- --G--AGA-- -G-G-GGCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAAUAU-A CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -UA------- ---------- ---------G -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GA------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------AG CUC------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------U- ---U---U-U ---C-U-G-- -AGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACC-G--- GGU---UUU- AGGC------ ---------- ---------- 851 --GACUA-AG --ACC---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-CAA-ACCC CACUG---G- GAGCAAAACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA AA-CUGG--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U-----AGU A--------- ---------- 1101 -----GAGGC ---------G CCUC------ ---GC-U--- ---------- 1151 ---------- ---------- ---CGAAUGG -UUUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU-ACG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCU-U 1301 U-GGG----- --GCAA---- ----CUC-AA A--G-CCA-A GAUGAAUGAU 1351 CGUC------ -UCCU-A--- GG--A----- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GAA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -----U-C-- ----CU-U-- G-AUAG--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.tumefaciens 1570 bp DEFINITION A.tumefaciens 1570 bp, 1570 bases, 2B46838B checksum. ORIGIN 1 .....CCAGU U-GGC--CGG GCAGCC-GCG ---CCUU-A- -C-CAAUGUC 51 ---------- -----GAAA- ---------- ----GA-C-- --GG-UA-A- 101 GGUGAGGAAA GUCCGGGCUC -C--A-CGGA AAU-ACGG-U GCC-GGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCC- -GGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCCA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UU-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-A-U-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACC-G--- CGC---CGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --GACAG-UG --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AAG G-UAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAGACC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UG-AC-ACG- 1001 -----GGGCG --GGC----- ---------G AAA------- ---------- 1051 G-CC------ UGUUC----A CA-----GCC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-UUCCG--- ---GG-C--- ---------- 1151 ---------- ---------- -----CC-GU -CAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--GG-G 1251 UUGCG----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 G-CAU----- --GCAA---- ----AUG-CC G--U-CCC-A GAUGAAUGGC 1351 UGCC------ -ACGU-U--- CC--G---G- ---------- ---------- 1401 ---------- ------GUCA AA-------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---C-C-G-- ----GG-G-- CC-A-U--AC AGAACCCGGC 1501 UUAC-AG-GC CA----ACUG GCGAA..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.crescentus 1570 bp DEFINITION C.crescentus 1570 bp, 1570 bases, B7793119 checksum. ORIGIN 1 .CGGACCAGA U-GAU--CGG GCGGUC-GCG ---UCGU-C- ---------- 51 ---------- -----UUCG- ---------- ---------- -----GA-C- 101 GCCGAGGAAA GUCCGGGCUC -C--A-CGGU GAC-AAGG-C GGU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -ACCGG-GA- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----UCCCA G-GGA---UA GCGCC--ACA 301 GAAAGCAA-A CCUCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UC------- ---------- ---------C -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U ACG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---G-G-C-- -GGGAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACC-G--- CGG---ACC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --GACAG-GG --ACG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-CAA-GCCC CGCCU---G- GAGCAAGACC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--CGCG 1001 -----UCGGC ---------- ---------C UCGC------ ---------- 1051 ---------- GCCGA----- ---CUA-GGC C--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-CACUG--- ---GC-U-GA G--------- 1151 ---------- ---------- ------A--G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UCGCG----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GCC-G 1301 U-CCA----- --GCAA---- ----UGG-CC G--G-CCU-A GAGGAAUGAU 1351 CGUC------ -GCCG-U--- CU--C---C- CUGU--C--- ---------- 1401 ---------- -------UUC G--------- ---------- ---------- 1451 -G-AU----- G-GGCG-G-- ----GG-C-- G--G-A--AC AGAACCCGGC 1501 UUAC-AG-AU CA----UCUG GUCCG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS R.capsulatus 1570 bp DEFINITION R.capsulatus 1570 bp, 1570 bases, 3FC45E89 checksum. ORIGIN 1 .....GCGGA A-GAC--CGG AUGACC-GCG ---GCGG-C- -C-C---AUA 51 G-CUCCG--- -----UUUUU -------CGG A-UAGC-U-- --GG-GC-C- 101 UCCGAGGAAA GUCCGGACUC -C--A-UGAA GCA-ACGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -GGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCCA G-GGA---AA GCGCC--ACA 301 GAGAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CC------- ---------- ---------G ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---C-G-G-- -GGUGAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACC-G--- CGG---GAC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAG-GA --CCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-CAA-GCCC CACCG---G- GAGCAACGCC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UG-CC-GC-- 1001 -----GCCGC --AACCG--- ---------G AAA------- ------CG-- 1051 G-GG-----G ACGGC----- -A---G-GGG A--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UUCG---- ---CC-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- -----GA-GG -UGUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 CGGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-U 1301 G-CGG----- --GUGA---- ----CCG-CA G--A-CCC-A GAGGAAUGGU 1351 CAUC------ -CAGG-G--- G--------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ----CC-C-- C--G-G--AC AAAAUCCGGC 1501 UUAC-AG-GU CU----UCCG CGCGC..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS R.palustris 1570 bp DEFINITION R.palustris 1570 bp, 1570 bases, 4E96488D checksum. ORIGIN 1 .....UCAGU C-GGC--CGG ACGGCC-GCU ---CCGG-CA AGUG---CC- 51 ---------- -----GAAA- ---------- -----G-G-- --CC-GC-C- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -C--A-UCGA CAU-ACGG-U GCC-GGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCC- -GGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCCA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAACGA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CG------- ---------- ---------C -----CU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UC------ GCAGCUUCGC 451 UGCUUC--GG CG-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------C GGCAAGC--- C--------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- G--------- 651 -----GCU-C GCU-G-CG-C -------C-- AU-------- -----AACCC 701 GCAAGGGUG- ---A---A-G ---G-C-G-- -AGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGU---CGC- CGGC------ ---------- ---------- 851 --AACGG-GG --ACG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-UAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAAACC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA CG-GC-AUC- 1001 -----GCGGA UAGUUCGCUG ---------C UCG------- --C-AGCGAU 1051 A-AC------ UCCGC----- -A---G-GGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------A U-GUCAG--- ---GC-U-C- ---------- 1151 ---------- ---------- --------GC -CGUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-G 1301 C-UGU----- --GCAA---- ----ACA-GU G--U-CCC-A GAGGAAUGGC 1351 CGUC------ -GCGC-A--- UC--G---C- CUCC------ ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---GG----- A-AG-C-G-- ----GU-G-- CCCU-C--aC AGAACCCGGC 1501 UUAC-AG-GC CG----GCUG A......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS R.rubrum 1570 bp DEFINITION R.rubrum 1570 bp, 1570 bases, 43A54F44 checksum. ORIGIN 1 .....CCAGU C-GGC--CGG AUGGCC-GCU ---CUCC-GU CA-U---CGU 51 C-CCCGGG-- -----CCACC ------CCCG AUGGAC-C-- --GU-CG-G- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -C--A-CGGG AAC-ACGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -GGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCUA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GG------- ---------- ---------C -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------UA UAC------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---G-C-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CCU---GCC- CGGC------ ---------- ---------- 851 --AACGG-GG --AGG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-UAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAGAUC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA CG-GC-AC-- 1001 -----GCCCC --GG------ ---------U UUU------- ---------- 1051 --CC------ GGGGC----- AA---G-CGG C--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-UU------ ---CC-G-C- ---------- 1151 ---------- ---------- ----GCC-GC -CGUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AGUA 1251 UCGCG----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-G 1301 U-CCG----- --GUAA---- ----CGG-GC G--U-CCC-A GAUGAAUGGC 1351 CAUC------ -CCCG-U--- CG--U---C- GCGU--CCC- ---------- 1401 ---------- -------UUG C--------- ---------- -------GG- 1451 -G-AU----- A-CG-GCC-- ----GG-C-- GU-G-G--AC AGAACCCGGC 1501 UUAC-AG-GC CG----UCUG GCGGU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS R.prowazekii 1570 bp DEFINITION R.prowazekii 1570 bp, 1570 bases, 5EE3A684 checksum. ORIGIN 1 .....CUAAA U-GGU--CGU GCAGUU-GCG ---UGAU--- ---------- 51 ---------- -----GAUA- ---------- ---------- ------A-U- 101 CACGAGGAAA GUCCGGACUC -U--A-UAGA GGU-AUGG-U GCC-GGU--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------UCC- -GGCAG-AG- 201 --UA------ ---------- ---------- ----UUAU-- ---------- 251 ---------- ---------- -U-A-CUUUA G-GGC---UA GUACC--ACA 301 GAAAAUAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GA------- ---------- ---------G ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U AU-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---U-U-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------U GGUAAGAGCA 801 -CACC-G--- GUA---AGU- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAA-GU --UAC---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-UUA-ACCC CACCA---A- GAGCAAGAUC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA UU-ACA---- 1001 -----GAAUU --UAAAU--- ---------A UUU------- ------AU-- 1051 U-UA------ AGUUC----- ----CU-GGG U--------- ---------- 1101 ---------- ---------U A-CCUCUA-- ---AU-C-GG ---------- 1151 ---------- ---------- -----AUUGU -AAUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGU-A 1301 A-ACG----- --GUAA---- ----CGU-UU A--U-CCU-A GAUAAAUAAC 1351 UGCA------ -AUGA-A--- U--------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------UAA U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ----AU-U-- C--A-U--AC AGAAUCCGGC 1501 UUAU-AG-AC CA----GAUG AGCAG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Wolbachia-sp 1570 bp DEFINITION Wolbachia-sp 1570 bp, 1570 bases, D8762986 checksum. ORIGIN 1 .....UAGGU G-GAA--UAA GUAGCU-GCU ---GUUG-U- -G-U------ 51 ---------- -----GAUAA ---------- ---------- --AC-AU-A- 101 GCAGAGGAAA GUCCGGGCUC -C--A-AGGA AAA-AUAG-U GAC-GGG--- 151 ---------- ---UAAUG-- ---------- ------CCC- -GCCGG-AG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CUCCA G-UUA---UA GGGCU--ACA 301 GAAAAUU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UA------- ---------- ---------A -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U AU-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------U-U ---U-U-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------U GGUAAGAGCA 801 -CACC-A--- UGG---CAA- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAU-UG --GUA---GU ---------- ---------- ---------- 901 -------CGA G-UAA-CCAA CACUA---G- GAGCAAGAUU AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGAAG UA-GA-UU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U---U-AUG ---------- ---------- 1101 ---------- ---------U U-UUCCU--- ---CA-U-A- ---------- 1151 ---------- ---------- --------UC -UACUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AA-A 1251 UCGCA----- ---------- ---------- ---------- -UGC-GGU-A 1301 A-AUG----- --GUAA---- ----CAU-UU A--C-UCC-A GAUAAAUAGC 1351 UACAUA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- -------AAC AGAACUCGGC 1501 UUAU--A-UU UC----ACCU AGGCG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS PS1 1570 bp DEFINITION PS1 1570 bp, 1570 bases, 444957A2 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -C--A-CGAA ACA-ACGG-U GCC-GGA--- 151 ---------- ---UAAUG-- ---------- ------CCC- -GGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCCA G-GGA---AA GUGCCACACA 301 GAGAGCAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CC------- ---------- ---------G -----GC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------G-C ---C-AAG-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGCAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAG-GC --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-CAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAGACC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG CG-GC-G--- 1001 -----UGAGG --U------- ---------U UCG------- ---------- 1051 ---G------ CCUCA----- ----GG-GCA C--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-UUC----- ---GG-C-CC ---------- 1151 ---------- ---------- --------GU -CGCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-G 1301 U-UCC----- --GCAA---- ----GGA-UC G--G-CCU-A GAGGAAUGGU 1351 CGCC------ -UAUC-C--- CC-------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCU U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -------G-- ----GG-G-- U--G-G--ac agaauccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS PS2 1570 bp DEFINITION PS2 1570 bp, 1570 bases, E102407B checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa gugcgggcUC -C--A-CGGA AGC-AUGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -GGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCCA G-GGA---CA GCGCC--ACA 301 GAGAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CG------- ---------- ---------C -----CU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --AC------ ---------- 451 ---GCG---- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- CG-------- -----C---- 701 --------G- --CU-UUA-A ---G-C-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGU---UCU- CGGC------ ---------- ---------- 851 --AACGA-GA --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-CAA-GCCC CGCCA---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA CG-GC-GCU- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GG-GCU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------C U-UC------ ---AG-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ------C-GC -CGUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UCGCG----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-G 1301 U-CCG----- --GCGA---- ----CGG-AC G--U-CCC-A GAGGAAUGGU 1351 CAUC------ -CAGU-C--- C--------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ----GG-A-- U--G-G--ac agaauccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS PS6 1570 bp DEFINITION PS6 1570 bp, 1570 bases, CBD08464 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -C--A--CGG AAC-GCGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -GGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCCA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAGCAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CC------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G AAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------G- ---G---A-C --CA-C-A-- -GGCAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGCAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---AGC- GGGC------ ---------- ---------- 851 --AACCG-AA --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-CAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAGACC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA CG-CGAU--- 1001 -----GGGC- ---------- ---------U UAG------- ---------- 1051 ---------- -GCCC----- ---GGG-GCA G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G A-ACC----- ---GG-C-CC U--------- 1151 ---------- ---------- -----UUUCG -CGUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 UUGGU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-C 1301 G-UCG----- --GCAA---- ----CGC-CG G--U-GGU-A GAGGAAUGAU 1351 CGUC------ -ACUG-U--- CC-------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------UUC G--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -------G-- ----GG-C-- A--G-A--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS PS24 1570 bp DEFINITION PS24 1570 bp, 1570 bases, 87D139A2 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -C--A-CAUA ACC-ACGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -GGCGG-UC- 201 --GCG----- C-CUC-GGGA CUGCGCUAUU ---GCGUG-- --CGAUAGGG 251 GAAGCCA--- -GACAAGC-- -G-C-GGCAA G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAGAGCAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------U 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GU------ ---------- 451 ---CGU--CC G--------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- -------C-G -------G-- AU-------- ----AC---- 701 --------G- ---U---G-G ---C-C-A-- -GGCAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGCAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GAU- GGGU------ ---------- ---------- 851 --AACCG-GA --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-CAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAGACC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA CG-GC-GC-- 1001 -----GGACU --C------- ---------G CAA------- ---------- 1051 ---G------ GGUUC----- -A-GGG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-UG------ ---UC-G-CC C--------- 1151 ---------- ---------- ------A-GU -CGUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GCC-G 1301 G-UCA----- --GCAA---- ----UGG-CC G--G-CGU-A GAGGAAUGGU 1351 CGCC------ -CAUC-U--- GC--U----- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GAA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -----G-G-- ----CA-G-- U--G-G--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS PS26 1570 bp DEFINITION PS26 1570 bp, 1570 bases, C20182A checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -C--ACGGAA ACG-ACGG-U GCC-GGA--- 151 ---------- ---UAAUG-- ---------- ------UCC- -GGCGA-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCUUA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----UC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CU------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------G- ---G---G-A ---CAC-A-- -GGCAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GAC- CGGU------ ---------- ---------- 851 --AACGG-AA --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AAG G-CAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGACC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA CU-GC-GC-- 1001 -----GCCC- ---------- ---------G CAA------- ---------- 1051 ---------- -GGGC----- -A--GG-CCU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------U U-UC------ ---GG-G-CC ---------- 1151 ---------- ---------- ------G-GC -AGUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCGCG 1301 C-CCG----- --GCAA---- ----CGG-GC C--G-CCU-A GAGGAAUGGC 1351 UGCC------ -GGUG-C--- GGAUA---C- GGUC--G--- ---------- 1401 ---------- ------ACUU GUG------- ---------- ---------- 1451 -C-GA---UA C-CG-U-C-- ----CG-C-- G--C-C--ac agaacccggc 1501 uaa....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS PS27 1570 bp DEFINITION PS27 1570 bp, 1570 bases, 41289880 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -C--A--CGG AAC-GCGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------CCC- -GGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCCA G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAGAGCAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUC------- ---------- ---------G -----GC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GU------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------A- ---C---G-U ---C-G-A-- -GGCAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGCAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GAC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --AACCG-AA --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-CAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAGACC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG CG-GC-AC-- 1001 -----GAGCC --UCGUGC-- ---------G CAA------- -----GCA-- 1051 U-GG------ AGUUC----- -C---G-GGC AG-------- ---------- 1101 ---------- ---------G A-ACCG---- ---GC-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- ------A-GC -CGCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-G 1301 U-CCG----- --GUGA---- ----CGG-GC G--U-CCU-A GAGGAAUGAU 1351 CGUC------ -GCCG-G--- CU-------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------UUC G--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -------G-- ----GC-C-- G--G-G--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS PS31 1570 bp DEFINITION PS31 1570 bp, 1570 bases, 509B1654 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -C--A-CGAA ACA-AGGG-U GGC-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -GCCGG-CG- 201 --UUC----- C--------- ---------- ----UUCG-- ---------- 251 ---------- ------GG-- -G-G-CGCAA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAGUAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------A -----UC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CC------ ---------- 451 ---GGA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------CU UGA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- UC-------- -----C---- 701 --------G- ---G---G-A ---A-C-A-- -GGCAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGGGCG 801 -CACC-G--- GGG---GGC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAG-CC --ACC---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-CAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGGCC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG CC-GC-G--- 1001 -----UGCCC --AUCA---- ---------G CAA------- -------U-- 1051 G-GU------ GGGUA----- -----G-GGG A--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-UUCG---- ---CC-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- -----GA-GC -GGCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AAA-GCG-C 1301 C-GGA----- --GCAA---- ----UCC-GG C--G-ACC-A GAUGAAUGGC 1351 UGCC------ -ACCG-C--- AG--G---C- CCGU--CCC- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- -------GG- 1451 -G-AU----- ACCGCC-U-- ----GA-G-- G--A-G--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS LGB23 1570 bp DEFINITION LGB23 1570 bp, 1570 bases, A2C2C89D checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -C--A-UGAA GCA-AGGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAAUG-- ---------- ------CCC- -GGCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GAAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGA G-GGA---AA GCGCC--ACA 301 GAGAAGAG-U CUGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CC------- ---------- ---------G -----A---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CU-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------U ---C-G-G-- -GGUGAU--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACC-G--- CGG---ACC- GGGC------ ---------- ---------- 851 --AACCG-GG --ACG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-CAA-GCCC CACCC---G- GAGCAAUGCC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG CC-CC-GC-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- GC-GGG-CUG ---GUCCCGG ACUACGGUCC 1101 GCGAUACCGC CGCAGGGAUG C-UU------ ---CA-G-CC C--------- 1151 ---------- ---------- ------A-GG -GGCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 CAGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-C 1301 G-UCG----- --GUAA---- ----CGG-CG G--G-CCU-A GAGGAAUGGU 1351 CAUC------ -CAGG-G--- GG--C----- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -----G-C-- ----CC-C-- C--G-G--ac agaauccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS LGB41 1570 bp DEFINITION LGB41 1570 bp, 1570 bases, E1A6E782 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -C--A-CGGA ACA-ACGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -GGCGG-CU- 201 --CCU----- G-C------- ---------- ----CUCG-- ---------- 251 ---------- -----GCC-- -G-G-AGUUA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAGCAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UG------- ---------- ---------C -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---G-C-G-- -GGUAAG--- G-GCGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGCAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- CGGU------ ---------- ---------- 851 --AACGG-UC --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACCC CACCG---G- GUGCAAGACC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG CG-GC-AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GG-GCC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-UCC----- ---GG-C-UC ---------- 1151 ---------- ---------- --------GU -CGCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-G 1301 A-AGG----- --GCAA---- ----CCU-UC G--U-CCU-A GAGGAAUGGU 1351 CGCC------ -GAUC-C--- CC--U----- ---------- ---------- 1401 ---------- --------UU A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -----A-G-- ----GG-G-- U--G-A--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS LGW113 1570 bp DEFINITION LGW113 1570 bp, 1570 bases, 2668531B checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -C--A-CGGA ACA-ACGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -GGCGG-CU- 201 --CCU----- G-C------- ---------- ----CUCG-- ---------- 251 ---------- -----GCC-- -G-G-AGUUA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAGCAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UG------- ---------- ---------C -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---G-C-G-- -GGUAAG--- G-GCGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- CGGU------ ---------- ---------- 851 --AACGG-UC --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACCC CACCG---G- GUGCAAGACC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG CG-GC-AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GG-GCC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-UCC----- ---GG-C-UC ---------- 1151 ---------- ---------- --------GU -CGCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-G 1301 A-AGG----- --GCAA---- ----CCU-UC G--U-CCU-A GAGGAAUGGU 1351 CGCC------ -GAUC-C--- CC--U----- ---------- ---------- 1401 ---------- -------UUU A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -----A-G-- ----GG-G-- U--G-A--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS ESH212C 1570 bp DEFINITION ESH212C 1570 bp, 1570 bases, F8A12071 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcuC -C--A-UCGA CAU-ACGG-U GCC-GGA--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------CCC- -GGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCCA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAACGA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UU------- ---------- ---------C -----AC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U CC-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------G-U ---G-A-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGU---UUC- UAGC------ ---------- ---------- 851 --AAUAG-AG --ACG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-CAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAAACC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA CG-GC-ACA- 1001 -----GUGGA AAGUUCG--- ---------C UCU------- ------CG-- 1051 G-GCGAUAAC UCCGC----- -G--GG-GCG A--------- ---------- 1101 ---------- ---------U G-UCA----- ---GG-C-CC ---------- 1151 ---------- ---------- --------GC -UGUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-G 1301 C-AAG----- --GUAA---- ----CUU-GC G--U-CCC-A GAGGAAUGGC 1351 CGUC------ -ACGU-C--- UG--C---G- UGGU------ ---------- 1401 ---------- -------GCG A--------- ---------- ---------- 1451 ---AC----- C-AU-U-C-- ----AG-G-- CC-C-U--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS SM-A12(14) 1570 bp DEFINITION SM-A12(14) 1570 bp, 1570 bases, B997C977 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa gucCGGGCUC -C--U--UCG GAC-AGGG-C GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCCA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AG------- ---------- ---------C ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---G-C-U-- -GGUAAG--- G-GUGAAAU- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GAC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACGGCUU --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACCC CGCCC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG AG-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- GU---C-CGU CGU------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-CC------ -GAAC-G-G- ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CUCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGU-G 1301 G-CCG----- --GUGA---- ----CGG-CU A--U-CCC-A GAUGAAUGGU 1351 UGUCGA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------UGac agaacccggc 1501 uuac...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS SM-A18(31) 1570 bp DEFINITION SM-A18(31) 1570 bp, 1570 bases, F87A1BAE checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -C--A-UGGA AGC-GCGG-U GCC-GGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCC- -GGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCUCA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CU------- ---------- ---------C -----GA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GG------ ---------- 451 ---CC----- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G AAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- -G-------- -----G---- 701 --------C- ---U---U-C GCGG-A-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGU---CUU- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAA-AG --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AAG G-CAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG CU-GC-AC-- 1001 -----GGACG --A------- ---------G AGA------- ---------- 1051 ---U------ CGUCC----- -A---G-GUC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-UUCCA--- ---GA-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- ------C-GC -GGCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 UUGCA----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 U-CUC----- --GCAA---- ----GAG-GC G--U-CCC-A GAUGAAUGGC 1351 CAUC------ -ACCU-C--- GC--A----- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -----U-G-- ----CG-A-- G--G-A--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS SM-A46(74) 1570 bp DEFINITION SM-A46(74) 1570 bp, 1570 bases, 776BDBD9 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -C--G--UCA GGC-AGGA-C GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGAGG-GU- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCCA U-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AG------- ---------- ---------C ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UU-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---G-C-U-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGG- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACACGCC --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-UAA-ACCC CGUCC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG AG-C--A--- 1001 -----UGGGG --ACC----- ---------U UCG------- ---------- 1051 G-GU------ CUCUA----- -----C-CGU AC-------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CUGA---- ---GC-G-G- ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CUCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 A-CCG----- --GUGA---- ----CGG-UU G--U-CCC-A GAUGAAUGAU 1351 UGCCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS SM-A48(76) 1570 bp DEFINITION SM-A48(76) 1570 bp, 1570 bases, DEA0DC8A checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -C--U--UCG GAC-AGGG-c GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCCA U-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AG------- ---------- ---------C ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---G-C-U-- -GGUAAG--- G-GUGAAAU- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---AAC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAG-GU --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-UAA-ACCC CGCUC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG GA-CG-UU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU----GCGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-CC------ ---GC-G-C- ---------- 1151 ---------- ---------- --------UG -UUCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGU-A 1301 C-AUG----- --GUGA---- ----CAU-GU U--A-CCC-A GAUGAAUGAU 1351 UGCCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaauccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.eutrophus 1570 bp DEFINITION A.eutrophus 1570 bp, 1570 bases, E02FF553 checksum. ORIGIN 1 .....AAAGC A-GGC--CAG GCAACC-GCU ---GCCU-G- -C-A---CC- 51 ---------- -----GCAA- ---------- -----G-G-- --UG-CA-G- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGACUC -CACA----G GGC-AGGG-U GUU-GGC--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------GCC- -AUCCA-CG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CGUGC G-GAA---UA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G UCUUG----- ---------- ---------- ---------- 351 -CC------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GG------ ---------- 451 ---G------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----C---- 701 --------C- ---C---G-G ---C-G-G-- -GAA--G--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-UAA-CCUC CACCU---G- GAGCAAUCCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA GG-C--GA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-AGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-U-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 GAGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCC-G 1301 G-CUG----- --GUAA---- ----CAG-CC G--G-CCU-A GAGGAAUGGU 1351 UGUC------ -ACGC-A--- CC--G---U- UUGC--C--- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 -G-GC----- G-GG-C-G-- ----GG-G-- C--G-C--AC AGAAUCCGGC 1501 UUAU-CG-GC CU----GCUU UGCUU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS B.pertussis 1570 bp DEFINITION B.pertussis 1570 bp, 1570 bases, 672DE2CD checksum. ORIGIN 1 .....AGGGC A-GAU--CGG GCAAUC-GCG ---GGGG-A- -U-------- 51 ---------- -----GCAA- ---------- ---------- ---A-UC-C- 101 UUCGAGGAAG GUCCGGACUC -CACA----G GGC-GGGA-U AGC-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GUCCG-GC- 201 --GAC----- G-CUG-GCGG G--------- ----CUUG-- ---------- 251 --CCCGC--- -CG--GAA-- -A-A-GCCGA G-GAA---CA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G UCUGU----- ---------- ---------- ---------- 351 -CA------- ---------- ---------U -----GAGGG CGCGCCUGGC 401 GCGCACCGGC ACGGCCAUCU CCGUGCCG-- --CG------ ---------- 451 ---CCG--UC CG-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G AAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ------CG-G -------G-- CG-------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-C ---A-U-G-- -ACA--G--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-CAA-CCUC UAUCC---G- GAGCAACAUC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA UG-C--GUA- 1001 -----CGGCC ---------- ---------G UAA------- ---------- 1051 ---------- GGCCG---GG AA---G-GGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ --CGU-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- -----AA--G -CAUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UGGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCG-G 1301 U-CCA----- --GCAA---- ----UGG-UU C--G-CCA-A GAGGAAUGAU 1351 UGCC------ -CGCC-G--- GG-------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GAA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -------C-- ----CC-G-- G--C-G-UAC AGAAUCCGGC 1501 CUAU-AG-AU CU----GCUC U......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS B.bronchiseptica 1570 bp DEFINITION B.bronchiseptica 1570 bp, 1570 bases, B83A0660 checksum. ORIGIN 1 .....AGGGC A-GAU--CGG GCAAUC-GCG ---GGGG-A- -U-------- 51 ---------- -----GCAA- ---------- ---------- ---A-UC-C- 101 UUCGAGGAAG GUCCGGACUC -CACA----G GGC-GGGA-U AGC-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GUCCG-GC- 201 --GAC----- G-CUG-GCGG G--------- ----CUUG-- ---------- 251 --CCCGC--- -CG--GAA-- -A-A-GCCGA G-GAA---CA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G UCUGU----- ---------- ---------- ---------- 351 -CA------- ---------- ---------U -----GAGGG CGCGCCUGGC 401 GCGCACCGGC ACGGCCAUCU CCGUGCCG-- --CG------ ---------- 451 ---CCG--UC CG-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G AAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ------CG-G -------G-- CG-------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-C ---A-U-G-- -ACA--G--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-CAA-CC.. .......... .......... .......... 951 .......... .......... .......... .......... .......... 1001 .......... .......... .......... .......... .......... 1051 .......... .......... .......... .......... .......... 1101 .......... .......... .......... .......... .......... 1151 .......... .......... .......... .......... .......... 1201 .......... .......... .......... .......... .......... 1251 .......... .......... .......... .......... .......... 1301 .......... .......... .......... .......... .......... 1351 .......... .......... .......... .......... .......... 1401 .......... .......... .......... .......... .......... 1451 .......... .......... .......... .......... .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.testosteroni 1570 bp DEFINITION C.testosteroni 1570 bp, 1570 bases, 31D20474 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUG -CAUA----G GGC-GGCG-U AGC-AGC--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------GCU- -GUCCA-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGUGA G-GAU---CA GAGCA--ACA 301 GAGACGA--G UCUGG----- ---------- ---------- ---------- 351 -CA------- ---------- ---------G -----GA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GU------ ---------- 451 ---GCC---- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- GG-------- -----C---- 701 --------A- ---G---A-C ---C-A-A-- -CCA--G--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 --------GG G-CAA-UCUC UACGC---G- CAGCAAUACC AAGU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA CA-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-CGG G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---CC-G-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UGUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UAGCA----- ---------- ---------- ---------- CCGA-GCC-A 1301 U-CAG----- --GCGA---- ----CUG-AU G--G-CCA-A GAUUAAUGGC 1351 GGUC------ -ACAU-G--- GC--G---G- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---C-C-G-- ----UU-G-- U--G-C--ac agaauccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS N.europaea 1570 bp DEFINITION N.europaea 1570 bp, 1570 bases, 5BE99594 checksum. ORIGIN 1 .....GAAGC C-GGU--CAG ACAGUC-GCU ---GCCU-G- ---------- 51 ---------- -----GUGA- ---------- ---------- ---C--A-G- 101 GGAGAGGAAA GUCCGGGCUC -CACA----G AGC-AGGA-U GCC-GGU--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GGCCG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGUGA G-GAA---CA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G CGUAU----- ---------- ---------- ---------- 351 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U AAG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---------- -UUA--C--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-UAA-CCUC CAUCC---G- GAGCAAGAUC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA GA-U--GA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-CGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-U-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GCA-C 1301 A-CGG----- --GUAA---- ----CUG-UA U--G-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GC CG----GCUU C......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS N.gonnorhoeae 1570 bp DEFINITION N.gonnorhoeae 1570 bp, 1570 bases, 649FB3A2 checksum. ORIGIN 1 .....CGGGA C-GGG--CAG ACAGUC-GCC ---GCGU-A- -U-C---GC- 51 ---------- -----GUAA- ---------- -----G-G-- --CA-UA-C- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CGCA----G GGU-AGAA-U GCC-GGU--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GGGCG-CG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CGCGA C-GGA---AA GUGGA--ACA 301 GAAAGCAAAA CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GC------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------G- ---C---A-G ---CAC-A-- -GGCAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGGGCG 801 -CACC-G--- CGC---AUU- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAAUAU --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG C-CAA-ACCC CAUUC---G- GAGCAAGACC AAA------- 951 ---------- ---------- ---------- -----CAGAA CG-C--AA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-CGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CGUUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCA-U 1301 A-CCG----- --GCAA---- ----CGG-UA U--G-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCG---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------AGAC AGAACCCGGC 1501 UUAC-CG-CC UG----UCCG GUGUG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS N.meningitidis-Z2491 1570 bp DEFINITION N.meningitidis-Z2491 1570, 1570 bases, 48A5B0FB checksum. ORIGIN 1 .....CGGGA C-GGG--CAG ACAGUC-GCC ---GCGU-A- -U-C---GC- 51 ---------- -----GUAA- ---------- -----G-G-- --CA-UA-C- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CGCA----G GGU-AGAA-U GCC-GGU--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GGGCG-CG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CGCGA C-GGA---AA GUGGA--ACA 301 GAAAGCAAAA CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GC------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------G- ---C---A-G ---CAC-A-- -GGCAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGGGCG 801 -CACC-G--- CGC---AUU- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAAUAU --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG C-CAA-ACCC CAUUC---G- GAGCAAGACC AAA------- 951 ---------- ---------- ---------- -----CAGAA CG-C--AA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-CGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CGUUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCA-U 1301 A-CCG----- --GCAA---- ----CGG-UA U--G-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCG---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------AGAC AGAACCCGGC 1501 UUAC-CG-CC UG----UCCG GUGUG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS N.meningtidis-MC58 1570 bp DEFINITION N.meningtidis-MC58 1570 b, 1570 bases, AEC2FC93 checksum. ORIGIN 1 .....CGGGA C-GGG--CAG ACAGUC-GCC ---GCGU-A- -U-C---GC- 51 ---------- -----GUAA- ---------- -----G-G-- --CA-UA-C- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CGCA----G GGU-AGAA-U GCC-GGU--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GGGCG-CG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CGCGA C-GGA---AA GUGGA--ACA 301 GAAAGCAAAA CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GC------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------G- ---C---A-G ---CAC-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGGGCG 801 -CACC-G--- CGC---AUU- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAAUAU --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG C-CAA-ACCC CAUUC---G- GAGCAAGACC AAA------- 951 ---------- ---------- ---------- -----CAGAA CG-C--AA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-CGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CGUUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCA-U 1301 A-CCG----- --GUAA---- ----CGG-UA U--G-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCG---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------AGAC AGAACCCGGC 1501 UUAC-CG-CC UG----UCCG GUGUG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS T.thioparus 1570 bp DEFINITION T.thioparus 1570 bp, 1570 bases, 3BAA44A0 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CACA----G AGC-AGGA-U GCC-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GGACG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCGA G-GAA---UA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G CGUAU----- ---------- ---------- ---------- 351 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U CAG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---------- -UUA--C--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-UAA-CCUC CAUCC---G- GAGCAACACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA GG-C--GA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-AGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-U-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UGGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-G 1301 G-UCA----- --GCAA---- ----UGG-CC G--G-CCU-A GAGGAAUGGU 1351 UGCCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAC...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Mxa1 1570 bp DEFINITION Mxa1 1570 bp, 1570 bases, 500753AE checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa gucccggcUG -CACA----G AGC-GGGA-U GAC-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GUACG-CU- 201 --GAA----- A-GCU-G--- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ------C--- -AG--UAU-- -A-A-GGCGA G-GAA---UA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G UCGGU----- ---------- ---------- ---------- 351 -UC------- ---------- ---------G -----AC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- -CAG------ ---------- 451 ---UGA--GC AA-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ------UU-G -------C-- GA-------- -----A---- 701 --------C- ---UUGCG-U ---C-G-A-- -AAC--G--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-UAA-CCUC CAUCU---G- CAGCAAUAUC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCU GG-CA-U--- 1001 -----UUAC- ---------- ---------G CAA------- ---------- 1051 ---------- -GUAA----U AA--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-G-CC ---------- 1151 ---------- ---------- --------UG -CCAGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 UAGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCG-U 1301 G-UGA----- --GUAA---- ----UUG-CA C--G-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 UGGU------ -CGCC-A--- C--------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCG A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ----GU-G-- G--A-U--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS ESH26-4 1570 bp DEFINITION ESH26-4 1570 bp, 1570 bases, A111C7B7 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUG -CACA----G AGC-GGGA-U GAC-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GUACG-CU- 201 --GAA----- A-GCU-G--- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ------C--- -AG--UAU-- -A-A-GGCGA G-GAA---UA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G CGUAU----- ---------- ---------- ---------- 351 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U AAG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---------- -UUA--C--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-UAA-CCUC CAUCA---G- CAGCAAUAUC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCU GG-CA-UU-- 1001 -----UGUC- ---------- ---------G CAA------- ---------- 1051 ---------- -GACA----U AA--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-G-CC ---------- 1151 ---------- ---------- --------UG -CCAGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 UAGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCG-U 1301 G-UGA----- --GUAA---- ----UUG-CA C--G-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUC------ -AGCU-A--- C--------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ----GU-A-- G--U-U--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS ESH167F 1570 bp DEFINITION ESH167F 1570 bp, 1570 bases, D5A4AB50 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G AGC-AGGG-U GAU-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------ACC- -AUCCA-CG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CGUGC G-GAA---UA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G UCUUC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GC------- ---------- ---------C -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GG------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------U- ---C---A-G ---G-G-C-- -GAA--G--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-UAA-CCGC CACCC---G- GAGCAAUCCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA GA-C--G--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GA-AGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 GAGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCC-G 1301 G-CCG----- --GUAA---- ----CGG-UC G--G-CCU-A GAGGAAUGGU 1351 UGUC------ -ACGU-U--- CC--G---G- GC-------- ---------- 1401 ---------- ------GCGG CAA------- ---------- ---------- 1451 ---------- G-CU-G-C-- ----GG-G-- C--G-C--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS ESH183D 1570 bp DEFINITION ESH183D 1570 bp, 1570 bases, FE17E572 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guacgggcUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GUU-GGC--- 151 ---------- ---UAAUA-- ---------- ------GCC- -AUCCA-CG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CGUGC G-GAA---UA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G UCUUG----- ---------- ---------- ---------- 351 -CC------- ---------- ---------A -----UC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GG------ ---------- 451 ---G------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----C---- 701 --------C- ---C---G-A ---U-G-G-- -GAA--G--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-UAA-CCUC CACCU---G- GAGCAAUCCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA GG-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-GGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-U-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 GAGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-G 1301 G-UCG----- --GUAA---- ----CGA-CC G--G-CCU-A GAGGAAUGAU 1351 UGUC------ -ACGU-G--- CC--G---G- CAAC--C--- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 -G-GA----- A-GC-C-G-- ----GC-G-- C--G-C--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.ferrooxidans 1570 bp DEFINITION A.ferrooxidans 1570 bp, 1570 bases, ABCDE561 checksum. ORIGIN 1 .....GGAGU G-GGC--CAG GCGACC-GCC ---GCGG-A- ---------- 51 ---------- -----GCAA- ---------- ---------- -----UC-C- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AAGG-C GCC-GGU--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GGGGG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------A 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G UAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAU---UUC- CGGU------ ---------- ---------- 851 --AACGG-AA --AUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG G-AAA-ACCC CGCCU---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCG UG-C--GA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--AC-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-GU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CACGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCC-U 1301 G-UGC----- --GUAA---- ----GUG-CA G--G-CCU-A GAGGAAUGGU 1351 CGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GC CC----ACUC CAAUU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.ferrooxidans-g 1570 bp DEFINITION A.ferrooxidans-g 1570 bp, 1570 bases, C4FB9915 checksum. ORIGIN 1 .....GGAGU G-GGC--CAG ACGACC-GCC ---GCGG-A- ---------- 51 ---------- -----GCAA- ---------- ---------- -----UC-C- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CACA----G GGC-AAGG-C GCC-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUAU-A CCGCC----- ---------- ---------- --------AA 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G UAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-GCC-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAU---UUC- CGGC------ ---------- ---------- 851 --GACGG-GA --AUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG G-AAA-ACCC CGCCU---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCG UG-C--GA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--AC-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-GU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CAUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCC-U 1301 G-CGC----- --GUAA---- ----GUU-CA G--G-CCU-A GAGGAAUGGU 1351 CGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GC CC----ACUC CAAUU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.paspali 1570 bp DEFINITION A.paspali 1570 bp, 1570 bases, 6046C547 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggCUC -CAUA----G GGC-AGAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAACA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-C-- CGGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GGC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AAA-GGC-G 1301 G-CCA----- --GCGA---- ----UGG-UC G--U-CGU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.salinestris-184 1570 bp DEFINITION A.salinestris-184 1570 bp, 1570 bases, E48DBDC4 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G GGC-AGAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAACA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-C-- CGGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 G-CCA----- --GUGA---- ----UGG-UC G--U-CGU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.vinlandii-CA 1570 bp DEFINITION A.vinlandii-CA 1570 bp, 1570 bases, E38BFC8B checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G GGC-AGAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAACA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-C-- CGGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GGC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AAA-GGC-G 1301 G-CCA----- --GCGA---- ----UGG-UC G--U-CGU-A GAGGAAUGAC 1351 UGCCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.macrocytogenes123 1570 bp DEFINITION A.macrocytogenes123 1570 , 1570 bases, 7268617D checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G GGC-AAAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-C-- CGGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GGC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUU---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -C--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 G-UCA----- --GCGA---- ----UGG-CC G--U-CGU-A GAGGAAUGGC 1351 UGUCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.chroococcum 1570 bp DEFINITION A.chroococcum 1570 bp, 1570 bases, D50A406C checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggCUC -CAUA----G GGC-AGAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAACA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGU------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-C-- CGGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GGC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 G-CCA----- --GCGA---- ----UGG-UC G--U-CGU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAAcccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Buchnera-APS 1570 bp DEFINITION Buchnera-APS 1570 bp, 1570 bases, 50E8619E checksum. ORIGIN 1 ..UGAAGUUG A-CUA--AAA ACAGUC-GCU ---GUUU-A- -G-U---UU- 51 ---------- -----UUAA- ---------- -------A-- -AAU-UA-A- 101 AAAGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G AGC-AGGG-U GCC-AGA--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------UCU- -GGAAA-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCUUA U-GAC---UA GUGCA--ACA 301 GAAAAUAA-A CCACC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UA------- ---------- ---------U -----UU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UG------ ---------- 451 ---UA----- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------- AUA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- -U-------- -----A---- 701 --------U- ---A---A-A --AA-U-A-- UGGCCAG--- G-GUGAAAA- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------U GGUAAGAGCA 801 -CACC-G--- CAU---AAU- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAAUUC --AUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAAGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AUAGG AU-A--AAUU 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------U UU--UG-UAC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---UCUU--A -AACCU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-AUU-A 1301 G-UAA----- --GUGA---- ----UUG-CU A--A-UCU-A GAUGAAUGAC 1351 UGUUAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- -------AAC AGAACCCGGC 1501 UUAC-AC-GA GU----CAAC UUCAAUAAC. .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.vinosum 1570 bp DEFINITION C.vinosum 1570 bp, 1570 bases, DC703A15 checksum. ORIGIN 1 .....GGAGU C-GGC--CAG ACAGUC-GCU ---UCCG-U- -C-------- 51 ---------- -----CUGGU ---------- ---------- ---G-AC-G- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GAGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GUCCA C-GGA---AA GUGCC--GCA 301 GAAAAGAU-A CCGCC----- ---------- ---------- --------GA 351 CCC------- ---------- ---------C -----GU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --C------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---G---A-C ---G-G-G-- AGGUAAG--- G-GUGAAAU- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---UGG- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAU-CA --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG AA-C--UC-- 1001 -----GCGGC ---------- ---------U UCG------- ---------- 1051 ---------- ACCGC----- -A-GCG-CGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CG U--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UUCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 U-GCG----- --GCGA---- ----CGC-AC G--U-CCC-A GAUGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GC CG----ACUC CCUUC..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS E.coli 1570 bp DEFINITION E.coli 1570 bp, 1570 bases, 7EA13351 checksum. ORIGIN 1 .....GAAGC U-GAC--CAG ACAGUC-GCC ---GCUU-C- -G-U---CGU 51 CGUCCUC--- -----UUCG- -------GGG G-AGAC-G-- -GGC-GG-A- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-G-- 201 ---------- ---------- ---------- ----GAAA-- ---------- 251 ---------- ---------- ------CCCA C-GAC---CA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CG------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AA--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAUGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GU CA----GUUU CACCU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS E.coli-g 1570 bp DEFINITION E.coli-g 1570 bp, 1570 bases, A90D06F8 checksum. ORIGIN 1 .....GAAGC U-GAC--CAG ACAGUC-GCC ---GCUU-C- -G-U---CGU 51 CGUCCUC--- -----UUCG- -------GGG G-AGAC-G-- -GGC-GG-A- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-G-- 201 ---------- ---------- ---------- ----GAAA-- ---------- 251 ---------- ---------- ------CCCA C-GAC---CA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CG------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AA--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAUGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GU CA----GUUU CACCU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS E.coli-JM109 1570 bp DEFINITION E.coli-JM109 1570 bp, 1570 bases, 3336FB01 checksum. ORIGIN 1 .....GAAGC U-GAC--CAG ACAGUC-GCC ---GCUU-C- -G-U---CGU 51 CGUCCUC--- -----UUCG- -------GGG G-AGAC-G-- -GGC-GG-A- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-G-- 201 ---------- ---------- ---------- ----GAAA-- ---------- 251 ---------- ---------- ------CCCA C-GAC---CA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CG------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AA--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAUGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GU CA----GUUU CACCU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS E.agglomerulans 1570 bp DEFINITION E.agglomerulans 1570 bp, 1570 bases, 1027B89E checksum. ORIGIN 1 .....GAAGC U-GAC--CAG ACAGUC-GCC ---GCUU-C- -G-U---CGU 51 CGUCCUCC-- -----UUCG- ------GGGG G-AGAC-G-- -GGC-GG-A- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AAGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-GU- 201 --G------- ---------- ---------- ----UCAC-- ---------- 251 ---------- ---------- ---G-ACCCA C-GAC---CA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CG------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AA--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAUGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GU CA----GUUU CACCU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS H.influenza 1570 bp DEFINITION H.influenza 1570 bp, 1570 bases, D4766E2B checksum. ORIGIN 1 .....CGAGU U-GGU--UAG ACAAUC-GCU ---GGUU-U- -A-U---UGA 51 AGCCCUUAAC CGUA-UUUA- -UACGACCUA GUGGGACA-- -AGU-AA-A- 101 CGAGAGGAAA GUCCGAGCUA -CACA----G GGC-AGAG-U GCC-GGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCC- -GGGCG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCGA C-GAC---CA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GU------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G UAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- -----A-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- UGC---CGU- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAACGU --GCA---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG G-UAA-ACUC CACUC---G- UAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGAA CU-C--A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A--UG-GGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-C-CA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AGUUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCG-G 1301 C-AGA----- --GUAA---- ----UUU-GU C--G-CCU-A GAGGAAUGAU 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACUCGGC 1501 UUAU-CG-AC CA----ACUC AAAAC..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS K.pneumoniae 1570 bp DEFINITION K.pneumoniae 1570 bp, 1570 bases, 8BB37144 checksum. ORIGIN 1 .....GAAGC U-GAC--CAG ACAGUC-GCC ---GCUU-C- -G-U---CGU 51 CGUCCUCC-- -----UUCG- ------GGGG G-AGAC-G-- -GGC-GG-A- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AAGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-GU- 201 --G------- ---------- ---------- ----UCAC-- ---------- 251 ---------- ---------- ---G-ACCCA C-GAC---CA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CG------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AA--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAUGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GU CA----GUUU CACCU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS L.adecarboxylata 1570 bp DEFINITION L.adecarboxylata 1570 bp, 1570 bases, A79ED2E6 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-G-- 201 ---------- ---------- ---------- ----GAAA-- ---------- 251 ---------- ---------- ------CCCA C-GAC---CA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CA------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------U- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AC-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAUAAUGACU 1351 GUUCAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaanccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.vulgaris 1570 bp DEFINITION P.vulgaris 1570 bp, 1570 bases, A2A39153 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CACA----G GGC-AGGG-U GCC-AGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GAC---AA GUGCA--GCA 301 GAGAGUAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UG------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------C- ---A---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---AGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUU --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AAG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--UU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GG-UGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-A-UU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCC-A 1301 G-CGC----- --GCAA---- ----GUU-CU G--G-CCU-A GAUGAAUGGU 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacacggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.fluorescens 1570 bp DEFINITION P.fluorescens 1570 bp, 1570 bases, E519C036 checksum. ORIGIN 1 .....AGAGU C-GAU--UGG ACAGUC-GCU ---GCCC-U- -C-U---AU- 51 ---------- -----GAAA- ---------- -----A-U-- -UAG-GG-G- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-GAAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAAUG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------A -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---U-G-CC- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GAC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUU---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGU UC-C--A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAACC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AAA-GAU-G 1301 U-CCA----- --GUGA---- ----UGG-CC A--U-CGU-A GACGAAUGAC 1351 UGUUCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------AGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-AG-AU CG----ACUC UCCAC..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.aeruginosa 1570 bp DEFINITION P.aeruginosa 1570 bp, 1570 bases, 30BAF47B checksum. ORIGIN 1 .....AGAGU C-GAU--UGG ACAGUC-GCU ---GUCG-C- -G-C------ 51 ---------- -----AAUA- ---------- ---------- --GC-GC-G- 101 GUGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AGAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ----