364 ENERGY = 0 V.spinosum RNase P RNA
    1 g       0    2    0    1
    2 a       1    3    0    2
    3 g       2    4    0    3
    4 g       3    5    0    4
    5 a       4    6    0    5
    6 a       5    7    0    6
    7 a       6    8    0    7
    8 g       7    9    0    8
    9 u       8   10    0    9
   10 c       9   11    0   10
   11 c      10   12    0   11
   12 g      11   13    0   12
   13 g      12   14    0   13
   14 g      13   15    0   14
   15 c      14   16  189   15
   16 A      15   17  188   16
   17 C      16   18  187   17
   18 C      17   19  186   18
   19 U      18   20    0   19
   20 C      19   21    0   20
   21 A      20   22    0   21
   22 G      21   23    0   22
   23 G      22   24    0   23
   24 G      23   25    0   24
   25 C      24   26    0   25
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   27 G      26   28  185   27
   28 U      27   29  184   28
   29 G      28   30  183   29
   30 U      29   31  182   30
   31 G      30   32  181   31
   32 C      31   33   47   32
   33 C      32   34   46   33
   34 G      33   35   45   34
   35 U      34   36   44   35
   36 G      35   37   43   36
   37 U      36   38   42   37
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   42 A      41   43   37   42
   43 C      42   44   36   43
   44 G      43   45   35   44
   45 C      44   46   34   45
   46 G      45   47   33   46
   47 G      46   48   32   47
   48 G      47   49   74   48
   49 G      48   50   72   49
   50 G      49   51   71   50
   51 C      50   52   70   51
   52 U      51   53   69   52
   53 G      52   54   68   53
   54 G      53   55   67   54
   55 C      54   56   66   55
   56 G      55   57   65   56
   57 G      56   58   64   57
   58 C      57   59   63   58
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   62 A      61   63    0   62
   63 G      62   64   58   63
   64 C      63   65   57   64
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   66 U      65   67   55   66
   67 C      66   68   54   67
   68 C      67   69   53   68
   69 G      68   70   52   69
   70 G      69   71   51   70
   71 U      70   72   50   71
   72 C      71   73   49   72
   73 A      72   74    0   73
   74 C      73   75   48   74
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   82 G      81   83  174   82
   83 U      82   84  173   83
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  109 A     108  110    0  109
  110 C     109  111  105  110
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  117 A     116  118    0  117
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  142 U     141  143  132  142
  143 C     142  144  131  143
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  145 C     144  146  129  145
  146 C     145  147  128  146
  147 G     146  148  169  147
  148 C     147  149  167  148
  149 U     148  150  166  149
  150 C     149  151  165  150
  151 C     150  152  164  151
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  153 A     152  154  162  153
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  160 G     159  161  155  160
  161 G     160  162  154  161
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  163 A     162  164  152  163
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  180 C     179  181   75  180
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  187 G     186  188   17  187
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  203 G     202  204  254  203
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  212 C     211  213  222  212
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  222 C     221  223  212  222
  223 C     222  224  211  223
  224 G     223  225  210  224
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  227 C     226  228  246  227
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  232 U     231  233  241  232
  233 C     232  234  240  233
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  262 U     261  263    0  262
  263 A     262  264    0  263
  264 G     263  265  195  264
  265 U     264  266  194  265
  266 C     265  267  193  266
  267 G     266  268    0  267
  268 C     267  269    0  268
  269 A     268  270    0  269
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  272 U     271  273  284  272
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  281 G     280  282  275  281
  282 C     281  283  274  282
  283 G     282  284  273  283
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  342 C     341  343  333  342
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