392 ENERGY = 0 T.thermophilus RNase P RNA
    1 U       0    2    0    1
    2 G       1    3    0    2
    3 G       2    4    0    3
    4 C       3    5    0    4
    5 C       4    6    0    5
    6 C       5    7  370    6
    7 G       6    8  369    7
    8 G       7    9  368    8
    9 G       8   10  367    9
   10 A       9   11  366   10
   11 C      10   12  365   11
   12 G      11   13  364   12
   13 A      12   14  363   13
   14 G      13   15  362   14
   15 G      14   16  361   15
   16 G      15   17  359   16
   17 C      16   18  339   17
   18 G      17   19  338   18
   19 C      18   20  337   19
   20 G      19   21  336   20
   21 G      20   22  335   21
   22 U      21   23  334   22
   23 C      22   24  333   23
   24 G      23   25    0   24
   25 C      24   26   49   25
   26 G      25   27   48   26
   27 C      26   28   47   27
   28 C      27   29   46   28
   29 G      28   30   44   29
   30 A      29   31   43   30
   31 G      30   32   42   31
   32 G      31   33   41   32
   33 G      32   34   40   33
   34 C      33   35    0   34
   35 C      34   36    0   35
   36 G      35   37    0   36
   37 A      36   38    0   37
   38 A      37   39    0   38
   39 C      38   40    0   39
   40 C      39   41   33   40
   41 C      40   42   32   41
   42 C      41   43   31   42
   43 U      42   44   30   43
   44 C      43   45   29   44
   45 G      44   46    0   45
   46 G      45   47   28   46
   47 G      46   48   27   47
   48 U      47   49   26   48
   49 G      48   50   25   49
   50 A      49   51    0   50
   51 G      50   52    0   51
   52 G      51   53    0   52
   53 A      52   54    0   53
   54 A      53   55    0   54
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   57 U      56   58    0   57
   58 C      57   59    0   58
   59 C      58   60    0   59
   60 G      59   61    0   60
   61 G      60   62    0   61
   62 G      61   63    0   62
   63 C      62   64  239   63
   64 A      63   65  238   64
   65 C      64   66  237   65
   66 C      65   67  236   66
   67 A      66   68    0   67
   68 U      67   69    0   68
   69 A      68   70    0   69
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   71 G      70   72    0   71
   72 G      71   73    0   72
   73 C      72   74    0   73
   74 A      73   75    0   74
   75 G      74   76  235   75
   76 G      75   77  234   76
   77 G      76   78  233   77
   78 U      77   79  232   78
   79 G      78   80  231   79
   80 C      79   81   94   80
   81 C      80   82   93   81
   82 A      81   83   92   82
   83 G      82   84   91   83
   84 G      83   85   90   84
   85 U      84   86    0   85
   86 A      85   87    0   86
   87 A      86   88    0   87
   88 C      87   89    0   88
   89 G      88   90    0   89
   90 C      89   91   84   90
   91 C      90   92   83   91
   92 U      91   93   82   92
   93 G      92   94   81   93
   94 G      93   95   80   94
   95 G      94   96  109   95
   96 C      95   97  107   96
   97 G      96   98  106   97
   98 G      97   99  105   98
   99 G      98  100  104   99
  100 G      99  101    0  100
  101 U     100  102    0  101
  102 A     101  103    0  102
  103 A     102  104    0  103
  104 C     103  105   99  104
  105 C     104  106   98  105
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  107 G     106  108   96  107
  108 A     107  109    0  108
  109 C     108  110   95  109
  110 G     109  111  230  110
  111 G     110  112  229  111
  112 A     111  113    0  112
  113 A     112  114    0  113
  114 A     113  115    0  114
  115 G     114  116  228  115
  116 U     115  117  227  116
  117 G     116  118  224  117
  118 C     117  119  223  118
  119 C     118  120  222  119
  120 A     119  121    0  120
  121 C     120  122    0  121
  122 A     121  123    0  122
  123 G     122  124    0  123
  124 A     123  125    0  124
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  132 C     131  133  168  132
  133 C     132  134  167  133
  134 G     133  135  164  134
  135 C     134  136  163  135
  136 C     135  137  162  136
  137 A     136  138  161  137
  138 G     137  139  160  138
  139 C     138  140  159  139
  140 G     139  141    0  140
  141 G     140  142  158  141
  142 C     141  143  157  142
  143 C     142  144  156  143
  144 G     143  145  155  144
  145 G     144  146  154  145
  146 G     145  147  153  146
  147 G     146  148  152  147
  148 C     147  149    0  148
  149 U     148  150    0  149
  150 U     149  151    0  150
  151 C     150  152    0  151
  152 C     151  153  147  152
  153 C     152  154  146  153
  154 C     153  155  145  154
  155 C     154  156  144  155
  156 G     155  157  143  156
  157 G     156  158  142  157
  158 U     157  159  141  158
  159 G     158  160  139  159
  160 C     159  161  138  160
  161 G     160  162  137  161
  162 G     161  163  136  162
  163 G     162  164  135  163
  164 C     163  165  134  164
  165 A     164  166    0  165
  166 A     165  167    0  166
  167 G     166  168  133  167
  168 G     167  169  132  168
  169 G     168  170    0  169
  170 U     169  171    0  170
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  175 C     174  176    0  175
  176 G     175  177  194  176
  177 G     176  178  193  177
  178 C     177  179  192  178
  179 G     178  180  191  179
  180 G     179  181  190  180
  181 G     180  182  189  181
  182 G     181  183    0  182
  183 U     182  184    0  183
  184 A     183  185    0  184
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  187 A     186  188    0  187
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  190 C     189  191  180  190
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  196 C     195  197  218  196
  197 C     196  198  216  197
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  199 G     198  200  214  199
  200 G     199  201  213  200
  201 C     200  202  212  201
  202 C     201  203  211  202
  203 U     202  204  210  203
  204 G     203  205  209  204
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  210 A     209  211  203  210
  211 G     210  212  202  211
  212 G     211  213  201  212
  213 C     212  214  200  213
  214 C     213  215  199  214
  215 G     214  216  198  215
  216 G     215  217  197  216
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  219 C     218  220  195  219
  220 A     219  221    0  220
  221 C     220  222    0  221
  222 G     221  223  119  222
  223 G     222  224  118  223
  224 C     223  225  117  224
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  226 A     225  227    0  226
  227 A     226  228  116  227
  228 C     227  229  115  228
  229 C     228  230  111  229
  230 C     229  231  110  230
  231 C     230  232   79  231
  232 A     231  233   78  232
  233 C     232  234   77  233
  234 C     233  235   76  234
  235 C     234  236   75  235
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  244 G     243  245  295  244
  245 C     244  246  294  245
  246 C     245  247  293  246
  247 C     246  248    0  247
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  253 G     252  254  286  253
  254 C     253  255  285  254
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  257 G     256  258  282  257
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  261 G     260  262  273  261
  262 G     261  263  272  262
  263 C     262  264  271  263
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