340 ENERGY = 0 T.pallidum RNase P RNA
    1 A       0    2  335    1
    2 G       1    3  334    2
    3 A       2    4  333    3
    4 G       3    5  332    4
    5 A       4    6  331    5
    6 A       5    7  330    6
    7 C       6    8  329    7
    8 U       7    9  328    8
    9 G       8   10    0    9
   10 C       9   11  327   10
   11 A      10   12  326   11
   12 G      11   13  306   12
   13 A      12   14  305   13
   14 U      13   15  304   14
   15 A      14   16  303   15
   16 G      15   17  302   16
   17 U      16   18  301   17
   18 C      17   19  300   18
   19 G      18   20    0   19
   20 C      19   21   36   20
   21 U      20   22   35   21
   22 G      21   23   34   22
   23 C      22   24   33   23
   24 G      23   25   32   24
   25 G      24   26   31   25
   26 G      25   27   30   26
   27 U      26   28    0   27
   28 U      27   29    0   28
   29 U      28   30    0   29
   30 C      29   31   26   30
   31 U      30   32   25   31
   32 C      31   33   24   32
   33 G      32   34   23   33
   34 C      33   35   22   34
   35 A      34   36   21   35
   36 G      35   37   20   36
   37 A      36   38    0   37
   38 G      37   39    0   38
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   40 A      39   41    0   40
   41 A      40   42    0   41
   42 A      41   43    0   42
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   44 U      43   45    0   44
   45 C      44   46    0   45
   46 C      45   47    0   46
   47 G      46   48    0   47
   48 G      47   49    0   48
   49 A      48   50    0   49
   50 C      49   51  213   50
   51 U      50   52  212   51
   52 C      51   53  211   52
   53 C      52   54  210   53
   54 U      53   55    0   54
   55 U      54   56    0   55
   56 C      55   57    0   56
   57 G      56   58    0   57
   58 G      57   59    0   58
   59 A      58   60    0   59
   60 A      59   61    0   60
   61 A      60   62    0   61
   62 U      61   63  209   62
   63 G      62   64  208   63
   64 A      63   65  207   64
   65 U      64   66  206   65
   66 G      65   67  205   66
   67 C      66   68   81   67
   68 U      67   69   80   68
   69 A      68   70   79   69
   70 G      69   71   78   70
   71 U      70   72   77   71
   72 U      71   73    0   72
   73 A      72   74    0   73
   74 A      73   75    0   74
   75 U      74   76    0   75
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   77 A      76   78   71   77
   78 C      77   79   70   78
   79 U      78   80   69   79
   80 A      79   81   68   80
   81 G      80   82   67   81
   82 G      81   83  108   82
   83 C      82   84  106   83
   84 A      83   85  105   84
   85 G      84   86  104   85
   86 C      85   87  103   86
   87 G      86   88  102   87
   88 G      87   89  101   88
   89 C      88   90  100   89
   90 U      89   91   99   90
   91 C      90   92   98   91
   92 U      91   93   97   92
   93 C      92   94    0   93
   94 U      93   95    0   94
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   97 A      96   98   92   97
   98 G      97   99   91   98
   99 U      98  100   90   99
  100 G      99  101   89  100
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  102 C     101  103   87  102
  103 G     102  104   86  103
  104 C     103  105   85  104
  105 U     104  106   84  105
  106 G     105  107   83  106
  107 A     106  108    0  107
  108 C     107  109   82  108
  109 A     108  110  204  109
  110 G     109  111  203  110
  111 C     110  112    0  111
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  113 A     112  114    0  113
  114 G     113  115  202  114
  115 C     114  116  201  115
  116 G     115  117  198  116
  117 C     116  118  197  117
  118 C     117  119  196  118
  119 A     118  120    0  119
  120 C     119  121    0  120
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  122 G     121  123    0  122
  123 A     122  124    0  123
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  126 A     125  127    0  126
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  134 C     133  135  141  134
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  140 G     139  141  135  140
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  142 U     141  143  133  142
  143 A     142  144    0  143
  144 A     143  145    0  144
  145 G     144  146  132  145
  146 G     145  147  131  146
  147 G     146  148    0  147
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  155 G     154  156  171  155
  156 C     155  157  170  156
  157 G     156  158  169  157
  158 A     157  159  168  158
  159 G     158  160  167  159
  160 G     159  161    0  160
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  163 A     162  164    0  163
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  166 G     165  167    0  166
  167 C     166  168  159  167
  168 U     167  169  158  168
  169 C     168  170  157  169
  170 A     169  171  156  170
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  174 C     173  175  191  174
  175 G     174  176  190  175
  176 U     175  177  189  176
  177 U     176  178  188  177
  178 U     177  179  187  178
  179 U     178  180  186  179
  180 G     179  181  185  180
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  187 A     186  188  178  187
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  195 C     194  196    0  195
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  197 G     196  198  117  197
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  202 C     201  203  114  202
  203 C     202  204  110  203
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  205 C     204  206   66  205
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  219 U     218  220  259  219
  220 C     219  221  258  220
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  222 A     221  223    0  222
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  224 C     223  225    0  224
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  226 G     225  227  252  226
  227 C     226  228  251  227
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  230 A     229  231  248  230
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  232 G     231  233  243  232
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  262 G     261  263    0  262
  263 C     262  264    0  263
  264 A     263  265    0  264
  265 U     264  266    0  265
  266 A     265  267    0  266
  267 A     266  268    0  267
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