304 ENERGY = 0 S.polymorpha RNase P RNA
    1 C       0    2  169    1
    2 A       1    3    0    2
    3 C       2    4    0    3
    4 G       3    5    0    4
    5 G       4    6    0    5
    6 A       5    7    0    6
    7 A       6    8    0    7
    8 A       7    9    0    8
    9 C       8   10    0    9
   10 C       9   11    0   10
   11 A      10   12    0   11
   12 C      11   13  168   12
   13 G      12   14  167   13
   14 G      13   15  166   14
   15 U      14   16  165   15
   16 G      15   17  164   16
   17 C      16   18   31   17
   18 C      17   19   30   18
   19 G      18   20   29   19
   20 G      19   21   28   20
   21 A      20   22   27   21
   22 U      21   23    0   22
   23 A      22   24    0   23
   24 A      23   25    0   24
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   27 U      26   28   21   27
   28 C      27   29   20   28
   29 C      28   30   19   29
   30 G      29   31   18   30
   31 G      30   32   17   31
   32 C      31   33   54   32
   33 G      32   34   52   33
   34 G      33   35   51   34
   35 C      34   36   50   35
   36 U      35   37   49   36
   37 U      36   38   48   37
   38 C      37   39   47   38
   39 G      38   40   46   39
   40 G      39   41   45   40
   41 G      40   42    0   41
   42 A      41   43    0   42
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   44 A      43   45    0   44
   45 C      44   46   40   45
   46 C      45   47   39   46
   47 G      46   48   38   47
   48 G      47   49   37   48
   49 A      48   50   36   49
   50 G      49   51   35   50
   51 U      50   52   34   51
   52 C      51   53   33   52
   53 A      52   54    0   53
   54 G      53   55   32   54
   55 G      54   56  163   55
   56 G      55   57  162   56
   57 A      56   58    0   57
   58 A      57   59    0   58
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   60 G      59   61  161   60
   61 U      60   62  160   61
   62 G      61   63  157   62
   63 C      62   64  156   63
   64 C      63   65  155   64
   65 A      64   66    0   65
   66 C      65   67    0   66
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   73 C      72   74    0   73
   74 A      73   75    0   74
   75 G      74   76    0   75
   76 A      75   77    0   76
   77 C      76   78  103   77
   78 C      77   79   99   78
   79 G      78   80   98   79
   80 C      79   81   97   80
   81 C      80   82   96   81
   82 A      81   83    0   82
   83 A      82   84    0   83
   84 A      83   85    0   84
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   86 G      85   87    0   86
   87 C      86   88    0   87
   88 U      87   89    0   88
   89 U      88   90    0   89
   90 C      89   91    0   90
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   92 G      91   93    0   92
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   97 G      96   98   80   97
   98 C      97   99   79   98
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  112 G     111  113  128  112
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  114 G     113  115  126  114
  115 C     114  116  125  115
  116 G     115  117  124  116
  117 G     116  118    0  117
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  119 A     118  120    0  119
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  122 A     121  123    0  122
  123 G     122  124    0  123
  124 C     123  125  116  124
  125 G     124  126  115  125
  126 C     125  127  114  126
  127 A     126  128  113  127
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  132 G     131  133  149  132
  133 C     132  134  148  133
  134 G     133  135  147  134
  135 G     134  136  146  135
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  137 C     136  138  144  137
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  142 A     141  143    0  142
  143 C     142  144  138  143
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  145 G     144  146  136  145
  146 A     145  147  135  146
  147 C     146  148  134  147
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  149 C     148  150  132  149
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  152 C     151  153  130  152
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  156 G     155  157   63  156
  157 C     156  158   62  157
  158 A     157  159    0  158
  159 A     158  160    0  159
  160 A     159  161   61  160
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  162 C     161  163   56  162
  163 C     162  164   55  163
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  209 C     208  210  219  209
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  220 C     219  221  208  220
  221 C     220  222  207  221
  222 C     221  223  206  222
  223 C     222  224    0  223
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  226 C     225  227  190  226
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  263 C     262  264  248  263
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