333 ENERGY = 0 Prochlorococcus-PAC1A RNase P RNA
    1 g       0    2    0    1
    2 a       1    3    0    2
    3 g       2    4    0    3
    4 g       3    5    0    4
    5 a       4    6    0    5
    6 a       5    7    0    6
    7 a       6    8    0    7
    8 g       7    9    0    8
    9 u       8   10    0    9
   10 c       9   11    0   10
   11 c      10   12    0   11
   12 g      11   13    0   12
   13 g      12   14    0   13
   14 g      13   15    0   14
   15 c      14   16  197   15
   16 U      15   17  196   16
   17 C      16   18  195   17
   18 C      17   19  194   18
   19 U      18   20  193   19
   20 A      19   21    0   20
   21 U      20   22    0   21
   22 U      21   23    0   22
   23 U      22   24    0   23
   24 G      23   25    0   24
   25 G      24   26    0   25
   26 C      25   27    0   26
   27 C      26   28    0   27
   28 A      27   29    0   28
   29 G      28   30  192   29
   30 G      29   31  191   30
   31 C      30   32  190   31
   32 U      31   33    0   32
   33 U      32   34  189   33
   34 G      33   35  188   34
   35 C      34   36   49   35
   36 U      35   37   48   36
   37 G      36   38   47   37
   38 G      37   39   46   38
   39 G      38   40   45   39
   40 U      39   41    0   40
   41 A      40   42    0   41
   42 A      41   43    0   42
   43 U      42   44    0   43
   44 U      43   45    0   44
   45 C      44   46   39   45
   46 C      45   47   38   46
   47 C      46   48   37   47
   48 A      47   49   36   48
   49 G      48   50   35   49
   50 U      49   51   64   50
   51 G      50   52   62   51
   52 C      51   53   61   52
   53 G      52   54   60   53
   54 G      53   55   59   54
   55 G      54   56    0   55
   56 U      55   57    0   56
   57 G      56   58    0   57
   58 A      57   59    0   58
   59 C      58   60   54   59
   60 C      59   61   53   60
   61 G      60   62   52   61
   62 U      61   63   51   62
   63 G      62   64    0   63
   64 A      63   65   50   64
   65 G      64   66  187   65
   66 G      65   67  186   66
   67 A      66   68    0   67
   68 U      67   69    0   68
   69 A      68   70    0   69
   70 G      69   71  185   70
   71 U      70   72  184   71
   72 G      71   73  181   72
   73 C      72   74  180   73
   74 C      73   75  179   74
   75 A      74   76    0   75
   76 C      75   77    0   76
   77 A      76   78    0   77
   78 G      77   79    0   78
   79 A      78   80    0   79
   80 A      79   81    0   80
   81 A      80   82    0   81
   82 C      81   83    0   82
   83 A      82   84    0   83
   84 C      83   85    0   84
   85 A      84   86    0   85
   86 C      85   87  128   86
   87 C      86   88  127   87
   88 G      87   89  124   88
   89 C      88   90  123   89
   90 C      89   91  122   90
   91 U      90   92    0   91
   92 A      91   93    0   92
   93 A      92   94  121   93
   94 U      93   95  120   94
   95 G      94   96  119   95
   96 C      95   97  118   96
   97 U      96   98  117   97
   98 U      97   99  116   98
   99 A      98  100  115   99
  100 A      99  101  114  100
  101 U     100  102  113  101
  102 G     101  103  112  102
  103 G     102  104  111  103
  104 G     103  105  110  104
  105 G     104  106  109  105
  106 A     105  107    0  106
  107 A     106  108    0  107
  108 A     107  109    0  108
  109 U     108  110  105  109
  110 C     109  111  104  110
  111 C     110  112  103  111
  112 C     111  113  102  112
  113 A     112  114  101  113
  114 A     113  115  100  114
  115 C     114  116   99  115
  116 A     115  117   98  116
  117 A     116  118   97  117
  118 G     117  119   96  118
  119 C     118  120   95  119
  120 G     119  121   94  120
  121 C     120  122   93  121
  122 G     121  123   90  122
  123 G     122  124   89  123
  124 C     123  125   88  124
  125 A     124  126    0  125
  126 A     125  127    0  126
  127 G     126  128   87  127
  128 G     127  129   86  128
  129 G     128  130    0  129
  130 U     129  131    0  130
  131 G     130  132    0  131
  132 C     131  133    0  132
  133 A     132  134    0  133
  134 A     133  135    0  134
  135 A     134  136    0  135
  136 G     135  137  154  136
  137 G     136  138  153  137
  138 U     137  139  152  138
  139 G     138  140  151  139
  140 C     139  141  150  140
  141 G     140  142  149  141
  142 G     141  143    0  142
  143 U     142  144    0  143
  144 A     143  145    0  144
  145 A     144  146    0  145
  146 G     145  147    0  146
  147 A     146  148    0  147
  148 G     147  149    0  148
  149 C     148  150  141  149
  150 G     149  151  140  150
  151 C     150  152  139  151
  152 A     151  153  138  152
  153 C     152  154  137  153
  154 C     153  155  136  154
  155 A     154  156  177  155
  156 G     155  157  176  156
  157 C     156  158  174  157
  158 A     157  159  173  158
  159 G     158  160  172  159
  160 C     159  161  171  160
  161 A     160  162  170  161
  162 U     161  163  169  162
  163 C     162  164  168  163
  164 G     163  165    0  164
  165 A     164  166    0  165
  166 G     165  167    0  166
  167 A     166  168    0  167
  168 G     167  169  163  168
  169 G     168  170  162  169
  170 U     169  171  161  170
  171 G     170  172  160  171
  172 C     171  173  159  172
  173 U     172  174  158  173
  174 G     173  175  157  174
  175 G     174  176    0  175
  176 C     175  177  156  176
  177 U     176  178  155  177
  178 A     177  179    0  178
  179 G     178  180   74  179
  180 G     179  181   73  180
  181 U     180  182   72  181
  182 A     181  183    0  182
  183 A     182  184    0  183
  184 A     183  185   71  184
  185 C     184  186   70  185
  186 C     185  187   66  186
  187 C     186  188   65  187
  188 C     187  189   34  188
  189 G     188  190   33  189
  190 G     189  191   31  190
  191 C     190  192   30  191
  192 C     191  193   29  192
  193 A     192  194   19  193
  194 G     193  195   18  194
  195 G     194  196   17  195
  196 A     195  197   16  196
  197 G     196  198   15  197
  198 C     197  199    0  198
  199 A     198  200    0  199
  200 A     199  201    0  200
  201 G     200  202  246  201
  202 G     201  203  245  202
  203 C     202  204  244  203
  204 G     203  205    0  204
  205 A     204  206    0  205
  206 G     205  207  235  206
  207 G     206  208  234  207
  208 G     207  209  233  208
  209 G     208  210  232  209
  210 C     209  211  231  210
  211 A     210  212  230  211
  212 C     211  213    0  212
  213 U     212  214    0  213
  214 G     213  215  228  214
  215 G     214  216  227  215
  216 A     215  217  226  216
  217 U     216  218    0  217
  218 G     217  219    0  218
  219 G     218  220    0  219
  220 C     219  221    0  220
  221 C     220  222    0  221
  222 A     221  223    0  222
  223 U     222  224    0  223
  224 A     223  225    0  224
  225 G     224  226    0  225
  226 A     225  227  216  226
  227 C     226  228  215  227
  228 C     227  229  214  228
  229 U     228  230    0  229
  230 U     229  231  211  230
  231 G     230  232  210  231
  232 U     231  233  209  232
  233 C     232  234  208  233
  234 C     233  235  207  234
  235 C     234  236  206  235
  236 U     235  237    0  236
  237 G     236  238    0  237
  238 U     237  239    0  238
  239 A     238  240    0  239
  240 G     239  241    0  240
  241 A     240  242    0  241
  242 G     241  243    0  242
  243 A     242  244    0  243
  244 G     243  245  203  244
  245 C     244  246  202  245
  246 C     245  247  201  246
  247 G     246  248    0  247
  248 C     247  249    0  248
  249 U     248  250    0  249
  250 U     249  251    0  250
  251 G     250  252    0  251
  252 A     251  253    0  252
  253 G     252  254  272  253
  254 G     253  255  271  254
  255 C     254  256  270  255
  256 U     255  257  269  256
  257 A     256  258  268  257
  258 C     257  259  267  258
  259 C     258  260  266  259
  260 G     259  261  265  260
  261 G     260  262    0  261
  262 U     261  263    0  262
  263 A     262  264    0  263
  264 A     263  265    0  264
  265 C     264  266  260  265
  266 G     265  267  259  266
  267 U     266  268  258  267
  268 U     267  269  257  268
  269 A     268  270  256  269
  270 G     269  271  255  270
  271 U     270  272  254  271
  272 C     271  273  253  272
  273 C     272  274    0  273
  274 C     273  275    0  274
  275 A     274  276    0  275
  276 G     275  277    0  276
  277 A     276  278    0  277
  278 U     277  279    0  278
  279 A     278  280    0  279
  280 G     279  281    0  280
  281 A     280  282    0  281
  282 U     281  283    0  282
  283 G     282  284    0  283
  284 A     283  285    0  284
  285 U     284  286    0  285
  286 U     285  287    0  286
  287 A     286  288    0  287
  288 C     287  289    0  288
  289 C     288  290    0  289
  290 C     289  291  316  290
  291 A     290  292  315  291
  292 U     291  293  314  292
  293 U     292  294  313  293
  294 C     293  295  311  294
  295 U     294  296  310  295
  296 C     295  297  309  296
  297 U     296  298  308  297
  298 U     297  299  307  298
  299 U     298  300    0  299
  300 C     299  301  306  300
  301 U     300  302    0  301
  302 A     301  303    0  302
  303 A     302  304    0  303
  304 A     303  305    0  304
  305 G     304  306    0  305
  306 A     305  307  300  306
  307 A     306  308  298  307
  308 A     307  309  297  308
  309 G     308  310  296  309
  310 A     309  311  295  310
  311 G     310  312  294  311
  312 G     311  313    0  312
  313 A     312  314  293  313
  314 A     313  315  292  314
  315 A     314  316  291  315
  316 G     315  317  290  316
  317 A     316  318    0  317
  318 a     317  319    0  318
  319 c     318  320    0  319
  320 a     319  321    0  320
  321 g     320  322    0  321
  322 a     321  323    0  322
  323 a     322  324    0  323
  324 c     323  325    0  324
  325 c     324  326    0  325
  326 c     325  327    0  326
  327 g     326  328    0  327
  328 g     327  329    0  328
  329 c     328  330    0  329
  330 u     329  331    0  330
  331 u     330  332    0  331
  332 a     331  333    0  332
  333 c     332    0    0  333