272 ENERGY = 0 P.innocua RNase P RNA
    1 C       0    2  173    1
    2 A       1    3    0    2
    3 C       2    4    0    3
    4 A       3    5    0    4
    5 G       4    6    0    5
    6 A       5    7    0    6
    7 G       6    8    0    7
    8 C       7    9    0    8
    9 A       8   10    0    9
   10 G       9   11  172   10
   11 G      10   12  171   11
   12 G      11   13  170   12
   13 U      12   14  169   13
   14 G      13   15  168   14
   15 G      14   16   29   15
   16 U      15   17   28   16
   17 G      16   18   27   17
   18 G      17   19   26   18
   19 G      18   20   25   19
   20 U      19   21    0   20
   21 A      20   22    0   21
   22 A      21   23    0   22
   23 C      22   24    0   23
   24 G      23   25    0   24
   25 C      24   26   19   25
   26 C      25   27   18   26
   27 C      26   28   17   27
   28 A      27   29   16   28
   29 C      28   30   15   29
   30 C      29   31   44   30
   31 C      30   32   42   31
   32 G      31   33   41   32
   33 G      32   34   40   33
   34 G      33   35   39   34
   35 G      34   36    0   35
   36 U      35   37    0   36
   37 G      36   38    0   37
   38 A      37   39    0   38
   39 C      38   40   34   39
   40 C      39   41   33   40
   41 C      40   42   32   41
   42 G      41   43   31   42
   43 C      42   44    0   43
   44 G      43   45   30   44
   45 G      44   46  167   45
   46 G      45   47  166   46
   47 C      46   48    0   47
   48 C      47   49    0   48
   49 A      48   50    0   49
   50 G      49   51  165   50
   51 U      50   52  164   51
   52 G      51   53  161   52
   53 C      52   54  160   53
   54 C      53   55  159   54
   55 A      54   56    0   55
   56 C      55   57    0   56
   57 A      56   58    0   57
   58 G      57   59    0   58
   59 A      58   60    0   59
   60 G      59   61    0   60
   61 A      60   62    0   61
   62 A      61   63    0   62
   63 C      62   64    0   63
   64 A      63   65    0   64
   65 G      64   66    0   65
   66 A      65   67    0   66
   67 C      66   68  106   67
   68 C      67   69  105   68
   69 G      68   70  102   69
   70 C      69   71  101   70
   71 C      70   72  100   71
   72 C      71   73   99   72
   73 C      72   74   98   73
   74 G      73   75   97   74
   75 A      74   76   96   75
   76 U      75   77   95   76
   77 G      76   78   94   77
   78 C      77   79   93   78
   79 G      78   80   92   79
   80 C      79   81   91   80
   81 C      80   82   90   81
   82 G      81   83   89   82
   83 G      82   84   88   83
   84 U      83   85    0   84
   85 U      84   86    0   85
   86 C      85   87    0   86
   87 G      86   88    0   87
   88 C      87   89   83   88
   89 C      88   90   82   89
   90 G      89   91   81   90
   91 A      90   92   80   91
   92 C      91   93   79   92
   93 G      92   94   78   93
   94 U      93   95   77   94
   95 G      94   96   76   95
   96 C      95   97   75   96
   97 C      96   98   74   97
   98 G      97   99   73   98
   99 G      98  100   72   99
  100 G      99  101   71  100
  101 G     100  102   70  101
  102 U     101  103   69  102
  103 A     102  104    0  103
  104 A     103  105    0  104
  105 G     104  106   68  105
  106 G     105  107   67  106
  107 G     106  108    0  107
  108 U     107  109    0  108
  109 G     108  110    0  109
  110 A     109  111    0  110
  111 A     110  112    0  111
  112 A     111  113    0  112
  113 C     112  114    0  113
  114 G     113  115  132  114
  115 G     114  116  131  115
  116 C     115  117  130  116
  117 G     116  118  129  117
  118 G     117  119  128  118
  119 U     118  120  127  119
  120 G     119  121    0  120
  121 U     120  122    0  121
  122 A     121  123    0  122
  123 A     122  124    0  123
  124 G     123  125    0  124
  125 A     124  126    0  125
  126 G     125  127    0  126
  127 A     126  128  119  127
  128 C     127  129  118  128
  129 C     128  130  117  129
  130 A     129  131  116  130
  131 C     130  132  115  131
  132 C     131  133  114  132
  133 G     132  134  157  133
  134 G     133  135  156  134
  135 C     134  136  154  135
  136 A     135  137  153  136
  137 C     136  138  152  137
  138 C     137  139  151  138
  139 G     138  140  150  139
  140 U     139  141  149  140
  141 G     140  142  148  141
  142 A     141  143  147  142
  143 G     142  144    0  143
  144 C     143  145    0  144
  145 G     144  146    0  145
  146 A     145  147    0  146
  147 U     146  148  142  147
  148 C     147  149  141  148
  149 A     148  150  140  149
  150 C     149  151  139  150
  151 G     150  152  138  151
  152 G     151  153  137  152
  153 U     152  154  136  153
  154 G     153  155  135  154
  155 G     154  156    0  155
  156 C     155  157  134  156
  157 C     156  158  133  157
  158 A     157  159    0  158
  159 G     158  160   54  159
  160 G     159  161   53  160
  161 U     160  162   52  161
  162 A     161  163    0  162
  163 A     162  164    0  163
  164 A     163  165   51  164
  165 C     164  166   50  165
  166 C     165  167   46  166
  167 C     166  168   45  167
  168 C     167  169   14  168
  169 A     168  170   13  169
  170 C     169  171   12  170
  171 C     170  172   11  171
  172 C     171  173   10  172
  173 G     172  174    1  173
  174 G     173  175    0  174
  175 A     174  176    0  175
  176 G     175  177    0  176
  177 C     176  178    0  177
  178 A     177  179    0  178
  179 A     178  180    0  179
  180 G     179  181  224  180
  181 A     180  182  223  181
  182 C     181  183  222  182
  183 C     182  184  221  183
  184 A     183  185    0  184
  185 G     184  186    0  185
  186 A     185  187    0  186
  187 C     186  188    0  187
  188 A     187  189    0  188
  189 G     188  190  215  189
  190 C     189  191  214  190
  191 A     190  192  213  191
  192 G     191  193  212  192
  193 G     192  194  211  193
  194 C     193  195  210  194
  195 G     194  196  207  195
  196 G     195  197  206  196
  197 G     196  198  205  197
  198 U     197  199  204  198
  199 U     198  200    0  199
  200 G     199  201    0  200
  201 C     200  202    0  201
  202 U     201  203    0  202
  203 C     202  204    0  203
  204 G     203  205  198  204
  205 C     204  206  197  205
  206 C     205  207  196  206
  207 C     206  208  195  207
  208 U     207  209    0  208
  209 U     208  210    0  209
  210 G     209  211  194  210
  211 C     210  212  193  211
  212 C     211  213  192  212
  213 U     212  214  191  213
  214 G     213  215  190  214
  215 C     214  216  189  215
  216 G     215  217    0  216
  217 G     216  218    0  217
  218 G     217  219    0  218
  219 U     218  220    0  219
  220 A     219  221    0  220
  221 G     220  222  183  221
  222 G     221  223  182  222
  223 U     222  224  181  223
  224 C     223  225  180  224
  225 G     224  226    0  225
  226 C     225  227    0  226
  227 U     226  228    0  227
  228 G     227  229    0  228
  229 G     228  230    0  229
  230 A     229  231    0  230
  231 G     230  232  250  231
  232 G     231  233  249  232
  233 C     232  234  248  233
  234 C     233  235  247  234
  235 G     234  236  246  235
  236 U     235  237  245  236
  237 C     236  238  244  237
  238 A     237  239  243  238
  239 G     238  240    0  239
  240 C     239  241    0  240
  241 A     240  242    0  241
  242 A     241  243    0  242
  243 U     242  244  238  243
  244 G     243  245  237  244
  245 A     244  246  236  245
  246 C     245  247  235  246
  247 G     246  248  234  247
  248 G     247  249  233  248
  249 U     248  250  232  249
  250 C     249  251  231  250
  251 C     250  252    0  251
  252 G     251  253    0  252
  253 A     252  254    0  253
  254 G     253  255    0  254
  255 A     254  256    0  255
  256 U     255  257    0  256
  257 G     256  258    0  257
  258 G     257  259    0  258
  259 A     258  260    0  259
  260 U     259  261    0  260
  261 G     260  262    0  261
  262 A     261  263    0  262
  263 C     262  264    0  263
  264 C     263  265    0  264
  265 G     264  266    0  265
  266 U     265  267    0  266
  267 C     266  268    0  267
  268 C     267  269    0  268
  269 C     268  270    0  269
  270 A     269  271    0  270
  271 C     270  272    0  271
  272 G     271    0    0  272