301 ENERGY = 0 P.alcalifaciens RNase P RNA
    1 g       0    2    0    1
    2 a       1    3    0    2
    3 g       2    4    0    3
    4 g       3    5    0    4
    5 a       4    6    0    5
    6 a       5    7    0    6
    7 a       6    8    0    7
    8 g       7    9    0    8
    9 u       8   10    0    9
   10 c       9   11    0   10
   11 c      10   12    0   11
   12 g      11   13    0   12
   13 g      12   14    0   13
   14 g      13   15    0   14
   15 c      14   16  186   15
   16 U      15   17  185   16
   17 C      16   18  184   17
   18 C      17   19  183   18
   19 A      18   20    0   19
   20 U      19   21    0   20
   21 A      20   22    0   21
   22 G      21   23    0   22
   23 G      22   24    0   23
   24 G      23   25    0   24
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   27 G      26   28  182   27
   28 G      27   29  181   28
   29 G      28   30  180   29
   30 U      29   31  179   30
   31 G      30   32  178   31
   32 C      31   33   46   32
   33 C      32   34   45   33
   34 A      33   35   44   34
   35 G      34   36   43   35
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   42 U      41   43   36   42
   43 C      42   44   35   43
   44 U      43   45   34   44
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   46 G      45   47   32   46
   47 G      46   48   61   47
   48 A      47   49   59   48
   49 G      48   50   58   49
   50 G      49   51   57   50
   51 C      50   52   56   51
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   57 C      56   58   50   57
   58 C      57   59   49   58
   59 U      58   60   48   59
   60 A      59   61    0   60
   61 C      60   62   47   61
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   63 A      62   64  176   63
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   65 A      64   66    0   65
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   67 G      66   68  175   67
   68 U      67   69  174   68
   69 G      68   70  171   69
   70 C      69   71  170   70
   71 A      70   72  169   71
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   73 C      72   74    0   73
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   82 A      81   83    0   82
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   84 C      83   85  116   84
   85 C      84   86  115   85
   86 G      85   87  112   86
   87 C      86   88  111   87
   88 C      87   89  110   88
   89 G      88   90    0   89
   90 A      89   91    0   90
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   92 G      91   93  108   92
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   94 C      93   95  105   94
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  109 A     108  110   91  109
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  125 G     124  126  141  125
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  127 G     126  128  139  127
  128 C     127  129  138  128
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  140 A     139  141  126  140
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  144 C     143  145  164  144
  145 G     144  146  163  145
  146 C     145  147  162  146
  147 G     146  148  161  147
  148 A     147  149  160  148
  149 C     148  150  158  149
  150 U     149  151  157  150
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  157 A     156  158  150  157
  158 G     157  159  149  158
  159 U     158  160    0  159
  160 U     159  161  148  160
  161 C     160  162  147  161
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  163 U     162  164  145  163
  164 G     163  165  144  164
  165 G     164  166    0  165
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  182 C     181  183   27  182
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  184 G     183  185   17  184
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  203 U     202  204  227  203
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  212 U     211  213  222  212
  213 G     212  214  221  213
  214 C     213  215  220  214
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  220 G     219  221  214  220
  221 C     220  222  213  221
  222 A     221  223  212  222
  223 U     222  224  211  223
  224 U     223  225  210  224
  225 G     224  226  205  225
  226 A     225  227  204  226
  227 A     226  228  203  227
  228 C     227  229  202  228
  229 U     228  230  201  229
  230 C     229  231  200  230
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  232 G     231  233    0  232
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  263 G     262  264  248  263
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