350 ENERGY = 0 P.aeruginosa RNase P RNA
    1 A       0    2  346    1
    2 G       1    3  345    2
    3 A       2    4  344    3
    4 G       3    5  343    4
    5 U       4    6  342    5
    6 C       5    7  341    6
    7 G       6    8  340    7
    8 A       7    9  339    8
    9 U       8   10  338    9
   10 U       9   11  337   10
   11 G      10   12  335   11
   12 G      11   13  315   12
   13 A      12   14  314   13
   14 C      13   15  313   14
   15 A      14   16  312   15
   16 G      15   17  311   16
   17 U      16   18  310   17
   18 C      17   19  309   18
   19 G      18   20    0   19
   20 C      19   21   41   20
   21 U      20   22   40   21
   22 G      21   23   39   22
   23 U      22   24   38   23
   24 C      23   25   37   24
   25 G      24   26   36   25
   26 C      25   27   35   26
   27 G      26   28   34   27
   28 C      27   29   33   28
   29 A      28   30    0   29
   30 A      29   31    0   30
   31 U      30   32    0   31
   32 A      31   33    0   32
   33 G      32   34   28   33
   34 C      33   35   27   34
   35 G      34   36   26   35
   36 C      35   37   25   36
   37 G      36   38   24   37
   38 G      37   39   23   38
   39 U      38   40   22   39
   40 G      39   41   21   40
   41 G      40   42   20   41
   42 A      41   43    0   42
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   44 G      43   45    0   44
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   46 A      45   47    0   46
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   48 G      47   49    0   48
   49 U      48   50    0   49
   50 C      49   51    0   50
   51 C      50   52    0   51
   52 G      51   53    0   52
   53 G      52   54    0   53
   54 G      53   55    0   54
   55 C      54   56  220   55
   56 U      55   57  219   56
   57 C      56   58  218   57
   58 C      57   59  217   58
   59 A      58   60    0   59
   60 U      59   61    0   60
   61 A      60   62    0   61
   62 G      61   63    0   62
   63 G      62   64    0   63
   64 G      63   65    0   64
   65 C      64   66    0   65
   66 A      65   67    0   66
   67 G      66   68  216   67
   68 A      67   69  215   68
   69 G      68   70  214   69
   70 U      69   71  213   70
   71 G      70   72  212   71
   72 C      71   73   86   72
   73 C      72   74   85   73
   74 A      73   75   84   74
   75 G      74   76   83   75
   76 G      75   77   82   76
   77 U      76   78    0   77
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   81 G      80   82    0   81
   82 C      81   83   76   82
   83 C      82   84   75   83
   84 U      83   85   74   84
   85 G      84   86   73   85
   86 G      85   87   72   86
   87 G      86   88  101   87
   88 A      87   89   99   88
   89 G      88   90   98   89
   90 G      89   91   97   90
   91 C      90   92   96   91
   92 G      91   93    0   92
   93 C      92   94    0   93
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   97 C      96   98   90   97
   98 C      97   99   89   98
   99 U      98  100   88   99
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  103 G     102  104  210  103
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  106 A     105  107    0  106
  107 G     106  108  209  107
  108 U     107  109  208  108
  109 G     108  110  205  109
  110 C     109  111  204  110
  111 C     110  112  203  111
  112 A     111  113    0  112
  113 C     112  114    0  113
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  115 G     114  116    0  115
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  122 A     121  123    0  122
  123 C     122  124  150  123
  124 C     123  125  149  124
  125 G     124  126  146  125
  126 C     125  127  145  126
  127 C     126  128  144  127
  128 U     127  129    0  128
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  132 C     131  133  141  132
  133 G     132  134  140  133
  134 C     133  135  139  134
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  136 A     135  137    0  136
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  139 G     138  140  134  139
  140 C     139  141  133  140
  141 G     140  142  132  141
  142 C     141  143  131  142
  143 C     142  144    0  143
  144 G     143  145  127  144
  145 G     144  146  126  145
  146 U     145  147  125  146
  147 A     146  148    0  147
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  150 G     149  151  123  150
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  152 U     151  153    0  152
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  157 A     156  158    0  157
  158 G     157  159  176  158
  159 G     158  160  175  159
  160 U     159  161  174  160
  161 G     160  162  173  161
  162 C     161  163  172  162
  163 G     162  164  171  163
  164 G     163  165    0  164
  165 U     164  166    0  165
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  167 A     166  168    0  167
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  169 A     168  170    0  169
  170 G     169  171    0  170
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  175 C     174  176  159  175
  176 C     175  177  158  176
  177 G     176  178  200  177
  178 C     177  179  198  178
  179 A     178  180  197  179
  180 C     179  181  196  180
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  182 G     181  183  194  182
  183 C     182  184  192  183
  184 U     183  185  191  184
  185 G     184  186  190  185
  186 G     185  187    0  186
  187 C     186  188    0  187
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  189 A     188  190    0  189
  190 C     189  191  185  190
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  194 G     193  195  182  194
  195 C     194  196  181  195
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  197 U     196  198  179  197
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  200 C     199  201  177  200
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  204 G     203  205  110  204
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  211 C     210  212  102  211
  212 C     211  213   71  212
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  220 G     219  221   55  220
  221 C     220  222    0  221
  222 A     221  223    0  222
  223 A     222  224    0  223
  224 G     223  225  272  224
  225 A     224  226  271  225
  226 C     225  227  270  226
  227 C     226  228  269  227
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  234 G     233  235  263  234
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  247 C     246  248  253  247
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  262 U     261  263  235  262
  263 C     262  264  234  263
  264 G     263  265    0  264
  265 G     264  266    0  265
  266 G     265  267    0  266
  267 U     266  268    0  267
  268 A     267  269    0  268
  269 G     268  270  227  269
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  271 U     270  272  225  271
  272 C     271  273  224  272
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  281 C     280  282  296  281
  282 G     281  283  295  282
  283 U     282  284  294  283
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  350 A     349    0    0  350