336 ENERGY = 0 M.xanthus RNase P RNA
    1 g       0    2    0    1
    2 a       1    3    0    2
    3 g       2    4    0    3
    4 g       3    5    0    4
    5 a       4    6    0    5
    6 a       5    7    0    6
    7 a       6    8    0    7
    8 g       7    9    0    8
    9 u       8   10    0    9
   10 c       9   11    0   10
   11 c      10   12    0   11
   12 g      11   13    0   12
   13 g      12   14    0   13
   14 g      13   15    0   14
   15 c      14   16  180   15
   16 U      15   17  179   16
   17 C      16   18  178   17
   18 C      17   19  177   18
   19 A      18   20    0   19
   20 G      19   21    0   20
   21 A      20   22    0   21
   22 G      21   23    0   22
   23 G      22   24    0   23
   24 G      23   25    0   24
   25 C      24   26    0   25
   26 A      25   27    0   26
   27 G      26   28  176   27
   28 G      27   29  175   28
   29 G      28   30  174   29
   30 U      29   31  173   30
   31 G      30   32  172   31
   32 C      31   33   46   32
   33 U      32   34   45   33
   34 G      33   35   44   34
   35 G      34   36   43   35
   36 C      35   37   42   36
   37 U      36   38    0   37
   38 A      37   39    0   38
   39 A      38   40    0   39
   40 C      39   41    0   40
   41 G      40   42    0   41
   42 G      41   43   36   42
   43 C      42   44   35   43
   44 C      43   45   34   44
   45 A      44   46   33   45
   46 G      45   47   32   46
   47 U      46   48   61   47
   48 C      47   49   59   48
   49 G      48   50   58   49
   50 A      49   51   57   50
   51 G      50   52   56   51
   52 G      51   53    0   52
   53 C      52   54    0   53
   54 G      53   55    0   54
   55 A      54   56    0   55
   56 C      55   57   51   56
   57 U      56   58   50   57
   58 C      57   59   49   58
   59 G      58   60   48   59
   60 C      59   61    0   60
   61 A      60   62   47   61
   62 G      61   63  171   62
   63 G      62   64  170   63
   64 A      63   65    0   64
   65 A      64   66    0   65
   66 A      65   67    0   66
   67 G      66   68  169   67
   68 U      67   69  168   68
   69 G      68   70  165   69
   70 C      69   71  164   70
   71 C      70   72  163   71
   72 A      71   73    0   72
   73 C      72   74    0   73
   74 A      73   75    0   74
   75 G      74   76    0   75
   76 A      75   77    0   76
   77 A      76   78    0   77
   78 A      77   79    0   78
   79 A      78   80    0   79
   80 C      79   81    0   80
   81 A      80   82    0   81
   82 G      81   83    0   82
   83 A      82   84    0   83
   84 C      83   85  111   84
   85 C      84   86  110   85
   86 G      85   87  107   86
   87 C      86   88  106   87
   88 C      87   89  105   88
   89 C      88   90  104   89
   90 G      89   91  103   90
   91 U      90   92  102   91
   92 U      91   93  101   92
   93 C      92   94  100   93
   94 C      93   95   99   94
   95 G      94   96    0   95
   96 A      95   97    0   96
   97 A      96   98    0   97
   98 A      97   99    0   98
   99 G      98  100   94   99
  100 G      99  101   93  100
  101 G     100  102   92  101
  102 G     101  103   91  102
  103 C     102  104   90  103
  104 G     103  105   89  104
  105 G     104  106   88  105
  106 G     105  107   87  106
  107 U     106  108   86  107
  108 A     107  109    0  108
  109 A     108  110    0  109
  110 G     109  111   85  110
  111 G     110  112   84  111
  112 G     111  113    0  112
  113 U     112  114    0  113
  114 G     113  115    0  114
  115 A     114  116    0  115
  116 A     115  117    0  116
  117 A     116  118    0  117
  118 C     117  119    0  118
  119 G     118  120  137  119
  120 G     119  121  136  120
  121 U     120  122  135  121
  122 G     121  123  134  122
  123 C     122  124  133  123
  124 G     123  125  132  124
  125 G     124  126    0  125
  126 U     125  127    0  126
  127 A     126  128    0  127
  128 A     127  129    0  128
  129 G     128  130    0  129
  130 A     129  131    0  130
  131 G     130  132    0  131
  132 C     131  133  124  132
  133 G     132  134  123  133
  134 C     133  135  122  134
  135 A     134  136  121  135
  136 C     135  137  120  136
  137 C     136  138  119  137
  138 G     137  139  160  138
  139 C     138  140  158  139
  140 G     139  141  157  140
  141 U     140  142  156  141
  142 C     141  143  155  142
  143 C     142  144  154  143
  144 G     143  145  153  144
  145 G     144  146  152  145
  146 G     145  147  151  146
  147 G     146  148    0  147
  148 U     147  149    0  148
  149 G     148  150    0  149
  150 A     149  151    0  150
  151 C     150  152  146  151
  152 U     151  153  145  152
  153 C     152  154  144  153
  154 G     153  155  143  154
  155 G     154  156  142  155
  156 A     155  157  141  156
  157 C     156  158  140  157
  158 G     157  159  139  158
  159 G     158  160    0  159
  160 C     159  161  138  160
  161 U     160  162    0  161
  162 C     161  163    0  162
  163 G     162  164   71  163
  164 G     163  165   70  164
  165 U     164  166   69  165
  166 A     165  167    0  166
  167 A     166  168    0  167
  168 A     167  169   68  168
  169 C     168  170   67  169
  170 C     169  171   63  170
  171 C     170  172   62  171
  172 C     171  173   31  172
  173 G     172  174   30  173
  174 C     173  175   29  174
  175 C     174  176   28  175
  176 U     175  177   27  176
  177 G     176  178   18  177
  178 G     177  179   17  178
  179 A     178  180   16  179
  180 G     179  181   15  180
  181 C     180  182    0  181
  182 A     181  183    0  182
  183 A     182  184    0  183
  184 G     183  185  252  184
  185 A     184  186  251  185
  186 G     185  187  250  186
  187 C     186  188  249  187
  188 C     187  189    0  188
  189 A     188  190    0  189
  190 A     189  191    0  190
  191 U     190  192    0  191
  192 A     191  193    0  192
  193 G     192  194    0  193
  194 G     193  195  243  194
  195 A     194  196  242  195
  196 G     195  197  241  196
  197 C     196  198  240  197
  198 G     197  199  239  198
  199 C     198  200  238  199
  200 G     199  201  219  200
  201 U     200  202  218  201
  202 C     201  203  217  202
  203 C     202  204  216  203
  204 U     203  205  215  204
  205 C     204  206    0  205
  206 G     205  207    0  206
  207 C     206  208  214  207
  208 C     207  209  213  208
  209 G     208  210    0  209
  210 U     209  211    0  210
  211 A     210  212    0  211
  212 C     211  213    0  212
  213 G     212  214  208  213
  214 G     213  215  207  214
  215 A     214  216  204  215
  216 G     215  217  203  216
  217 G     216  218  202  217
  218 A     217  219  201  218
  219 C     218  220  200  219
  220 A     219  221    0  220
  221 G     220  222  235  221
  222 G     221  223  234  222
  223 G     222  224  233  223
  224 A     223  225  232  224
  225 U     224  226  231  225
  226 G     225  227    0  226
  227 G     226  228    0  227
  228 C     227  229    0  228
  229 C     228  230    0  229
  230 C     229  231    0  230
  231 G     230  232  225  231
  232 U     231  233  224  232
  233 C     232  234  223  233
  234 C     233  235  222  234
  235 C     234  236  221  235
  236 A     235  237    0  236
  237 U     236  238    0  237
  238 G     237  239  199  238
  239 C     238  240  198  239
  240 G     239  241  197  240
  241 U     240  242  196  241
  242 U     241  243  195  242
  243 C     242  244  194  243
  244 G     243  245    0  244
  245 G     244  246    0  245
  246 G     245  247    0  246
  247 U     246  248    0  247
  248 U     247  249    0  248
  249 G     248  250  187  249
  250 C     249  251  186  250
  251 U     250  252  185  251
  252 C     251  253  184  252
  253 G     252  254    0  253
  254 C     253  255    0  254
  255 U     254  256    0  255
  256 G     255  257    0  256
  257 A     256  258    0  257
  258 U     257  259    0  258
  259 G     258  260    0  259
  260 A     259  261    0  260
  261 G     260  262  282  261
  262 G     261  263  281  262
  263 C     262  264  280  263
  264 C     263  265  279  264
  265 C     264  266  278  265
  266 C     265  267  277  266
  267 U     266  268  276  267
  268 G     267  269  275  268
  269 G     268  270    0  269
  270 G     269  271    0  270
  271 C     270  272    0  271
  272 A     271  273    0  272
  273 A     272  274    0  273
  274 C     273  275    0  274
  275 C     274  276  268  275
  276 A     275  277  267  276
  277 G     276  278  266  277
  278 G     277  279  265  278
  279 G     278  280  264  279
  280 C     279  281  263  280
  281 C     280  282  262  281
  282 C     281  283  261  282
  283 U     282  284    0  283
  284 U     283  285    0  284
  285 A     284  286    0  285
  286 G     285  287    0  286
  287 A     286  288    0  287
  288 U     287  289    0  288
  289 G     288  290    0  289
  290 A     289  291    0  290
  291 A     290  292    0  291
  292 U     291  293    0  292
  293 G     292  294    0  293
  294 U     293  295    0  294
  295 U     294  296    0  295
  296 C     295  297    0  296
  297 A     296  298    0  297
  298 C     297  299    0  298
  299 C     298  300    0  299
  300 G     299  301  321  300
  301 C     300  302  320  301
  302 C     301  303  319  302
  303 C     302  304  318  303
  304 A     303  305  317  304
  305 U     304  306  316  305
  306 C     305  307  315  306
  307 C     306  308  314  307
  308 C     307  309  313  308
  309 G     308  310    0  309
  310 A     309  311    0  310
  311 A     310  312    0  311
  312 A     311  313    0  312
  313 G     312  314  308  313
  314 G     313  315  307  314
  315 G     314  316  306  315
  316 G     315  317  305  316
  317 U     316  318  304  317
  318 G     317  319  303  318
  319 G     318  320  302  319
  320 G     319  321  301  320
  321 A     320  322  300  321
  322 a     321  323    0  322
  323 c     322  324    0  323
  324 a     323  325    0  324
  325 g     324  326    0  325
  326 a     325  327    0  326
  327 a     326  328    0  327
  328 u     327  329    0  328
  329 c     328  330    0  329
  330 c     329  331    0  330
  331 g     330  332    0  331
  332 g     331  333    0  332
  333 c     332  334    0  333
  334 u     333  335    0  334
  335 u     334  336    0  335
  336 a     335    0    0  336