325 ENERGY = 0 M.luteus RNase P RNA
    1 g       0    2    0    1
    2 a       1    3    0    2
    3 g       2    4    0    3
    4 g       3    5    0    4
    5 a       4    6    0    5
    6 a       5    7    0    6
    7 a       6    8    0    7
    8 g       7    9    0    8
    9 u       8   10    0    9
   10 c       9   11    0   10
   11 c      10   12    0   11
   12 g      11   13    0   12
   13 g      12   14    0   13
   14 g      13   15    0   14
   15 c      14   16  183   15
   16 A      15   17  182   16
   17 C      16   18  181   17
   18 C      17   19  180   18
   19 G      18   20    0   19
   20 C      19   21    0   20
   21 A      20   22    0   21
   22 G      21   23    0   22
   23 A      22   24    0   23
   24 G      23   25    0   24
   25 C      24   26    0   25
   26 A      25   27    0   26
   27 G      26   28  179   27
   28 G      27   29  178   28
   29 A      28   30  177   29
   30 U      29   31  176   30
   31 G      30   32  175   31
   32 G      31   33   46   32
   33 U      32   34   45   33
   34 G      33   35   44   34
   35 G      34   36   43   35
   36 A      35   37   42   36
   37 C      36   38    0   37
   38 A      37   39    0   38
   39 A      38   40    0   39
   40 C      39   41    0   40
   41 A      40   42    0   41
   42 U      41   43   36   42
   43 C      42   44   35   43
   44 C      43   45   34   44
   45 A      44   46   33   45
   46 C      45   47   32   46
   47 C      46   48   61   47
   48 C      47   49   59   48
   49 G      48   50   58   49
   50 G      49   51   57   50
   51 G      50   52   56   51
   52 G      51   53    0   52
   53 C      52   54    0   53
   54 G      53   55    0   54
   55 A      54   56    0   55
   56 C      55   57   51   56
   57 C      56   58   50   57
   58 C      57   59   49   58
   59 G      58   60   48   59
   60 C      59   61    0   60
   61 G      60   62   47   61
   62 G      61   63  174   62
   63 G      62   64  173   63
   64 C      63   65    0   64
   65 C      64   66    0   65
   66 A      65   67    0   66
   67 G      66   68  172   67
   68 U      67   69  171   68
   69 G      68   70  168   69
   70 C      69   71  167   70
   71 C      70   72  166   71
   72 A      71   73    0   72
   73 C      72   74    0   73
   74 A      73   75    0   74
   75 G      74   76    0   75
   76 A      75   77    0   76
   77 G      76   78    0   77
   78 A      77   79    0   78
   79 G      78   80    0   79
   80 A      79   81    0   80
   81 A      80   82    0   81
   82 G      81   83    0   82
   83 A      82   84    0   83
   84 C      83   85  113   84
   85 C      84   86  112   85
   86 G      85   87  109   86
   87 C      86   88  108   87
   88 C      87   89  107   88
   89 U      88   90  106   89
   90 C      89   91  105   90
   91 C      90   92  104   91
   92 G      91   93  103   92
   93 C      92   94  102   93
   94 G      93   95  101   94
   95 C      94   96  100   95
   96 C      95   97    0   96
   97 G      96   98    0   97
   98 C      97   99    0   98
   99 U      98  100    0   99
  100 G      99  101   95  100
  101 C     100  102   94  101
  102 G     101  103   93  102
  103 C     102  104   92  103
  104 G     103  105   91  104
  105 G     104  106   90  105
  106 C     105  107   89  106
  107 G     106  108   88  107
  108 G     107  109   87  108
  109 U     108  110   86  109
  110 A     109  111    0  110
  111 A     110  112    0  111
  112 G     111  113   85  112
  113 G     112  114   84  113
  114 G     113  115    0  114
  115 U     114  116    0  115
  116 G     115  117    0  116
  117 A     116  118    0  117
  118 A     117  119    0  118
  119 A     118  120    0  119
  120 G     119  121    0  120
  121 G     120  122  139  121
  122 G     121  123  138  122
  123 U     122  124  137  123
  124 G     123  125  136  124
  125 G     124  126  135  125
  126 U     125  127  134  126
  127 G     126  128    0  127
  128 U     127  129    0  128
  129 A     128  130    0  129
  130 A     129  131    0  130
  131 G     130  132    0  131
  132 A     131  133    0  132
  133 G     132  134    0  133
  134 A     133  135  126  134
  135 C     134  136  125  135
  136 C     135  137  124  136
  137 A     136  138  123  137
  138 C     137  139  122  138
  139 C     138  140  121  139
  140 A     139  141  164  140
  141 G     140  142  163  141
  142 C     141  143  161  142
  143 G     142  144  160  143
  144 G     143  145  159  144
  145 C     144  146  158  145
  146 C     145  147  157  146
  147 C     146  148  156  147
  148 C     147  149  155  148
  149 G     148  150  154  149
  150 G     149  151    0  150
  151 U     150  152    0  151
  152 G     151  153    0  152
  153 A     152  154    0  153
  154 C     153  155  149  154
  155 G     154  156  148  155
  156 G     155  157  147  156
  157 G     156  158  146  157
  158 G     157  159  145  158
  159 C     158  160  144  159
  160 C     159  161  143  160
  161 G     160  162  142  161
  162 G     161  163    0  162
  163 C     162  164  141  163
  164 U     163  165  140  164
  165 C     164  166    0  165
  166 G     165  167   71  166
  167 G     166  168   70  167
  168 U     167  169   69  168
  169 A     168  170    0  169
  170 A     169  171    0  170
  171 A     170  172   68  171
  172 C     171  173   67  172
  173 C     172  174   63  173
  174 C     173  175   62  174
  175 C     174  176   31  175
  176 A     175  177   30  176
  177 U     176  178   29  177
  178 C     177  179   28  178
  179 C     178  180   27  179
  180 G     179  181   18  180
  181 G     180  182   17  181
  182 U     181  183   16  182
  183 G     182  184   15  183
  184 C     183  185    0  184
  185 A     184  186    0  185
  186 A     185  187    0  186
  187 G     186  188  238  187
  188 G     187  189  237  188
  189 C     188  190  236  189
  190 C     189  191  235  190
  191 G     190  192    0  191
  192 A     191  193    0  192
  193 A     192  194    0  193
  194 C     193  195    0  194
  195 A     194  196    0  195
  196 G     195  197  229  196
  197 G     196  198  228  197
  198 A     197  199  227  198
  199 C     198  200  226  199
  200 G     199  201  225  200
  201 C     200  202  224  201
  202 G     201  203    0  202
  203 U     202  204    0  203
  204 C     203  205    0  204
  205 A     204  206    0  205
  206 C     205  207    0  206
  207 G     206  208  223  207
  208 A     207  209  222  208
  209 G     208  210  221  209
  210 G     209  211  220  210
  211 G     210  212  219  211
  212 C     211  213  218  212
  213 G     212  214    0  213
  214 G     213  215    0  214
  215 C     214  216    0  215
  216 U     215  217    0  216
  217 C     216  218    0  217
  218 G     217  219  212  218
  219 C     218  220  211  219
  220 C     219  221  210  220
  221 C     220  222  209  221
  222 C     221  223  208  222
  223 A     222  224  207  223
  224 G     223  225  201  224
  225 C     224  226  200  225
  226 G     225  227  199  226
  227 U     226  228  198  227
  228 C     227  229  197  228
  229 C     228  230  196  229
  230 G     229  231    0  230
  231 G     230  232    0  231
  232 G     231  233    0  232
  233 U     232  234    0  233
  234 U     233  235    0  234
  235 G     234  236  190  235
  236 G     235  237  189  236
  237 C     236  238  188  237
  238 C     237  239  187  238
  239 G     238  240    0  239
  240 C     239  241    0  240
  241 U     240  242    0  241
  242 C     241  243    0  242
  243 G     242  244    0  243
  244 A     243  245    0  244
  245 G     244  246  264  245
  246 C     245  247  263  246
  247 C     246  248  262  247
  248 C     247  249  261  248
  249 G     248  250  260  249
  250 C     249  251  259  250
  251 C     250  252  258  251
  252 A     251  253  257  252
  253 G     252  254    0  253
  254 C     253  255    0  254
  255 G     254  256    0  255
  256 A     255  257    0  256
  257 U     256  258  252  257
  258 G     257  259  251  258
  259 G     258  260  250  259
  260 C     259  261  249  260
  261 G     260  262  248  261
  262 G     261  263  247  262
  263 G     262  264  246  263
  264 C     263  265  245  264
  265 C     264  266    0  265
  266 C     265  267    0  266
  267 A     266  268    0  267
  268 G     267  269    0  268
  269 A     268  270    0  269
  270 U     269  271    0  270
  271 G     270  272    0  271
  272 G     271  273    0  272
  273 A     272  274    0  273
  274 U     273  275    0  274
  275 G     274  276    0  275
  276 G     275  277    0  276
  277 C     276  278    0  277
  278 C     277  279    0  278
  279 G     278  280    0  279
  280 U     279  281    0  280
  281 C     280  282    0  281
  282 A     281  283  309  282
  283 C     282  284  308  283
  284 C     283  285  307  284
  285 U     284  286  306  285
  286 C     285  287  305  286
  287 G     286  288  304  287
  288 C     287  289  303  288
  289 G     288  290  302  289
  290 C     289  291  301  290
  291 G     290  292  300  291
  292 G     291  293  299  292
  293 G     292  294  298  293
  294 G     293  295    0  294
  295 C     294  296    0  295
  296 A     295  297    0  296
  297 A     296  298    0  297
  298 C     297  299  293  298
  299 G     298  300  292  299
  300 C     299  301  291  300
  301 G     300  302  290  301
  302 C     301  303  289  302
  303 G     302  304  288  303
  304 C     303  305  287  304
  305 G     304  306  286  305
  306 A     305  307  285  306
  307 G     306  308  284  307
  308 G     307  309  283  308
  309 C     308  310  282  309
  310 a     309  311    0  310
  311 c     310  312    0  311
  312 a     311  313    0  312
  313 g     312  314    0  313
  314 a     313  315    0  314
  315 a     314  316    0  315
  316 u     315  317    0  316
  317 c     316  318    0  317
  318 c     317  319    0  318
  319 g     318  320    0  319
  320 g     319  321    0  320
  321 c     320  322    0  321
  322 u     321  323    0  322
  323 u     322  324    0  323
  324 a     323  325    0  324
  325 c     324    0    0  325