342 ENERGY = 0 H.chlorum RNase P RNA
    1 g       0    2    0    1
    2 a       1    3    0    2
    3 g       2    4    0    3
    4 g       3    5    0    4
    5 a       4    6    0    5
    6 a       5    7    0    6
    7 a       6    8    0    7
    8 g       7    9    0    8
    9 u       8   10    0    9
   10 c       9   11    0   10
   11 c      10   12    0   11
   12 g      11   13    0   12
   13 g      12   14    0   13
   14 g      13   15    0   14
   15 c      14   16  204   15
   16 U      15   17  203   16
   17 C      16   18  202   17
   18 G      17   19  201   18
   19 C      18   20  200   19
   20 A      19   21   37   20
   21 C      20   22   36   21
   22 A      21   23   35   22
   23 U      22   24   34   23
   24 C      23   25   33   24
   25 C      24   26   32   25
   26 U      25   27    0   26
   27 G      26   28    0   27
   28 C      27   29    0   28
   29 G      28   30    0   29
   30 A      29   31    0   30
   31 U      30   32    0   31
   32 G      31   33   25   32
   33 G      32   34   24   33
   34 A      33   35   23   34
   35 U      34   36   22   35
   36 G      35   37   21   36
   37 U      36   38   20   37
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   42 U      41   43    0   42
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   44 C      43   45  198   44
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   46 U      45   47  196   46
   47 G      46   48  195   47
   48 C      47   49   65   48
   49 C      48   50   64   49
   50 C      49   51   63   50
   51 G      50   52   62   51
   52 U      51   53   61   52
   53 U      52   54   60   53
   54 C      53   55    0   54
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   56 U      55   57    0   56
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   60 G      59   61   53   60
   61 G      60   62   52   61
   62 C      61   63   51   62
   63 G      62   64   50   63
   64 G      63   65   49   64
   65 G      64   66   48   65
   66 G      65   67   90   66
   67 C      66   68   88   67
   68 A      67   69   87   68
   69 G      68   70   86   69
   70 U      69   71   85   70
   71 C      70   72   84   71
   72 A      71   73   83   72
   73 G      72   74   82   73
   74 C      73   75   81   74
   75 U      74   76   80   75
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   80 A      79   81   75   80
   81 G      80   82   74   81
   82 C      81   83   73   82
   83 A      82   84   72   83
   84 G      83   85   71   84
   85 A      84   86   70   85
   86 U      85   87   69   86
   87 U      86   88   68   87
   88 G      87   89   67   88
   89 A      88   90    0   89
   90 C      89   91   66   90
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   92 G      91   93  193   92
   93 C      92   94    0   93
   94 G      93   95  137   94
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   98 A      97   99    0   98
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  102 C     101  103  128  102
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  110 A     109  111    0  110
  111 G     110  112  121  111
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  115 A     114  116    0  115
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  117 U     116  118    0  117
  118 U     117  119  114  118
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  120 G     119  121  112  120
  121 C     120  122  111  121
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  123 A     122  124    0  123
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  126 G     125  127  104  126
  127 U     126  128  103  127
  128 G     127  129  102  128
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  134 A     133  135    0  134
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  138 U     137  139    0  138
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  142 A     141  143    0  142
  143 G     142  144  192  143
  144 U     143  145  191  144
  145 G     144  146  188  145
  146 G     145  147  187  146
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  158 U     157  159  177  158
  159 C     158  160  176  159
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  161 U     160  162  174  161
  162 C     161  163  173  162
  163 G     162  164  172  163
  164 G     163  165  171  164
  165 G     164  166  170  165
  166 G     165  167    0  166
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  168 A     167  169    0  168
  169 A     168  170    0  169
  170 C     169  171  165  170
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  172 C     171  173  163  172
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  203 A     202  204   16  203
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  210 C     209  211  219  210
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  226 C     225  227  253  226
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  229 G     228  230  250  229
  230 C     229  231  249  230
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  251 C     250  252  228  251
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  263 C     262  264    0  263
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