447 ENERGY = 0 D.radiodurans-g RNase P RNA
    1 G       0    2  443    1
    2 C       1    3  442    2
    3 G       2    4  441    3
    4 G       3    5  440    4
    5 G       4    6  439    5
    6 G       5    7  438    6
    7 A       6    8  437    7
    8 A       7    9  436    8
    9 A       8   10  435    9
   10 C       9   11  434   10
   11 U      10   12  432   11
   12 C      11   13  388   12
   13 C      12   14  387   13
   14 U      13   15  386   14
   15 G      14   16  385   15
   16 G      15   17  384   16
   17 U      16   18  383   17
   18 C      17   19  382   18
   19 G      18   20    0   19
   20 C      19   21   50   20
   21 G      20   22   49   21
   22 C      21   23   48   22
   23 C      22   24   47   23
   24 U      23   25   46   24
   25 G      24   26   45   25
   26 A      25   27    0   26
   27 C      26   28   44   27
   28 C      27   29   43   28
   29 U      28   30   42   29
   30 G      29   31   40   30
   31 C      30   32   39   31
   32 U      31   33   38   32
   33 U      32   34    0   33
   34 U      33   35    0   34
   35 U      34   36    0   35
   36 U      35   37    0   36
   37 C      36   38    0   37
   38 G      37   39   32   38
   39 G      38   40   31   39
   40 C      39   41   30   40
   41 A      40   42    0   41
   42 G      41   43   29   42
   43 G      42   44   28   43
   44 G      43   45   27   44
   45 A      44   46   25   45
   46 A      45   47   24   46
   47 G      46   48   23   47
   48 G      47   49   22   48
   49 U      48   50   21   49
   50 G      49   51   20   50
   51 A      50   52    0   51
   52 G      51   53    0   52
   53 G      52   54    0   53
   54 A      53   55    0   54
   55 A      54   56    0   55
   56 A      55   57    0   56
   57 G      56   58    0   57
   58 U      57   59    0   58
   59 C      58   60    0   59
   60 C      59   61    0   60
   61 G      60   62    0   61
   62 G      61   63    0   62
   63 G      62   64    0   63
   64 C      63   65  289   64
   65 A      64   66  288   65
   66 C      65   67  287   66
   67 C      66   68  286   67
   68 G      67   69    0   68
   69 C      68   70    0   69
   70 A      69   71    0   70
   71 G      70   72    0   71
   72 G      71   73    0   72
   73 G      72   74    0   73
   74 C      73   75    0   74
   75 A      74   76    0   75
   76 A      75   77    0   76
   77 G      76   78  285   77
   78 G      77   79  284   78
   79 A      78   80  283   79
   80 U      79   81  282   80
   81 G      80   82  281   81
   82 C      81   83   96   82
   83 C      82   84   95   83
   84 A      83   85   94   84
   85 G      84   86   93   85
   86 C      85   87   92   86
   87 U      86   88    0   87
   88 A      87   89    0   88
   89 A      88   90    0   89
   90 C      89   91    0   90
   91 G      90   92    0   91
   92 G      91   93   86   92
   93 C      92   94   85   93
   94 U      93   95   84   94
   95 G      94   96   83   95
   96 G      95   97   82   96
   97 U      96   98  154   97
   98 C      97   99  152   98
   99 G      98  100  151   99
  100 G      99  101  150  100
  101 C     100  102  149  101
  102 G     101  103  148  102
  103 A     102  104  146  103
  104 G     103  105  145  104
  105 C     104  106  144  105
  106 C     105  107  143  106
  107 G     106  108  142  107
  108 A     107  109  141  108
  109 G     108  110    0  109
  110 C     109  111  140  110
  111 G     110  112  139  111
  112 U     111  113  138  112
  113 C     112  114  137  113
  114 C     113  115  136  114
  115 G     114  116  135  115
  116 C     115  117  134  116
  117 C     116  118  133  117
  118 U     117  119  132  118
  119 G     118  120  131  119
  120 A     119  121    0  120
  121 G     120  122    0  121
  122 U     121  123    0  122
  123 G     122  124    0  123
  124 C     123  125    0  124
  125 C     124  126    0  125
  126 G     125  127    0  126
  127 C     126  128    0  127
  128 A     127  129    0  128
  129 A     128  130    0  129
  130 G     129  131    0  130
  131 C     130  132  119  131
  132 A     131  133  118  132
  133 G     132  134  117  133
  134 G     133  135  116  134
  135 C     134  136  115  135
  136 G     135  137  114  136
  137 G     136  138  113  137
  138 A     137  139  112  138
  139 A     138  140  111  139
  140 A     139  141  110  140
  141 G     140  142  108  141
  142 C     141  143  107  142
  143 G     142  144  106  143
  144 G     143  145  105  144
  145 C     144  146  104  145
  146 G     145  147  103  146
  147 A     146  148    0  147
  148 A     147  149  102  148
  149 G     148  150  101  149
  150 U     149  151  100  150
  151 C     150  152   99  151
  152 G     151  153   98  152
  153 A     152  154    0  153
  154 A     153  155   97  154
  155 G     154  156  280  155
  156 G     155  157  279  156
  157 A     156  158    0  157
  158 C     157  159    0  158
  159 A     158  160    0  159
  160 G     159  161  278  160
  161 U     160  162  277  161
  162 G     161  163  274  162
  163 C     162  164  273  163
  164 C     163  165  272  164
  165 A     164  166    0  165
  166 C     165  167    0  166
  167 A     166  168    0  167
  168 G     167  169    0  168
  169 A     168  170    0  169
  170 A     169  171    0  170
  171 A     170  172    0  171
  172 C     171  173    0  172
  173 C     172  174    0  173
  174 A     173  175    0  174
  175 G     174  176    0  175
  176 A     175  177    0  176
  177 C     176  178  219  177
  178 C     177  179  218  178
  179 G     178  180  215  179
  180 C     179  181  214  180
  181 C     180  182  213  181
  182 A     181  183  212  182
  183 C     182  184  211  183
  184 C     183  185  210  184
  185 C     184  186  209  185
  186 C     185  187  207  186
  187 A     186  188  206  187
  188 C     187  189  205  188
  189 A     188  190  204  189
  190 C     189  191  203  190
  191 A     190  192  202  191
  192 G     191  193  201  192
  193 G     192  194  200  193
  194 C     193  195  199  194
  195 C     194  196    0  195
  196 C     195  197    0  196
  197 C     196  198    0  197
  198 G     197  199    0  198
  199 G     198  200  194  199
  200 C     199  201  193  200
  201 G     200  202  192  201
  202 C     201  203  191  202
  203 G     202  204  190  203
  204 G     203  205  189  204
  205 G     204  206  188  205
  206 C     205  207  187  206
  207 G     206  208  186  207
  208 C     207  209    0  208
  209 G     208  210  185  209
  210 G     209  211  184  210
  211 G     210  212  183  211
  212 U     211  213  182  212
  213 G     212  214  181  213
  214 G     213  215  180  214
  215 U     214  216  179  215
  216 C     215  217    0  216
  217 A     216  218    0  217
  218 G     217  219  178  218
  219 G     218  220  177  219
  220 G     219  221    0  220
  221 U     220  222    0  221
  222 G     221  223    0  222
  223 A     222  224    0  223
  224 A     223  225    0  224
  225 A     224  226    0  225
  226 C     225  227    0  226
  227 G     226  228  245  227
  228 G     227  229  244  228
  229 U     228  230  243  229
  230 G     229  231  242  230
  231 C     230  232  241  231
  232 G     231  233  240  232
  233 G     232  234    0  233
  234 U     233  235    0  234
  235 A     234  236    0  235
  236 A     235  237    0  236
  237 G     236  238    0  237
  238 A     237  239    0  238
  239 G     238  240    0  239
  240 C     239  241  232  240
  241 G     240  242  231  241
  242 C     241  243  230  242
  243 A     242  244  229  243
  244 C     243  245  228  244
  245 C     244  246  227  245
  246 A     245  247  271  246
  247 G     246  248  270  247
  248 G     247  249  267  248
  249 U     248  250  266  249
  250 U     249  251  265  250
  251 C     250  252  264  251
  252 C     251  253  263  252
  253 C     252  254  262  253
  254 G     253  255  261  254
  255 G     254  256  260  255
  256 G     255  257    0  256
  257 A     256  258    0  257
  258 G     257  259    0  258
  259 A     258  260    0  259
  260 C     259  261  255  260
  261 C     260  262  254  261
  262 G     261  263  253  262
  263 G     262  264  252  263
  264 G     263  265  251  264
  265 A     264  266  250  265
  266 G     265  267  249  266
  267 C     266  268  248  267
  268 G     267  269    0  268
  269 U     268  270    0  269
  270 C     269  271  247  270
  271 U     270  272  246  271
  272 G     271  273  164  272
  273 G     272  274  163  273
  274 U     273  275  162  274
  275 C     274  276    0  275
  276 A     275  277    0  276
  277 A     276  278  161  277
  278 C     277  279  160  278
  279 C     278  280  156  279
  280 C     279  281  155  280
  281 C     280  282   81  281
  282 A     281  283   80  282
  283 U     282  284   79  283
  284 C     283  285   78  284
  285 C     284  286   77  285
  286 G     285  287   67  286
  287 G     286  288   66  287
  288 U     287  289   65  288
  289 G     288  290   64  289
  290 C     289  291    0  290
  291 A     290  292    0  291
  292 A     291  293    0  292
  293 G     292  294  344  293
  294 A     293  295  343  294
  295 C     294  296  342  295
  296 C     295  297  341  296
  297 C     296  298    0  297
  298 G     297  299    0  298
  299 A     298  300    0  299
  300 C     299  301    0  300
  301 A     300  302    0  301
  302 G     301  303    0  302
  303 U     302  304    0  303
  304 G     303  305  334  304
  305 C     304  306  333  305
  306 G     305  307  332  306
  307 G     306  308  331  307
  308 C     307  309  330  308
  309 G     308  310  329  309
  310 A     309  311  328  310
  311 G     310  312  323  311
  312 G     311  313  322  312
  313 G     312  314  321  313
  314 C     313  315  320  314
  315 G     314  316    0  315
  316 G     315  317    0  316
  317 C     316  318    0  317
  318 C     317  319    0  318
  319 C     318  320    0  319
  320 G     319  321  314  320
  321 C     320  322  313  321
  322 C     321  323  312  322
  323 C     322  324  311  323
  324 G     323  325    0  324
  325 U     324  326    0  325
  326 U     325  327    0  326
  327 U     326  328    0  327
  328 G     327  329  310  328
  329 A     328  330  309  329
  330 G     329  331  308  330
  331 C     330  332  307  331
  332 C     331  333  306  332
  333 G     332  334  305  333
  334 C     333  335  304  334
  335 C     334  336    0  335
  336 A     335  337    0  336
  337 G     336  338    0  337
  338 G     337  339    0  338
  339 A     338  340    0  339
  340 U     339  341    0  340
  341 G     340  342  296  341
  342 G     341  343  295  342
  343 U     342  344  294  343
  344 C     343  345  293  344
  345 G     344  346    0  345
  346 C     345  347    0  346
  347 U     346  348    0  347
  348 U     347  349    0  348
  349 G     348  350    0  349
  350 A     349  351    0  350
  351 G     350  352  371  351
  352 G     351  353  370  352
  353 C     352  354  369  353
  354 G     353  355  368  354
  355 U     354  356  367  355
  356 C     355  357    0  356
  357 C     356  358  366  357
  358 U     357  359  365  358
  359 G     358  360  364  359
  360 G     359  361    0  360
  361 C     360  362    0  361
  362 A     361  363    0  362
  363 A     362  364    0  363
  364 C     363  365  359  364
  365 A     364  366  358  365
  366 G     365  367  357  366
  367 G     366  368  355  367
  368 C     367  369  354  368
  369 G     368  370  353  369
  370 U     369  371  352  370
  371 C     370  372  351  371
  372 C     371  373    0  372
  373 C     372  374    0  373
  374 A     373  375    0  374
  375 G     374  376    0  375
  376 A     375  377    0  376
  377 C     376  378    0  377
  378 A     377  379    0  378
  379 G     378  380    0  379
  380 A     379  381    0  380
  381 U     380  382    0  381
  382 G     381  383   18  382
  383 A     382  384   17  383
  384 U     383  385   16  384
  385 C     384  386   15  385
  386 A     385  387   14  386
  387 G     386  388   13  387
  388 G     387  389   12  388
  389 C     388  390  416  389
  390 U     389  391  415  390
  391 G     390  392  414  391
  392 C     391  393  413  392
  393 C     392  394  412  393
  394 C     393  395  411  394
  395 C     394  396  410  395
  396 A     395  397  409  396
  397 G     396  398  408  397
  398 G     397  399  407  398
  399 G     398  400  406  399
  400 C     399  401    0  400
  401 C     400  402    0  401
  402 A     401  403    0  402
  403 A     402  404    0  403
  404 C     403  405    0  404
  405 C     404  406    0  405
  406 C     405  407  399  406
  407 U     406  408  398  407
  408 C     407  409  397  408
  409 U     408  410  396  409
  410 G     409  411  395  410
  411 G     410  412  394  411
  412 G     411  413  393  412
  413 G     412  414  392  413
  414 C     413  415  391  414
  415 A     414  416  390  415
  416 G     415  417  389  416
  417 A     416  418    0  417
  418 C     417  419    0  418
  419 A     418  420    0  419
  420 G     419  421    0  420
  421 A     420  422    0  421
  422 A     421  423    0  422
  423 C     422  424    0  423
  424 C     423  425    0  424
  425 C     424  426    0  425
  426 G     425  427    0  426
  427 G     426  428    0  427
  428 C     427  429    0  428
  429 U     428  430    0  429
  430 U     429  431    0  430
  431 A     430  432    0  431
  432 C     431  433   11  432
  433 C     432  434    0  433
  434 G     433  435   10  434
  435 U     434  436    9  435
  436 U     435  437    8  436
  437 U     436  438    7  437
  438 C     437  439    6  438
  439 C     438  440    5  439
  440 C     439  441    4  440
  441 C     440  442    3  441
  442 G     441  443    2  442
  443 U     442  444    1  443
  444 G     443  445    0  444
  445 C     444  446    0  445
  446 C     445  447    0  446
  447 A     446    0    0  447