408 ENERGY = 0 C.trachomatis RNase P RNA
    1 U       0    2    0    1
    2 C       1    3  403    2
    3 G       2    4  402    3
    4 G       3    5  401    4
    5 A       4    6  400    5
    6 A       5    7  399    6
    7 G       6    8  398    7
    8 A       7    9  397    8
    9 G       8   10  396    9
   10 U       9   11  395   10
   11 A      10   12  394   11
   12 A      11   13  392   12
   13 G      12   14  345   13
   14 G      13   15  344   14
   15 C      14   16  343   15
   16 A      15   17  342   16
   17 A      16   18  341   17
   18 C      17   19  340   18
   19 C      18   20  339   19
   20 G      19   21    0   20
   21 C      20   22   54   21
   22 U      21   23   53   22
   23 G      22   24   52   23
   24 A      23   25   51   24
   25 A      24   26   50   25
   26 A      25   27   49   26
   27 C      26   28   48   27
   28 C      27   29   46   28
   29 A      28   30   45   29
   30 G      29   31   44   30
   31 C      30   32   43   31
   32 U      31   33   42   32
   33 U      32   34   41   33
   34 U      33   35   40   34
   35 U      34   36   39   35
   36 U      35   37    0   36
   37 A      36   38    0   37
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   39 A      38   40   35   39
   40 A      39   41   34   40
   41 A      40   42   33   41
   42 A      41   43   32   42
   43 G      42   44   31   43
   44 A      43   45   30   44
   45 U      44   46   29   45
   46 G      45   47   28   46
   47 A      46   48    0   47
   48 G      47   49   27   48
   49 U      48   50   26   49
   50 A      49   51   25   50
   51 C      50   52   24   51
   52 C      51   53   23   52
   53 A      52   54   22   53
   54 G      53   55   21   54
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   60 A      59   61    0   60
   61 G      60   62    0   61
   62 U      61   63    0   62
   63 C      62   64    0   63
   64 C      63   65    0   64
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   66 G      65   67    0   66
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   68 C      67   69  235   68
   69 U      68   70  234   69
   70 U      69   71  233   70
   71 U      70   72  232   71
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   73 U      72   74    0   73
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   81 G      80   82  230   81
   82 A      81   83  229   82
   83 U      82   84  228   83
   84 G      83   85  227   84
   85 C      84   86   99   85
   86 U      85   87   98   86
   87 G      86   88   97   87
   88 G      87   89   96   88
   89 A      88   90   95   89
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   98 A      97   99   86   98
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  102 G     101  103  111  102
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  110 G     109  111  103  110
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  116 G     115  117  225  116
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  120 G     119  121  224  120
  121 U     120  122  223  121
  122 G     121  123  220  122
  123 C     122  124  219  123
  124 A     123  125  218  124
  125 A     124  126    0  125
  126 C     125  127    0  126
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  139 G     138  140  162  139
  140 C     139  141  161  140
  141 U     140  142  160  141
  142 A     141  143  159  142
  143 U     142  144  158  143
  144 A     143  145  157  144
  145 A     144  146  156  145
  146 A     145  147  155  146
  147 U     146  148  154  147
  148 U     147  149  153  148
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  156 U     155  157  145  156
  157 U     156  158  144  157
  158 A     157  159  143  158
  159 U     158  160  142  159
  160 A     159  161  141  160
  161 G     160  162  140  161
  162 A     161  163  139  162
  163 C     162  164    0  163
  164 A     163  165    0  164
  165 G     164  166  138  165
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  167 C     166  168    0  167
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  169 G     168  170    0  169
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  176 C     175  177  192  176
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  223 A     222  224  121  223
  224 C     223  225  120  224
  225 C     224  226  116  225
  226 C     225  227  115  226
  227 C     226  228   84  227
  228 A     227  229   83  228
  229 U     228  230   82  229
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  232 G     231  233   71  232
  233 A     232  234   70  233
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  262 A     261  263  253  262
  263 A     262  264  252  263
  264 A     263  265  251  264
  265 C     264  266    0  265
  266 A     265  267  285  266
  267 A     266  268  284  267
  268 C     267  269  283  268
  269 C     268  270  282  269
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