340 ENERGY = 0 C.difficile RNase P RNA
    1 A       0    2    0    1
    2 A       1    3    0    2
    3 U       2    4    0    3
    4 A       3    5    0    4
    5 U       4    6    0    5
    6 U       5    7  336    6
    7 A       6    8  335    7
    8 A       7    9  334    8
    9 G       8   10  333    9
   10 U       9   11  332   10
   11 A      10   12  331   11
   12 A      11   13  330   12
   13 G      12   14  329   13
   14 C      13   15  328   14
   15 C      14   16  327   15
   16 A      15   17  325   16
   17 G      16   18  305   17
   18 A      17   19  304   18
   19 U      18   20  303   19
   20 A      19   21  302   20
   21 A      20   22  301   21
   22 U      21   23  300   22
   23 C      22   24  299   23
   24 G      23   25    0   24
   25 C      24   26   40   25
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   27 U      26   28   38   27
   28 G      27   29   37   28
   29 U      28   30   36   29
   30 A      29   31   35   30
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   32 U      31   33    0   32
   33 C      32   34    0   33
   34 U      33   35    0   34
   35 U      34   36   30   35
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   37 C      36   38   28   37
   38 A      37   39   27   38
   39 U      38   40   26   39
   40 G      39   41   25   40
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   56 C      55   57  207   56
   57 C      56   58  206   57
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   62 A      61   63    0   62
   63 G      62   64    0   63
   64 C      63   65    0   64
   65 A      64   66    0   65
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   67 G      66   68  204   67
   68 G      67   69  203   68
   69 U      68   70  202   69
   70 G      69   71  201   70
   71 C      70   72   85   71
   72 U      71   73   84   72
   73 A      72   74   83   73
   74 G      73   75   82   74
   75 G      74   76   81   75
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   80 G      79   81    0   80
   81 C      80   82   75   81
   82 C      81   83   74   82
   83 U      82   84   73   83
   84 A      83   85   72   84
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   86 U      85   87  100   86
   87 g      86   88   98   87
   88 G      87   89   97   88
   89 G      88   90   96   89
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  102 G     101  103  199  102
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  107 u     106  108  197  107
  108 G     107  109  194  108
  109 C     108  110  193  109
  110 A     109  111  192  110
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  122 C     121  123  141  122
  123 C     122  124  140  123
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  125 C     124  126  136  125
  126 C     125  127  135  126
  127 A     126  128  134  127
  128 C     127  129  133  128
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  132 U     131  133    0  132
  133 G     132  134  128  133
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  150 G     149  151  166  150
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  167 C     166  168  149  167
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  170 C     169  171  187  170
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  200 C     199  201  101  200
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  224 G     223  225  253  224
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  262 C     261  263  213  262
  263 G     262  264    0  263
  264 C     263  265    0  264
  265 U     264  266    0  265
  266 U     265  267    0  266
  267 G     266  268    0  267
  268 A     267  269    0  268
  269 G     268  270  288  269
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  281 C     280  282  276  281
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