412 ENERGY = 0 B.halodurans RNase P RNA
    1 A       0    2    0    1
    2 U       1    3    0    2
    3 C       2    4    0    3
    4 A       3    5  408    4
    5 U       4    6  407    5
    6 A       5    7  406    6
    7 A       6    8  405    7
    8 C       7    9  404    8
    9 C       8   10  403    9
   10 G       9   11  402   10
   11 U      10   12  401   11
   12 U      11   13  400   12
   13 C      12   14  399   13
   14 A      13   15  397   14
   15 G      14   16  341   15
   16 G      15   17  340   16
   17 U      16   18  339   17
   18 A      17   19  338   18
   19 A      18   20  337   19
   20 C      19   21  336   20
   21 C      20   22  335   21
   22 G      21   23    0   22
   23 C      22   24   42   23
   24 U      23   25   41   24
   25 G      24   26   40   25
   26 C      25   27   39   26
   27 A      26   28   38   27
   28 U      27   29   37   28
   29 C      28   30   36   29
   30 G      29   31   35   30
   31 C      30   32    0   31
   32 A      31   33    0   32
   33 U      32   34    0   33
   34 G      33   35    0   34
   35 C      34   36   30   35
   36 G      35   37   29   36
   37 A      36   38   28   37
   38 U      37   39   27   38
   39 G      38   40   26   39
   40 U      39   41   25   40
   41 A      40   42   24   41
   42 G      41   43   23   42
   43 A      42   44    0   43
   44 G      43   45    0   44
   45 G      44   46    0   45
   46 A      45   47    0   46
   47 A      46   48    0   47
   48 A      47   49    0   48
   49 G      48   50    0   49
   50 U      49   51    0   50
   51 C      50   52    0   51
   52 C      51   53    0   52
   53 A      52   54    0   53
   54 U      53   55    0   54
   55 G      54   56    0   55
   56 C      55   57  254   56
   57 U      56   58  253   57
   58 C      57   59  252   58
   59 G      58   60  251   59
   60 C      59   61  250   60
   61 A      60   62   78   61
   62 C      61   63   77   62
   63 A      62   64   76   63
   64 G      63   65   75   64
   65 G      64   66   74   65
   66 C      65   67   73   66
   67 U      66   68    0   67
   68 G      67   69    0   68
   69 A      68   70    0   69
   70 G      69   71    0   70
   71 A      70   72    0   71
   72 U      71   73    0   72
   73 G      72   74   66   73
   74 C      73   75   65   74
   75 U      74   76   64   75
   76 U      75   77   63   76
   77 G      76   78   62   77
   78 U      77   79   61   78
   79 A      78   80    0   79
   80 G      79   81    0   80
   81 U      80   82    0   81
   82 G      81   83    0   82
   83 U      82   84    0   83
   84 U      83   85  249   84
   85 C      84   86  248   85
   86 G      85   87  247   86
   87 U      86   88  246   87
   88 G      87   89  245   88
   89 C      88   90  110   89
   90 C      89   91  109   90
   91 U      90   92  108   91
   92 A      91   93  107   92
   93 G      92   94  106   93
   94 C      93   95  105   94
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   96 A      95   97    0   96
   97 A      96   98    0   97
   98 G      97   99    0   98
   99 U      98  100    0   99
  100 C      99  101    0  100
  101 A     100  102    0  101
  102 U     101  103    0  102
  103 A     102  104    0  103
  104 A     103  105    0  104
  105 G     104  106   94  105
  106 C     105  107   93  106
  107 U     106  108   92  107
  108 A     107  109   91  108
  109 G     108  110   90  109
  110 G     109  111   89  110
  111 G     110  112  138  111
  112 U     111  113  136  112
  113 A     112  114  135  113
  114 G     113  115  134  114
  115 U     114  116  133  115
  116 C     115  117  132  116
  117 U     116  118  131  117
  118 G     117  119  130  118
  119 G     118  120  129  119
  120 U     119  121  128  120
  121 U     120  122  127  121
  122 C     121  123    0  122
  123 U     122  124    0  123
  124 U     123  125    0  124
  125 A     124  126    0  125
  126 G     125  127    0  126
  127 A     126  128  121  127
  128 A     127  129  120  128
  129 C     128  130  119  129
  130 U     129  131  118  130
  131 G     130  132  117  131
  132 G     131  133  116  132
  133 G     132  134  115  133
  134 C     133  135  114  134
  135 U     134  136  113  135
  136 A     135  137  112  136
  137 A     136  138    0  137
  138 C     137  139  111  138
  139 G     138  140  244  139
  140 G     139  141  243  140
  141 C     140  142    0  141
  142 A     141  143  184  142
  143 A     142  144  183  143
  144 G     143  145  182  144
  145 G     144  146  181  145
  146 U     145  147    0  146
  147 A     146  148    0  147
  148 A     147  149    0  148
  149 G     148  150    0  149
  150 C     149  151  175  150
  151 A     150  152  174  151
  152 C     151  153  173  152
  153 C     152  154  172  153
  154 U     153  155    0  154
  155 A     154  156    0  155
  156 C     155  157    0  156
  157 G     156  158  169  157
  158 U     157  159  168  158
  159 U     158  160  167  159
  160 C     159  161  166  160
  161 A     160  162    0  161
  162 U     161  163    0  162
  163 C     162  164    0  163
  164 A     163  165    0  164
  165 U     164  166    0  165
  166 G     165  167  160  166
  167 A     166  168  159  167
  168 A     167  169  158  168
  169 U     168  170  157  169
  170 A     169  171    0  170
  171 U     170  172    0  171
  172 G     171  173  153  172
  173 G     172  174  152  173
  174 U     173  175  151  174
  175 G     174  176  150  175
  176 U     175  177    0  176
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  180 G     179  181    0  180
  181 C     180  182  145  181
  182 C     181  183  144  182
  183 U     182  184  143  183
  184 U     183  185  142  184
  185 U     184  186    0  185
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  189 A     188  190    0  189
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  193 C     192  194  237  193
  194 C     193  195  236  194
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  196 C     195  197    0  196
  197 A     196  198    0  197
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  200 G     199  201    0  200
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  202 C     201  203    0  202
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  209 C     208  210  224  209
  210 G     209  211  223  210
  211 U     210  212  222  211
  212 U     211  213  221  212
  213 U     212  214  220  213
  214 G     213  215  219  214
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  221 G     220  222  212  221
  222 A     221  223  211  222
  223 C     222  224  210  223
  224 G     223  225  209  224
  225 G     224  226  208  225
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  232 A     231  233    0  232
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  242 C     241  243  190  242
  243 C     242  244  140  243
  244 C     243  245  139  244
  245 C     244  246   88  245
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  247 C     246  248   86  247
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  250 G     249  251   60  250
  251 C     250  252   59  251
  252 G     251  253   58  252
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  260 C     259  261  272  260
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  263 A     262  264    0  263
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