243 ENERGY = 0 B.bronchiseptica RNase P RNA
    1 A       0    2    0    1
    2 G       1    3    0    2
    3 G       2    4    0    3
    4 G       3    5    0    4
    5 C       4    6    0    5
    6 A       5    7    0    6
    7 G       6    8    0    7
    8 A       7    9    0    8
    9 U       8   10    0    9
   10 C       9   11    0   10
   11 G      10   12    0   11
   12 G      11   13    0   12
   13 G      12   14    0   13
   14 C      13   15    0   14
   15 A      14   16    0   15
   16 A      15   17    0   16
   17 U      16   18    0   17
   18 C      17   19    0   18
   19 G      18   20    0   19
   20 C      19   21   39   20
   21 G      20   22   38   21
   22 G      21   23   37   22
   23 G      22   24   36   23
   24 G      23   25   35   24
   25 G      24   26   34   25
   26 A      25   27   33   26
   27 U      26   28   32   27
   28 G      27   29    0   28
   29 C      28   30    0   29
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   31 A      30   32    0   31
   32 A      31   33   27   32
   33 U      32   34   26   33
   34 C      33   35   25   34
   35 C      34   36   24   35
   36 U      35   37   23   36
   37 U      36   38   22   37
   38 C      37   39   21   38
   39 G      38   40   20   39
   40 A      39   41    0   40
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   71 C      70   72   83   71
   72 G      71   73   82   72
   73 G      72   74   81   73
   74 C      73   75   80   74
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   80 G      79   81   74   80
   81 C      80   82   73   81
   82 C      81   83   72   82
   83 G      82   84   71   83
   84 U      83   85   70   84
   85 C      84   86  123   85
   86 C      85   87  121   86
   87 G      86   88  120   87
   88 G      87   89  119   88
   89 C      88   90  118   89
   90 G      89   91  117   90
   91 A      90   92  116   91
   92 C      91   93  115   92
   93 G      92   94  114   93
   94 C      93   95  113   94
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   97 G      96   98  110   97
   98 C      97   99  109   98
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  100 G      99  101  107  100
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  107 C     106  108  100  107
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  109 G     108  110   98  109
  110 C     109  111   97  110
  111 C     110  112   96  111
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  113 G     112  114   94  113
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  115 A     114  116   92  115
  116 A     115  117   91  116
  117 A     116  118   90  117
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  119 C     118  120   88  119
  120 C     119  121   87  120
  121 G     120  122   86  121
  122 A     121  123    0  122
  123 G     122  124   85  123
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  126 A     125  127    0  126
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  130 G     129  131  242  130
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  132 C     131  133  238  132
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  143 A     142  144    0  143
  144 G     143  145    0  144
  145 U     144  146  227  145
  146 C     145  147  226  146
  147 U     146  148  225  147
  148 G     147  149  224  148
  149 U     148  150  223  149
  150 C     149  151  222  150
  151 A     150  152  221  151
  152 U     151  153  220  152
  153 G     152  154  219  153
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  155 G     154  156  173  155
  156 G     155  157  172  156
  157 G     156  158  171  157
  158 C     157  159  170  158
  159 G     158  160  169  159
  160 C     159  161  168  160
  161 G     160  162  167  161
  162 C     161  163  166  162
  163 C     162  164    0  163
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  169 C     168  170  159  169
  170 G     169  171  158  170
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  202 C     201  203  211  202
  203 C     202  204  210  203
  204 G     203  205  209  204
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  213 C     212  214  200  213
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  215 G     214  216  198  215
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  227 G     226  228  145  227
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  243 C     242    0  129  243